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文檔簡介
1、目的:分析一未攜帶原發(fā)突變且僅有男性患者的Leber遺傳性視神經(jīng)病變家系的臨床表型、遺傳特征,檢測其突變基因,探討是否與X染色體有關(guān)。
方法:收集河南安陽一僅有男性患者且臨床診斷為LHON家系的臨床資料,分析遺傳特征;用Primer5設(shè)計線粒體引物,PCR(polymerase chain reaction)測序重新檢測該家系是否攜帶3個原發(fā)突變。對先證者線粒體基因(mitochondrialDNA,mtDNA)全測序,將
2、測序結(jié)果與修正的mtDNA劍橋標(biāo)準(zhǔn)序列比對,確定該家系的突變位點,然后在專業(yè)遺傳學(xué)網(wǎng)站上查找這些突變位點的相關(guān)信息,必要時進(jìn)行對照人群mtDNA測序分析,以確定致病突變;在ABI PRISM()Linkage Mapping Set Version2.5試劑盒中挑選可以覆蓋整條X染色體的18個微衛(wèi)星熒光標(biāo)記對家系內(nèi)成員進(jìn)行X染色體掃描,Genotyper3.7軟件進(jìn)行基因分型,Linkage和Merlin1.1.2軟件進(jìn)行連鎖分析,初步
3、定位可能存在X連鎖修飾基因的區(qū)域,進(jìn)一步進(jìn)行精細(xì)掃描和定位,最后利用Cyrillie軟件構(gòu)建單倍體型圖,確定是否存在X染色體連鎖修飾基因。
結(jié)果:此家系符合母系遺傳特征,30位母系成員中6人發(fā)病,且全部為男性,表現(xiàn)出低外顯率和男性患病偏倚的特點。重新測序發(fā)現(xiàn)該家系未攜帶3個原發(fā)突變。先證者mtDNA全測序結(jié)果發(fā)現(xiàn)31個同質(zhì)突變位點,其中包括1個已報道的致病突變位點G3635A和2個未報道過的突變點 ND4 T11809C與
4、ND5A12340G。T11809C為無義突變,A12340G為錯義突變,剩余28個突變點均為已報道過的線粒體多態(tài),該先證者屬于線粒體單倍體型F1。MtDNA測序所有其它母系成員均同時攜帶G3635A和A12340G突變。107位正常家系外對照中不存在G3635A和A12340G突變。連鎖分析在DXS1060得到最大兩點LOD值1.46(θ=0.0),但是兩點非參數(shù)分析和多點非參數(shù)分析結(jié)果顯示所有標(biāo)記p>0.05,單倍體型分析圖未發(fā)現(xiàn)共
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