簡介：湘潭大學(xué)碩士學(xué)位論文晶體學(xué)對稱群的代數(shù)基礎(chǔ)及其應(yīng)用姓名葉笑蓉申請學(xué)位級別碩士專業(yè)凝聚態(tài)物理指導(dǎo)教師楊奇斌曹佑安20010401們證明了張量T對應(yīng)于僅有的4個數(shù)學(xué)等價類五，瓦，L，L，和兩個幾何等價類瓦和L。將五和L代入普適方程，我們得到兩個極大有限群，其階分別為48和24，最后，我們利用群論的基本知識得到了與這兩個極大有限群相對應(yīng)的子群網(wǎng)，并且發(fā)現(xiàn)3維空間的子群共32個。我們介紹了一種叫做生成元方法的新方法，能夠迅速得到三維空間的點群的子群網(wǎng)，而且也能一一得到對應(yīng)的230個空間群。使用這種生成元作為基本數(shù)據(jù)，我們編寫了一個計算230個空間群的等效點的程序，能夠供人方便地查閱。關(guān)鍵詞對稱操作，正定二次型，晶體對稱群

簡介：南開大學(xué)碩士學(xué)位論文高爾基體相關(guān)堆疊蛋白的PDZ結(jié)構(gòu)域的初步晶體學(xué)結(jié)構(gòu)研究姓名崔嚴方申請學(xué)位級別碩士專業(yè)生物學(xué)；生物化學(xué)與分子生物學(xué)指導(dǎo)教師劉新奇201105ABSTRACTABSTRACTGOLGIREASSEMBLYSTACKINGPROTEIN5565AREHOMOLOGOUSPROTEINBELONGINGTOONEFAMILYWHICHALEDIFFERENTIALLYLOCALIZEDTOMEDIALANDCISGOLGICISTERNAE，RESPECTIVELYBOTHOFTHEMPLAYESSENTIALROLESINGOLGICISTEMALSTACKINGINDIFFERENTGOLGICISTERNAEGOLGIISAVERYIMPORTANTORGANDIEMATSERVES勰APLACEFORPROTEINSMODIFYING，SORTING，PROCESSINGANDTRANSPORTINGFORMATIONOFSTACKSISTHOUGHTTOBECRUCIALINFACILITATINGTHEACCURATELOCALIZATIONANDFUNCTIONOFENZYMESACCORDINGTOLITERATURESPUBLISHED，THEREAREMANYIMPORTANTCOMPONENTSINVOLVEDINFORMINGGOLGISTACKSONEGROUPINCLUDESTHEPROTEINSTHATREASSEMBLESACLIKEVESICLESAFTERMITOSIS，SUCH勰NSFP115，ETC；ANOTHERGROUPISTHEPROTEINSGRASP55GRASP65WHICHCONTRIBUTETOTHESTACKINGOFGOLGINSFACTSBYTETHERINGOFGIANTINP115一GML30TEASSEMBLETHESACLIKEVESICLES，BUTTHEDETAILEDFUNCTIONOFGRASP55GRASP65INGOLGISTACKINGISSTILLUNCLEARINTHEEXPERIMENTS，GRASP55GRASP65WEREDEGRADEDTOFRAGMENTSOFNTERMINUSBOTHPROTEINSOWNTWOTANDEMPDZDOMAINSONNTERMINUSBYPROTEINSECONDARYSTRUCTUREPREDICTIONWHICHARESUPPOSEDTOPLAYROLESINPROTEINPROTEININTERACTIONTHENATIVECRYSTALSOFNTERMINALPDZDOMAINSOFGRASP55TERMEDGRASP55NWERESUCCESSFULLYOBTAINEDANDSATISFACTORYDATASETWERECOLLECTEDUNFORTUNATELYDUETOONLYTWOMETHIONINESAREAVAILABLEINNATURALSEQUENCEOFGRASP55N，THEANOMALOUSSIGNALOFSELENOMETHIONINEDERIVEDCRYSTALSFAILEDTOELUCIDATEADEFINITEELECTRONDENSITYMAPFORMODELBUILDINGTOINCREASETHEANOMALOUSSIGNAL，WEDIDPOINTMUTATIONSTOINCREASETHENUMBEROFMETHIONEINGRASP55NWEUSEDPROTEINCRYSTALLOGRAPHICMETHODTOSTUDYGRASP55GRASP65THEMAINPURPOSEISTOGETTHESTRUCTUREOFPDZDOMAINTEVEALTHECORRESPONDINGPDZDOMAINSSTRUCTURALCHARACTERISTICS，ANDFINDTHEDIFFERENCESOFFUNCTIONBETWEENTHEMTOPROVIDEIMPORTANTINFORMATIONFORGOLGICISTEMALSTACKINGII

