1、因微生物幾乎能參加所有的生物地球化學(xué)循環(huán),對(duì)微生物多樣性進(jìn)行研究,探討微生物群落的分布及其變化,有助于加深對(duì)生物地球化學(xué)循環(huán)的認(rèn)識(shí)。本文對(duì)珠江口水體中的細(xì)菌豐度、細(xì)菌生產(chǎn)力和固碳基因多樣性以及遼河口沉積物中的古菌豐度、群落結(jié)構(gòu)進(jìn)行了詳細(xì)描述,分析了影響微生物群落變化的環(huán)境因素,為進(jìn)一步了解微生物所介導(dǎo)的地球化學(xué)反應(yīng)提供了理論依據(jù)。
本文以2014年8月珠江口海水樣品為研究對(duì)象,利用平板計(jì)數(shù)法和流式細(xì)胞儀對(duì)珠江口表層和垂直海域可
2、培養(yǎng)細(xì)菌和細(xì)菌總數(shù)分布狀況進(jìn)行研究,測(cè)定細(xì)菌生產(chǎn)力,并結(jié)合環(huán)境因子進(jìn)行相關(guān)性分析。結(jié)果表明:從珠江口到南海北部海域,水平方向上可培養(yǎng)細(xì)菌總數(shù)變化范圍是3.70×102~1.42×103 CFUs/ml,細(xì)菌總數(shù)變化范圍是5.12×105~1.61×106 cells/ml,細(xì)菌生產(chǎn)力的變化范圍是0.03~0.40 mg/m3/h;垂直方向上,可培養(yǎng)細(xì)菌的變化范圍是1.08×103~9.00×103CFUs/ml,細(xì)菌生產(chǎn)力變化范圍是0.
3、01~0.08 mg/m3/h,其中表層海水中的細(xì)菌生產(chǎn)力明顯高于底層。與環(huán)境因子的相關(guān)性分析表明,水平方向上,影響珠江口表層海水細(xì)菌總數(shù)和細(xì)菌生產(chǎn)力的主要因素是溫度、鹽度、硝酸鹽、硅酸鹽、亞硝酸鹽和磷酸鹽( P<0.05);垂直斷面水域,影響珠江口可培養(yǎng)細(xì)菌總數(shù)的主要因素是亞硝酸鹽(P<0.05),影響細(xì)菌生產(chǎn)力的主要影響因子是溫度和鹽度(P<0.05)??梢姡榻诒韺雍K屑?xì)菌總數(shù)高于可培養(yǎng)細(xì)菌總數(shù)2~3個(gè)數(shù)量級(jí),表明該海域表層海
4、水存在大量不可培養(yǎng)細(xì)菌;細(xì)菌的生命活動(dòng)在海水表層相較底層更為活躍。為揭示珠江口表層海水中,參與卡爾文循環(huán)的固碳基因多樣性及其與環(huán)境因子的關(guān)系,本研究以卡爾文循環(huán)中的關(guān)鍵酶核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶(RubisCO)的Ⅰ、Ⅱ型基因(cbbL,cbbM)作為分子標(biāo)記,采用illumina Miseq高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)海水中的固碳基因多樣性進(jìn)行分析,并結(jié)合多元統(tǒng)計(jì)分析的方法,探討了固碳基因多樣性與環(huán)境因子的關(guān)系。結(jié)果顯示,在珠江口表層
5、海水中,含 cbbL固碳基因的細(xì)菌類群主要?dú)w屬于變形菌門(Proteobacteria)、藍(lán)藻門(Cyanobacteria)和厚壁菌門(Firmicutes),其中優(yōu)勢(shì)亞群分別是γ-變形菌亞門(45.3%)、藍(lán)細(xì)菌(30.9%)和β-變形菌亞門(23.8%);而含cbbM基因的固碳菌群未檢測(cè)到;近岸的 A9站位與其他站位物種組成有一定的差異,異著色菌屬(Allochromatium)、硫桿菌屬(Thiobacillus)和硫單胞菌屬(
6、Thiohalomonas)為其特有菌屬;相關(guān)性和冗余分析(RDA)結(jié)果顯示,含cbbL基因的固碳基因豐度與水溫(WT)、鹽度呈顯著負(fù)相關(guān)(P<0.01),與硝酸鹽、亞硝酸鹽、硅酸鹽呈顯著正相關(guān)(P<0.01)。為揭示遼河口沉積物中古菌豐度和群落結(jié)構(gòu),本研究以熒光定量和illumina Miseq高通量測(cè)序的方法,探討了遼河口鹽度梯度下古菌豐度、群落結(jié)構(gòu)和生態(tài)功能的變化。結(jié)果表明:在遼河口水域,古菌16S rRNA基因豐度的分布范圍是5
7、.1×105~3.8×106copies/g,表明遼河口沉積物中分布大量的古菌類群;古菌豐度與溫度和鹽度顯著正相關(guān)(P<0.05),與NO3-和SiO32-顯著負(fù)相關(guān)(P<0.05),表明影響古菌豐度分布的主要因素是溫度、鹽度、NO3-和 SiO32-。遼河口沉積物中,主要古菌類群是奇古菌(Thaumarchaeota,69.43%)和廣古菌(Euryarchaeota,28.63%),鹽度和溫度是影響遼河口古菌群落結(jié)構(gòu)的的主要因素,在