基于線粒體基因和多核基因的臭蛙屬系統(tǒng)發(fā)育研究.pdf

1、臭蛙屬（Odorrana）隸屬于兩棲綱（Amphibia）無尾目(Anura)蛙科(Ranidae)，是一類生活在山澗溪流中的兩棲動物，全球已知58種，中國有36種，分布范圍遍及中國秦嶺以南、琉球群島、印度東北部和東南亞地區(qū)，為亞洲特有。臭蛙屬是蛙科動物中從真蛙類向水蛙類進化的重要過渡類群，重建其系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系及起源和擴散歷史一直是兩棲類系統(tǒng)發(fā)育研究的熱點，然而由于前期研究依據(jù)的物種數(shù)量有限、分子標(biāo)記較少，臭蛙屬在蛙科中的分類地位、屬內(nèi)物

2、種組成、種組劃分及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系存在廣泛爭議。本研究通過廣泛野外考察和數(shù)據(jù)收集，獲得臭蛙屬86％樣本，基于線粒體12S、16SrRNA基因和16個核基因及16053 bp大數(shù)據(jù)，運用貝葉斯法（BI法）、最大似然法(ML法)、松散分子鐘模型、RASP軟件S-DIVA和BBM模型，重建臭蛙屬的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系、探討臭蛙屬地理分布格局、揭示其起源、分化、擴散機制。
　　本研究主要內(nèi)容包括：⑴臭蛙屬為高支持率的單系群，分為8個支系（即A-H支系

3、）。⑵荔浦臭蛙最早從臭蛙屬中分化，為A支系。⑶沙巴臭蛙和越北臭蛙聚為一支，為B支系。⑷構(gòu)成C支系的13個臭蛙屬物種主要分布于云貴高原。龍勝臭蛙、宜章臭蛙和安龍臭蛙聚成的C1支和云南臭蛙種組構(gòu)成的C2支，前者在臭蛙屬中的地位不穩(wěn)定，基于核基因序列C1支與廣義花臭蛙種組形成姊妹群關(guān)系。⑸來自琉球群島的石川臭蛙鑲嵌在臭蛙屬內(nèi)，形成獨立的一支D，但在臭蛙屬內(nèi)的位置未很好解決。⑹廣泛分布于秦嶺-大巴山-巫山一線和東南丘陵的廣義花臭蛙種組與海南臭蛙

4、、滇南臭蛙、封開臭蛙等構(gòu)成高支持率的支系E，支系內(nèi)物種間的關(guān)系尚未解決。⑺圓斑臭蛙、墨脫臭蛙鑲嵌在廣義大綠臭蛙復(fù)合體內(nèi)，形成高支持率的F支系;大綠臭蛙復(fù)合體廣布于橫斷山區(qū)、秦嶺-大巴山、東南丘陵及中南半島。⑻凹耳臭蛙與竹葉臭蛙種組聚為一支，構(gòu)成高支持率的東南丘陵支系（G支系）。⑼除了石川臭蛙，分布于琉球群島的臭蛙與臺灣的臺島臭蛙和棕背臭蛙形成高支持率的島嶼物種支系（H支系）。⑽臭蛙屬起源于約21.62 Ma B.P.（中新世早期），從1

5、9.25～8.69 Ma B.P.（中新世中期和后期）發(fā)生了快速分化，A支到H支依次形成。⑾各支系內(nèi)部物種的分化事件主要發(fā)生在第四紀(jì)更新世以后(2.6 Ma)，占本研究50個臭蛙物種的60％;物種分化主要發(fā)生在云貴高原（10個）、其次在東南丘陵(9個)，臺灣和琉球群島的7個臭蛙中的5個物種在2.6～1.6 Ma B.P.分化。⑿臭蛙屬分為8個支系。⒀臭蛙屬起源于新近紀(jì)中新世早期，自中新世中期至后期8個支系依次分化，在更新世臭蛙屬物種經(jīng)歷