簡介：中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)博士學(xué)位論界面擴散受限生長條件下晶體生長形態(tài)學(xué)研究作者姓名學(xué)科專業(yè)導(dǎo)師I姓名寸，LJX工下J完成時間兀J％Q’JI口J張建無機化學(xué)張忠平研究員二O一二年四月文中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)學(xué)位論文原創(chuàng)性聲明本人聲明所呈交的學(xué)位論文，是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進行研究工作所取得的成果。除已特別加以標(biāo)注和致謝的地方外，論文中不包含任何他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果。與我一同工作的同志對本研究所做的貢獻均已在論文中作了明確的說明。作者簽名雌一簽字日期嘩攝墨霹N中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)學(xué)位論文授權(quán)使用聲明作為申請學(xué)位的條件之一，學(xué)位論文著作權(quán)擁有者授權(quán)中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)擁有學(xué)位論文的部分使用權(quán)，即學(xué)校有權(quán)按有關(guān)規(guī)定向國家有關(guān)部門或機構(gòu)送交論文的復(fù)印件和電子版，允許論文被查閱和借閱，可以將學(xué)位論文編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進行檢索，可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文。本人提交的電子文檔的內(nèi)容和紙質(zhì)論文的內(nèi)容相一致。保密的學(xué)位論文在解密后也遵守此規(guī)定。口公開口保密年作者簽名凇盤簽字日期皇如喜占耳止導(dǎo)師簽名簽字日期

簡介：南開大學(xué)博士學(xué)位論文內(nèi)質(zhì)網(wǎng)體內(nèi)FKBP23與BIP結(jié)構(gòu)域相互作用位點及FKBP23的X射線晶體學(xué)研究姓名馮淼申請學(xué)位級別博士專業(yè)化學(xué)；高分子化學(xué)與物理指導(dǎo)教師宓懷風(fēng)201105ABSTRACT’’一ABSTRACTTHISDISSERTATIONISCOMPOSEDOFTWOPANSTHEFIRSTPARTINVESTIGATEDTHEINTERACTIONSITESOFMOUSEIMMUNOPHILINFKBP23ANDBIP，AMAJORCHAPERONEINTHEENDOPLASMICRETICULUMTHESECONDPARTOFTHEDISSERTATIONFOCUSEDONTHEPURIFICATIONANDCRYSTALLIZATIONOFFKBP23ANDTHERESOLUTIONOFTHECRYSTALSTRUCTURESOFFOURMET2L1COORDINATIONCOMPOUNDSFORTHESCREENINGOFPOTENTIALANTICALLCERDRUGSFK506一BINDINGPROTEINSFKBPSARECELLULARRECEPTORSFORTHEIMMUNOSUPPRESSANTFK506ANDANTICANCERAGENTRAPAMYEINTHEYBELONGTOTHEUBIQUITOUSPEPTIDYLPROLYLCIS／TRANSISOMCRASESPPIASESFAMILYWHICHCANCATALYZETHECIS／TRANSISOMERIZATIONOFPEPTIDYLPROLYLBONDINPEPTIDESANDPROTEINSFKBP23ISANERRESIDENTPPIASECOMPRISINGANNTERMINALPPIASEDOMAINANDACTERMINALDOMAINWITHTWOCALCIUMBINDINGEFHANDMOTIFSASTHEMAJORHSP70MOLECULARCHAPERONEINMEERBIPISINVOLVEDINALLKNOWNCELLULARPROCESSES，INCLUDINGPROTEINBIOGENESIS，SIGNALTRANSDUCTIONANDCALCIUMHOMEOSTASISINTHEFIRSTPART，F(xiàn)KBP23WASDEMONSTRATEDTOMEDIATEFUNCTIONSOFBIPBVCATALYZINGTHEPRO兒’CIA／TRANSEONFORMATIONALINTERCONVERSIONINTHEATP懿EDOMAIMOFBIETHISISTHEFIRSTTIMETHATTHEPPIASEACTIVITYONPEPTIDESWASCOMBINEDWITHTHATONTHEFULLLENGTHSUBSTRATEPROTEINSFKBP23，ACALCIUMBINDINGCHAPERONE，ACTSASATRIGGERFACTORINREGULATINGTHEATPASEACTIVITYOFBIETHISREGULATORYMECHANISMISCOMPLETELYDIFFERENTFROMALLOFTHEWELLKNOWNREGULATORYSYSTEMSTHISRESULTMAYPROVIDENEWUNDERSTANDINGTOTHENOVELROLEOFPPIASEASAMOLECULARSWITCHTHESHORTPEPTIDESCONTAININGTHEBINDINGSITESINTHECTERMINALDOMAINSOFFKBP23ANDBIPWERESEPARATEDBYRPHPLCFROMTHEPROTEOLYSISPRODUCTSOFTHECHEMICALLYCROSS1INKEDPRODUCTSOFTHETWOPROTEINSTHEWORKREPORTEDINTHESECONDPARTOFTHISTHESISWASACOOPERATIVEPROJECTWITHTHEGROUPOFCOMPUTERAIDEDDRUGDESIGN，DEPARTMENTOFPROTEINSCIENCEANDTRANSLATIONALRESEARCH，WUXIAPPTECSHANGHAICO，LTDPRELIMINARYSCREENINGANDOPTIMIZATIONOFTHECRYSTALLIZATIONCONDITIONOFFKBP23WASPERFORMEDANDTHECRYSTALSOBTAINEDWEREPICKEDFORPRELIMINARYXRAYDIFFRACTIONBESIDES，THECRYSTALSOFFOURMETALCOORDINATIONCOMPOUNDSRELATEDTOTHESCREENINGOFPOTENTIALANTICANCERDRUGSWEREPREPAREDANDCHARACTERIZEDBYXRAYDIFFRACTIONKEYWORDSPEPTIDYLPROLYLEIS／TRANSISOMERASES；FK506BINDINGPROTEIN23；TI

簡介：目的肺炎鏈球菌STREPTOCOCCUSPNEUMONIAE，SPN是人類主要致病菌，在臨床上廣泛引起中耳炎、敗血癥、腦膜炎及致死性肺炎等多種疾病。全球每年大約有160萬人死于肺炎鏈球菌引起的各種疾患。盡管抗生素治療是控制肺炎鏈球菌感染的有效手段，但并不能有效降低肺炎鏈球菌感染最初48小時的死亡率。隨著抗生素的濫用，臨床上耐藥菌株明顯增加。因此，通過接種肺炎鏈球菌疫苗以預(yù)防其感染成為積極有效的手段。新一代的蛋白疫苗是預(yù)防肺炎鏈球菌感染的未來發(fā)展方向，但目前國際上對蛋白質(zhì)疫苗尚處于臨床前研究階段，由于單一蛋白的保護效果并不理想，聯(lián)合蛋白疫苗是目前研究的熱點。采用多種肺炎鏈球菌毒力蛋白聯(lián)合免疫，以擴大其對機體的保護效應(yīng)是一種可行方式，因為蛋白抗原聯(lián)合疫苗提供了多種毒力作用的潛在靶標(biāo)。GTS、POTD和SRTA蛋白都是肺炎鏈球菌的重要毒力因子，生物信息學(xué)分析顯示其在肺炎鏈球菌中保守性高，且均在細菌表面有表達，但尚未有報道對其作為疫苗候選蛋白進行系統(tǒng)的免疫保護效果評價。本研究擬先比較肺炎鏈球菌GTS、POTD和SRTA單個蛋白抗原免疫小鼠后，對肺炎鏈球菌感染的保護作用；然后采用不同血清型的肺炎鏈球菌，檢測上述蛋白兩兩聯(lián)合、三種蛋白組合后免疫小鼠，與單個蛋白抗原組比較，以評價其對肺炎鏈球菌感染的保護效果。方法本研究首先通過基因克隆、蛋白表達及純化技術(shù)，成功制備了肺炎鏈球菌GTS、POTD及SRTA重組蛋白。重組蛋白經(jīng)鼻腔免疫途徑，以研究抗原特異性反應(yīng)，并檢測其體液和細胞調(diào)節(jié)反應(yīng)。為了模擬肺炎鏈球菌感染的自然途徑，以評價GTS、POTD及SRTA重組蛋白抗原對小鼠鼻腔感染后的保護效果，選擇肺炎鏈球菌中致病能力最強的D39菌株進行鼻腔攻毒實驗，以構(gòu)建肺炎鏈球菌性肺炎的小鼠模型。為了更充分地評估GTS、POTD和SRTA重組蛋白不同組合對多種血清型肺炎鏈球菌感染的保護效果，本研究采用上述重組蛋白抗原經(jīng)小鼠腹腔免疫，然后選擇不同血清型肺炎鏈球菌進行腹腔攻毒實驗研究。再次采用特異性抗血清免疫小鼠后，選擇D39肺炎鏈球菌進行鼻腔攻毒實驗，以鑒定重組蛋白抗原的保護性是否由其特異性抗體介導(dǎo)的。采用細胞粘附實驗，以分析GTS、POTD和SRTA重組蛋白及其特異性抗血清對D39細胞粘附于A549細胞的影響；最后，為了進一步探討人體經(jīng)肺炎鏈球菌感染后，該細菌表面抗原GTS、POTD和SRTA刺激機體產(chǎn)生的天然抗體滴度變化，本研究收集正常人群及急性肺炎患者，擬采用ELISA法測定血清中ANTIGTS、ANTIPOTD及ANTISRTA抗血清的滴度變化。結(jié)果在成功克隆和表達GTS、POTD和SRTA重組蛋白基礎(chǔ)上，通過WESTERNBLOT分析證實，CMCCB31216SEROTYPE9V、CMCCB31436SEROTYPE3、CMCCB31507SEROTYPE7F等8種血清型的肺炎鏈球菌均能表達GTS、POTD和SRTA蛋白，且蛋白抗原性未發(fā)生變異。粘附抑制實驗證實，單一GTS、POTD和SRTA蛋白都能抑制D39對A549細胞的粘附，且23個蛋白質(zhì)抗原的聯(lián)合使用，具有明顯的累加效應(yīng)。此外，抗GTS、抗POTD和抗SRTA抗血清的單獨使用或23個抗血清的聯(lián)合使用，也具有和蛋白抗原類似的抑制效應(yīng)。通過鼻腔滴注GTS、POTD或SRTA重組蛋白，小鼠脾細胞產(chǎn)生了高水平的TH1介導(dǎo)的細胞因子IFNΓ、TH2介導(dǎo)的細胞因子IL4、TREG介導(dǎo)的IL10因子和TH17介導(dǎo)的細胞因子IL17A，誘導(dǎo)了小鼠對肺炎鏈球菌的粘膜免疫及系統(tǒng)免疫。在構(gòu)建的肺炎球菌感染的小鼠模型中，GTS、POTD或SRTA重組蛋白重組通過粘膜途徑免疫小鼠，均能有效減少19F型肺炎鏈球菌在鼻咽部及肺部的定植。與單個蛋白抗原比較，GTSSRTA、POTDGTSSRTA均能顯著提高肺炎鏈球菌對肺部定植的保護作用。3個蛋白抗原聯(lián)合粘膜免疫后，對肺炎鏈球菌中致病能力最強的D39血清型鼻腔感染保護率可達833％。腹腔免疫結(jié)果與粘膜免疫類似，幾乎所有蛋白抗原聯(lián)合都較單個蛋白的保護作用更強。但與蛋白兩兩組合比較，GTSPOTDSRTA的三聯(lián)蛋白抗原的聯(lián)合腹腔免疫，其保護作用并未見明顯加強。被動免疫研究提示，抗GTS、抗POTD和抗SRTA抗血清聯(lián)合免疫小鼠，其對小鼠腹腔感染肺炎鏈球菌的保護作用與主動免疫的效果相似，提示GTS、POTD及SRTA蛋白抗原通過主動免疫激發(fā)的保護效應(yīng)與其抗體的作用密切相關(guān)。結(jié)論通過本研究的分析顯示，GTS、POTD及SRTA在肺炎鏈球菌中的保守性高，三種蛋白聯(lián)合抗原的兩兩組合及三種聯(lián)合，通過粘膜免疫途徑或系統(tǒng)性免疫途徑免疫小鼠，均能誘導(dǎo)小鼠對不同血清型肺炎鏈球菌感染的顯著保護效果，顯示GTS、POTD及SNA是一組有開發(fā)潛力的候選疫苗組合。

簡介：安徽大學(xué)碩士學(xué)位論文光功能多羧酸超分子體系的分子設(shè)計及晶體工程學(xué)探索姓名朱永敏申請學(xué)位級別碩士專業(yè)無機化學(xué)指導(dǎo)教師田玉鵬20070501安徽大學(xué)碩士學(xué)位論文摘要ABSTRACTCRYSTALENGINEERINGHASBEENANETVINDEPENDENTSUBJECTSINCEITWASPUTFORWARDANDPENETRATEDTOTHEMATERIALSCIENCE，COORDINATIONCHEMISTRYANDSUPRAMOLECULARCHEMISTRYLUMINESCENTSUPRAMOLECULARMATERIALSRELATEDTOMATERIALSSCIENCEANDCRYSTALENGINEERINGHAVEATTRACTEDCONSIDERABLEATTENTIONSDUETOTHEIRAPPLICATIONSASERIESOFLUMINESCENTDICARBOXYLATEWEFESYNTHESIZEDBASEDONTHEIDEANOVELLUMINESCENTSUPRAMOLEEULES，WHICHHAVEBOTHADVANTAGESOFORGANICANDINORGANICCOMPOUNDS，WEREOBTAINEDMAINRESEARCHRESULTSWEMLISTEDASFOLLOW1THERECENTDEVELOPMENTSOFFUNCTIONALMULTICARBOXYLATEWEREREVIEWEDBASEDONAGREATDEALOFRELATEDLITERATURES2ANOVELRIGIDLIGANDS9ETHYLCARBAZOLE一36DICARBOXYLICACIDLOWASSUCCESSFULLYSYNTHESIZEDWHICHWERECHARACTERIZEDBYNMLLMSIRSPECTRA。THERESULTSOFOPTICALPROPERTYSTUDIESFORTHECOMPOUNDSREVEALEDTHATITEXHIBITEDSTRONGLUMINESCENTEMISSIONS3BYHYDROTHERMALSYNTHESISMETHODLI，DIFFERENTMETALSANDTHERIGIDORFLEXIBLECOLIGANDSWEREUSEDASBASICBUILDINGBLOCKSASERIESOFNEWSUPRAMOLECULARCOMPLEXESWEREOBTAINEDAFTERSYSTEMICINVESTIGATIONTHERELATIONSHIPBETWEENSTRUCTURESANDPROPERTIESWE他DEEPLYSTUDIEDFURTHER1LLANDCADMIUMNITRATEWEREUSEDASBASICBUILDINGBLOCKS，THE2DSUPRAMOLCCULAROPENFRAMEWORKWASFIRSTFORMEDIDCHAIMANDTHENEXTENDEDINTO2DSTRUCTURETHROUGHHYDROGENBONDSANDAROMATIC儼冗INTERACTIONSWHENWEINTRODUCEDALUMINESCENTRINDCHELATEDLIGANDPHENINTOTHEREACTIONSYSTEMIDZIGZAGCHAINSFORMINGANDTHENEXTENDINGINTO2DSTRUCTUREBY兀噸INTERACTIONSWHENWECHANGEDAFLEXIBLEBRIDGELIGANDBIPYINTOTHESYSTEM，INTERESTINGLYTHE3DSUPRAMOLECULARARCHITECTUREWASFORMED2DGRIDLAYERSBASEDONIDCHAINSBYINTERMOLECULARHYDROGENBONDSANDTHENEXTENDEDINTO3DSTRUCTURETHROUGHAROMATIC717IINTERACTIONS2WEUSEDLTANDMANGANESECHLORIDE硒BASICBUILDINGBLOCKSINTHECONDITIONOFHYDROTHERMALSYNTHESIS2DSUPRAMOLECULAROPENFRAMEWORKISFORMEDBYINTERMOLECULARHYDROGENBONDSAND丌仉INTERACTIONSFROM1DCHAINSWASGAINED3LI，ZINCNITRATEANDAMACROCYCLEII

簡介：由于人口及其流動的增多、艾滋病與結(jié)核病的雙重傳播和耐藥結(jié)核菌株的出現(xiàn)等，1990年以后全球結(jié)核病的發(fā)病率驟然回升，結(jié)核病已成為危害人類健康的全球性衛(wèi)生問題。尋找新的藥物靶標(biāo)、設(shè)計新型抗結(jié)核藥物已經(jīng)成為當(dāng)前控制結(jié)核病的重要策略之一。常選做藥物靶點的關(guān)鍵酶有與結(jié)核分枝桿菌細胞壁合成相關(guān)的酶、與抗耐藥有關(guān)的酶以及與電子傳遞及氧化還原有關(guān)的酶等。該文著眼于結(jié)核分枝桿菌脂肪酸代謝中的關(guān)鍵酶脂酰COA合成酶FADD8，進行結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究。通過多種蛋白質(zhì)分離純化方法及其結(jié)晶實驗，最終獲得FADD8蛋白最高分辨率達31的晶體，但由于衍射質(zhì)量的問題未能對衍射數(shù)據(jù)進行下一步的軟件分析處理。需要進一步優(yōu)化結(jié)晶條件以獲得高衍射質(zhì)量的晶體。同時，該文論述了FADD8蛋白與底物ATP和COA的共結(jié)晶實驗，得到各種晶形的復(fù)合物晶體，但未能優(yōu)化出衍射質(zhì)量較高的晶體。另一方面，本文闡述了對ESCRT通路的研究情況。ESCRT通路是真核細胞內(nèi)與逆轉(zhuǎn)錄病毒入侵、有絲分裂中膜的縊裂以及多泡體MVB的形成直接相關(guān)的蛋白復(fù)合體。本實驗選擇ESCRTIII中的CHMP2A蛋白進行結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究。實驗中對單個蛋白及其與CHMP3和VPS4A蛋白復(fù)合物進行表達、純化與結(jié)晶實驗。最終獲得表達量和純度均較高的CHMP2A和VPS4A蛋白復(fù)合物，但未能獲得較高衍射質(zhì)量的晶體。雖然這些嘗試都沒能解析出CHMP2A蛋白的結(jié)構(gòu)，但無疑對后人的純化與結(jié)晶實驗具有較大的借鑒意義。

簡介：海洋分枝桿菌MYCOBACTERIUMMARINUM是一種非結(jié)核桿菌，主要感染魚類，當(dāng)其感染了人類時，細菌會主要分布在皮膚上，很少有深入感染。海洋分枝桿菌與結(jié)核分枝桿菌MYCOBACTERIUMTUBERCULOSIS，簡稱MTB或TB親緣關(guān)系密切，其氨基酸序列相似性高達85％，廣泛用作研究結(jié)核分枝桿菌致病性的模式細菌。細胞色素P450是一種單加氧酶，廣泛存在于從細菌到人類的各種生物體內(nèi)，在生命代謝過程中發(fā)揮著重要作用。結(jié)核分枝桿菌中含有20種P450，其基因密度遠遠高于其他生物，這說明P450蛋白在其致病性及抗藥性功能中發(fā)揮著重要作用。目前對CYP126A3和CYP105Q4的底物及功能方面的研究較少，經(jīng)蛋白序列比對發(fā)現(xiàn)兩種蛋白與結(jié)核分枝桿菌中的兩種P450蛋白分別有39和33的同源性。我們希望通過對兩種蛋白結(jié)構(gòu)的研究推測其在海洋分枝桿菌中可能的功能及其底物類型，進而為了解結(jié)核桿菌的致病性及抗藥性機制提供一定的線索。T細胞因子（TCF）在經(jīng)典WNT信號通路中有著至關(guān)重要的作用，它能夠招募ΒCATENIN與目的基因進行結(jié)合，進而調(diào)控下游目的基因的表達。近年來的研究發(fā)現(xiàn)TCF蛋白中存在兩個DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域即HMGDNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域和CCLAMP結(jié)構(gòu)域。CCLAMP結(jié)構(gòu)域在TCF蛋白與DNA的結(jié)合及對下游基因的激活具有重要作用，特別是對一些較弱的WNT反應(yīng)元件（WRES）。而這些較弱的WRES通常對細胞的生長和細胞周期發(fā)揮著重要的調(diào)節(jié)作用。且CCLAMP結(jié)構(gòu)域從果蠅到人體都很保守，這說明其在生物體基因調(diào)控中發(fā)揮著重要作用。本論文利用結(jié)構(gòu)生物學(xué)的手段和方法，對所研究的蛋白進行了克隆，表達，純化，結(jié)晶條件的嘗試和數(shù)據(jù)的收集。通過X射線衍射技術(shù)，收集得到來源于海洋分枝桿菌的CYP126A3蛋白一套分辨率為175的數(shù)據(jù)。通過數(shù)據(jù)的分析處理得知，該晶體一個不對稱單位只有一個蛋白分子，溶劑含量為521，馬修斯常數(shù)為2573DA1。該晶體的晶胞參數(shù)為A6308，B10584，C13848，ΑΒΓ90O，屬于C222或C2221空間群。正確的空間群必須在找到相位后才能確定，目前結(jié)構(gòu)解析工作在進一步進行中，相同來源的CYP105Q4蛋白的晶體還在進一步優(yōu)化中。對于人源TCFT蛋白，我們得到蛋白與DNA寡聚多核苷酸的復(fù)合物，并得到初篩晶體，目前在進行下一步的相關(guān)工作。

簡介：點擊查看更多肺炎鏈球菌熱休克蛋白GrpE的初步晶體學(xué)研究.pdf精彩內(nèi)容。

簡介：人類冠狀病毒HKU1屬于冠狀病毒亞科Β屬A組群冠狀病毒，主要引起人類自限性上下呼吸道感染在免疫系統(tǒng)受損或低下的人群中情況更為嚴重，特別是哮喘病人和新生兒童。冠狀病毒基因組編碼復(fù)制酶蛋白基因、結(jié)構(gòu)蛋白基因和附屬蛋白基因。復(fù)制酶多蛋白被主蛋白酶和附屬蛋白酶切割成16個非結(jié)構(gòu)蛋白，進而組裝成復(fù)制、轉(zhuǎn)錄復(fù)合體，介導(dǎo)病毒傳播。非結(jié)構(gòu)蛋白9（NSP9）是一種DNARNA結(jié)合蛋白，在病毒復(fù)制轉(zhuǎn)錄過程中起著至關(guān)重要的作用。Β屬冠狀病毒基因組3‘非翻譯區(qū)（UTR）存在兩個保守性的二級結(jié)構(gòu)凸出莖環(huán)和假結(jié)。在研究小鼠肝炎病毒基因組3‘非翻譯區(qū)的過程中發(fā)現(xiàn)假結(jié)處6個堿基（AACAAG）的插入會造成病毒幾近死亡，病毒傳代實驗中發(fā)現(xiàn)一個病毒回復(fù)突變體U13017G（NSP9N60K）能救活病毒，但是其挽救病毒的機制未知。小鼠肝炎病毒NSP9蛋白結(jié)構(gòu)尚未被解析，但N60在Β屬冠狀病毒NSP9蛋白一級序列中是相對保守的。因此，選擇人類冠狀病毒HKU1NSP9為模型，研究NSP9與病毒基因組3’UTR的相互作用機制。此篇論文以人類冠狀病毒HKU1非結(jié)構(gòu)蛋白9為研究對象，構(gòu)建N60K克隆，通過一系列表達純化手段，獲得了純度較高的HCOVHKU1NSP9N60K蛋白。經(jīng)過反復(fù)的結(jié)晶嘗試晶體，獲得衍射分辨率高達26埃的蛋白晶體。

簡介：白血病是造血系統(tǒng)的一種惡性疾病，目前在我國具有較高的發(fā)病率和死亡率，而且發(fā)病率還在不斷攀升，因此與白血病發(fā)生相關(guān)的分子機制的研究備受關(guān)注。IKAROS家族蛋白是主要分布在血細胞中的一類轉(zhuǎn)錄因子蛋白，可調(diào)控血細胞分化發(fā)育中多種重要基因的轉(zhuǎn)錄和表達，對多種血細胞，尤其是淋巴系白細胞的發(fā)育有著重要影響。它們的表達或功能異常與多種血液系統(tǒng)惡性腫瘤高度相關(guān)。IKAROS家族蛋白的N端和C端各具有一組C2H2型鋅指結(jié)構(gòu)域N端部分的四個鋅指主要負責(zé)結(jié)合特定的DNA序列而C端的兩個鋅指參與介導(dǎo)蛋白蛋白之間的相互作用，并對N端功能和蛋白壽命起到一定的調(diào)控作用。IKAROS家族蛋白可以從染色體、核小體、RNA聚合酶三個層面，通過直接結(jié)合目的基因的調(diào)控元件、招募染色質(zhì)重塑復(fù)合物以及將目的基因調(diào)控區(qū)域募集至細胞核異染色質(zhì)區(qū)域等方式，調(diào)控下游蛋白的轉(zhuǎn)錄。其中，C端鋅指介導(dǎo)的蛋白蛋白相互作用對轉(zhuǎn)錄調(diào)控的完成起重要作用。本論文選取該家族的IKAROS和AIOLOS的C端保守部分作為研究對象，進行質(zhì)粒構(gòu)建、表達、純化及初步的晶體學(xué)研究。已獲得的研究結(jié)果包括1通過分子克隆的方法成功構(gòu)建了多種表達質(zhì)粒。在原核系統(tǒng)中，質(zhì)粒攜帶的編碼基因能夠表達出含有不同長度柔性連接區(qū)域的MBP融合蛋白，且經(jīng)酶切驗證，各融合蛋白呈現(xiàn)不同的酶切效果2根據(jù)目的蛋白的特異標(biāo)簽親和性、表面電荷、疏水性、分子量及分子形狀等特征，采取不同的層析方式分別對MBPIKAROSCAIOLOSC及IKAROSAIOLOS的C端蛋白進行分離純化，獲得了大量高純度的MBPIKAROSCAIOLOSC融合蛋白3進一步實驗證明IKAROSAIOLOS的C端蛋白可能與層析填料基質(zhì)發(fā)生相互作用，導(dǎo)致目的蛋白難于洗脫純化4針對MBPIKAROSCAIOLOSC篩選得到多個潛在的晶體生長條件，完成初步條件優(yōu)化，可重復(fù)性很強，目前實驗仍在繼續(xù)進行中。論文的另一部分對雙孔鉀離子通道TREK1進行了研究。該蛋白主要分布在中樞和外周神經(jīng)系統(tǒng)中。TREK1屬于機械門控性鉀離子通道，同時受到化學(xué)或生理性刺激，包括脂質(zhì)、磷酸化、溫度、PH值等多種因素的調(diào)節(jié)。它在體內(nèi)具有重要的生理意義，與神經(jīng)保護、疼痛、麻醉、抑郁癥等具有一定的相關(guān)性。哺乳動物雙孔鉀離子通道TREK1亞群以二聚的形式發(fā)揮功能，其單體具有典型的結(jié)構(gòu)特征4個跨膜片段M1～M4，2個孔道區(qū)域2P，胞漿內(nèi)側(cè)有較短的氨基端和較長的羧基端。有報道稱，TREK1C端部分是各種因素調(diào)控TREK1活性的一個重要部位。本論文以TREK1的C端蛋白部分作為研究對象，進行了一系列分子克隆、表達、純化及初步晶體學(xué)實驗。目前，利用PET28A、PET30A、PMAL、PFN18A等載體，分別連接不同長度TREK1C截短片段的編碼基因，已成功構(gòu)建11種表達質(zhì)粒。通過誘導(dǎo)表達試驗，篩選出表達較好且融合蛋白可溶性較高的PMALTREK1C質(zhì)粒進行大量表達。選用MBP親和層析及分子篩對MBPTREK1C進行分離純化，最終得到足量且純度較高的融合蛋白。使用INDEX及WIZARD兩種結(jié)晶試劑盒進行晶體條件的初步篩選，結(jié)果尚在觀察中。

簡介：本文主要從以下幾個部分展開論述1B型鏈球菌毒力因子的初步晶體學(xué)研究B型鏈球菌GBS是導(dǎo)致圍產(chǎn)期和新生兒感染的主要病原菌，主要存在于大約25％健康女性的生殖道中。GBS在子宮內(nèi)的上行感染增加了新生兒患肺炎，敗血癥，腦膜炎的風(fēng)險。目前，國內(nèi)外對于GBS的預(yù)防方案采用的主要是抗生素預(yù)防，但是近些年出現(xiàn)的GBS對抗生素的耐受性引起了對GBS感染治療的關(guān)注。目前還沒有有效的措施預(yù)防GBS的上行感染，因此新型疫苗和抗菌藥物的開發(fā)已經(jīng)迫在眉睫，而針對GBS毒力蛋白或其合成途徑設(shè)計抑制性藥物是一種較為有效且可行的方案。GBS基因組測序已經(jīng)完成，結(jié)合文獻的報道，我們篩選了十種與GBS毒力作用相關(guān)的蛋白進行結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究，這十種蛋白包括負責(zé)合成GBSΒHAEMOLYSIS的CYL操縱子上的CYLA、CYLB和CYLE，還有一些與GBS毒性相關(guān)的表面蛋白，這些表面蛋白對GBS的生長和毒性具有不可或缺的作用。我們試圖利用結(jié)構(gòu)生物學(xué)的手段探究這些蛋白發(fā)揮毒力作用的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)，希望通過結(jié)構(gòu)分析找到這些蛋白上的潛在靶向藥物作用位點，為新型抗菌藥物的開發(fā)與設(shè)計提供理論依據(jù)。于是，我們將這十種毒力蛋白分別進行了分子克隆、大量表達與純化，并對純化得到的高純度蛋白進行大規(guī)模的晶體篩選。最后，有兩種表面蛋白收集了衍射數(shù)據(jù)，通過對衍射數(shù)據(jù)的處理獲得了初步的結(jié)構(gòu)信息。2免疫卡控點TIGIT抗原表位和抗體CDR序列的初步研究近年來，針對免疫細胞共抑制性受體的免疫卡控點治療在腫瘤免疫治療中取得了巨大進展。免疫卡控點治療與傳統(tǒng)治療方法的區(qū)別在于，它不是以腫瘤細胞作為靶點，而是以免疫細胞表面的抑制性受體為靶點，通過抑制這種受體來激活免疫細胞抗腫瘤活性，研究最多的這種抑制性受體是CTLA4，PD1，目前針對它們的單抗藥物已經(jīng)在臨床實驗中取得了初步成功。但是這些抗體藥物還具有局限性和副作用，所以發(fā)現(xiàn)和驗證新的共抑制性受體成為一個全球競爭性的熱點。TIGIT是2009年被發(fā)現(xiàn)的位于NK細胞和T細胞表面的共抑制性受體，目前研究表明阻斷TIGIT的單克隆抗體，在動物模型中具有很好的抗癌效果，所以TIGIT是一個很具潛力的免疫治療新靶點，但國內(nèi)外還沒有針對TIGIT受體的抗體藥物上市，因此亟須開展高效特異性TIGIT單克隆抗體的研發(fā)。該研究課題主要圍繞TIGIT單克隆抗體與TIGIT復(fù)合物結(jié)構(gòu)展開，希望能通過解析復(fù)合物晶體結(jié)構(gòu)來發(fā)現(xiàn)TIGIT單抗高變識別區(qū)CDR序列和TIGIT靶點的抗原表位，然后再基于結(jié)構(gòu)改造獲得更高親和力的TIGIT單抗序列。在本課題中，我們構(gòu)建了鼠和人TIGIT的原核表達體系，對TIGIT進行了表達和純化從裸鼠腹水中純化TIGIT單抗，并構(gòu)建了抗體FAB段的原核分泌型表達體系，進行原核純化。

簡介：廣西師范大學(xué)碩士學(xué)位論文雙酰肼及硫代半卡巴腙配合物的合成、晶體結(jié)構(gòu)、譜學(xué)表征及其生物活性姓名郭桂全申請學(xué)位級別碩士專業(yè)無機化學(xué)指導(dǎo)教師梁宏邊賀東20050501廣西師范大學(xué)碩士掌位論文摘要們的紅外光譜，以及與CTDNA相互作用的紫外．可見光譜、熒光光譜。光譜研究表明，3和4都能以插入方式與CTDNA鍵合。并研究了它們的抑菌活性，其中4對金黃色葡萄球菌有較好的抑制作用，而3可能由于它的難以溶解性對于抑菌效果不明顯。關(guān)鍵詞雙酰肼硫代半卡巴腙配合物晶體結(jié)構(gòu)小牛胸腺DNA溴化乙錠生物活性ABSTRACTHYDRAZIDATEANDITSRAMIFICATIONARESTRONGCHELATINGLIGANDS，WHICHCALLFORMCOMPLEXESWITHMANYMETALS．THESECOMPOUNDSHAVEPRODIGIOUSAPPLICATIONVALUES，SUCHASMAGNETISMANDOPTICALMATERIAL，MOLECULERECOGNIZEREAGENT，CATALYSEREAGENT，ESPECIALLYINBIOLOGICALACTIVITYASPECT．ANDTHIOSEMICARBAZONEALSOPOSSESSSTRONGCOORDINATIONABILITY,ITSCOMPLEXESHAVEDRUGGERYACTIVITY,SUCHASANTITUMOR,RESTRAININGLEPRA，RHEUMATISM，IMPALUDISM，VIRUS，SMALLPOX．ZINC，NICKELANDCOBALTARENECESSARYELEMENTS，WHICHISREPORTEDTHMTHEYEXISTINTHEFORMOFCOMPLEX．THEREFORE，INTHISESSAY,WESYNTHESIZEDONEDIHYDRAZIDATELIGANDANDITSTWOCOMPLEXES，ANDONETHIOSEMICARBAZONELIGANDANDITSTWOCOMPLEXES．THECOMPLEXESWERECHARACTERIZEDBYUV一ⅥS，F(xiàn)LUORESCENCE，SOLIDFLUORESCENCE，TGODTA，ELEMENTANALYSISANDIRSPECTRUMANDTHECRYSTALSTRUCTURESALEDETERMINEDBYSINGLECRYSTALXRAYDIFFRACTIONMETHODS．ANDTHEIRBONDMODELWITHCTDNAHASALSOBEENINVESTIGATED，DATAINDICATESTHATTHEYALLAREPOTENTIALDNAPROBEANDHAVEINVESTIGATEDVALUES．THEREINTO，PYRIDINE一3一CARBOXALDEHYDETHIOSEMICARBAZONEZNIICOMPLEXHASANTIVIRALACTIVITY,WHICHISPOTENTIALTHERAPYDRUGGERY．CHAPTERONEANEWUNSYMMETRICALDIHYDRAZIDATELIGANDC13H11N302ISSYNTHESIZED，ANDITSCOH、ZNIICOMPLEXARESYNTHESIZEDBYLIQUIDMETHOD，WHICHFORMULAAREZNC13HIIN3022C12．211201、【COC13HLLN3022C12H202．2H202．COMPLEXLBELONGSTOORTHORHOMBICSYSTEM．SPACEGROUPPMN21，WITHUNITCELLPARAMETERSA28．582A，B6．1185A，C7．7626A，Z2，F(xiàn)INALR，O．0670，WR2O．1504I2盯FJ，WHILECOMPLEX2BELONGSTOMONOCLINICSYSTEM，SPACEGROUPE

簡介：中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)碩士學(xué)位論文中華眼鏡蛇毒短鏈神經(jīng)毒素和環(huán)核苷酸門控離子通道抑制劑類似蛋白的晶體學(xué)研究姓名涂雄鷹申請學(xué)位級別碩士專業(yè)生物化學(xué)和分子生物學(xué)指導(dǎo)教師牛立文滕脈坤200271碩士論文摘要初步階段，已有的證據(jù)表明CRISP作用對象為離子通道，在精予成熟、信號傳導(dǎo)等過程中起作用。與CRISP一1IKETOXIN種屬來源相近的有PSEUDECHETOXIN，它是一個從澳洲眼鏡蛇粗毒中純化出來的一個環(huán)核苷酸門控離子通道抑制劑蛋白，因此我們也稱CRISPLIKETOXIN為環(huán)核苷酸門控離子通道抑制劑類似蛋白，但目前還未能證明CRISP一1IKETOXIN是否也能作用于環(huán)核苷酸門控離子通道?？傊瑢RISPLIKETOXIN的研究具有一定的基礎(chǔ)和應(yīng)用價值。目前我們培育出在普通X光源可衍射到40A的單晶，確定其空間群為P42。2／P4。2。2，晶胞參數(shù)為A6158A，B6158A。C15349A。關(guān)鍵詞＼望鏈等毒謄、富胱氨酸分泌蛋白、蛇毒、蛋白質(zhì)結(jié)晶、直按數(shù)金屬離子、晶體結(jié)構(gòu)、

簡介：南開大學(xué)碩士學(xué)位論文鈮酸鋰晶體缺陷結(jié)構(gòu)的能學(xué)計算姓名竇樹崗申請學(xué)位級別碩士專業(yè)凝聚態(tài)物理指導(dǎo)教師孔勇發(fā)20090501ABSTRACTABSTRACTLITHIUMRTIOBATELINB03，LNCRYSTALISONEOFTHEMOSTIMPORTANTSYNTHETICMATERIALSWI廿LVARIOUSOFEXCELLENTPROPERTIES，SUCH嬲ELECTROOPTIC，ACOUSTOOPTIC，THERMALOPTIC，PIEZOELECTRICANDPHOTOREFRACTIVEEFFECTS．THROUGHCHANGINGLI／NBRATIOORDOPINGIONSSUCHASMG．FEANDZR,THEOPTICALELECTROPERFORMANCEOFLINB03CANBEENHANCEDGREATLY．THEREFORELITHIUMNIOBATEISTHOUGHTTOBEONEOFTHEMAINCONTENDERSFORTHEROLEOF”O(jiān)PTICALSILICON“，ANDHASEXTENSIVEAPPLICATIONS．ITISTHESORTSANDCONCENTRATIONSOFDEFECTSIN1ITHIUMNIOBATETHATGREATLYIMPACTSITSOPTICALELECTROPROPERTIES，BUTNOWTHEFINESTRUCTUREOFTHEDEFECTSINLINB03ISSTILLUNCLEAR,ESPECIALLYTHELOCATIONOFTHEDEFECTIONS，WHICHSEVERELYPREVENTSITSWIDEAPPLICATIONS．INTHISDISSERTATION，WEINVESTIGATETHEDEFECTSTRUCTUREOFLINB03INTHESCALEOFATOMS．BYUSINGTHEEMPIRICALPROCEDUREWHICHBASEDONTHECLASSICALSHELLMODEL，THELIDARD＆NORGETTAPARTREGIONTACTICANDTHEMORTLITTLETONAPPROXIMATION,WECALCULATEVARIOUSDEFECTSTRUCTUREINLINBOSCRYSTALS．INCHAPTERONE，WEINTRODUCEDTHEBACKGROUNDANDGAVEABRIEFINTRODUCTIONOFTHEWORKANDTHEMETHODUSEDINTHISDISSERTATION．INCHAPTERTWO，WEGAVEADETAILEDINTRODUCTIONOFTHESHELLMODELANDTHECALCULATIONOFINTERACTIONBETWEENIONS．THENTHECALCULATIONMETHODOFTHEDEFECTFORMATIONENERGYWASGAVE．INCHAPTERTHREE，WEPERFORMEDCOMPUTERSIMULATIONSTUDYOFTHEINTRINSICDEFECTSINLINB03CRYSTALS．ITWASSHOWNTHATLIVACANCYMODELISMORESUITABLEINLINB03，ANDTHEINTRINSICDEFECTSAREDEFECTCOMPLEXESCOMPOSEDBYONEANTISITENIOBIUMION冊0ANDFOURLIVACANCIES圪．THENWEGAVETHELOCATIONSOFTHISDEFECTS．THEINFRAREDABSORPTIONSPECTRABEFOREANDAFTERDOMAINREVERSALCONFIRMEDOURCALCULATIONRESULTS．INCHAPTERFOUR．WESTUDIEDTHEDEFECTSTRUCTUREOFDOPEDLINB03BYCOMPUTERSIMULATION，ANDOBTAINEDTHEDEFECTSTRUCTURESWHILETHEDOPINGCONCENTRATIONBEFOREANDAFTERTHEDOPINGTHRESHOLD．INLOWDOPEDLINB03，THEDOPEDIONSSUBSTITUTETHENB,IONSANDFORMDEFECTCOMPLEXESWITH％；ASTOHIGHDOPEDLINB03，THELI