掛榜山小鯢線粒體基因全長(zhǎng)測(cè)定及小鯢科系統(tǒng)發(fā)育分析.pdf

1、線粒體是存在于絕大多數(shù)真核生物細(xì)胞內(nèi)的一種基本的、重要的細(xì)胞器。脊椎動(dòng)物線粒體DNA(mitochondrial DNA，mtDNA)是共價(jià)閉合的環(huán)狀雙鏈DNA，能進(jìn)行自我復(fù)制，具有嚴(yán)格的母系遺傳特性，在世代傳遞過(guò)程中不發(fā)生基因重組。mtDNA已被廣泛應(yīng)用于脊椎動(dòng)物進(jìn)化遺傳學(xué)和種群遺傳學(xué)的研究，為從分子水平上解決物種的系統(tǒng)發(fā)育問(wèn)題提供了理想的研究材料。
　　 掛榜山小鯢(Hynobius guabangshanensis)隸屬于

2、兩棲綱(Amphibia)、有尾目(Urodela)、小鯢科(Hynobiidae)。本研究通過(guò)通用引物測(cè)出幾個(gè)基因片段然后通過(guò)LA-PCR擴(kuò)增出兩個(gè)基因之間的長(zhǎng)片段，再用PCR引物步移測(cè)序等方法，測(cè)定了掛榜山小鯢線粒體全長(zhǎng)。測(cè)序結(jié)果利用DNAStar軟件包中的Megalign程序?qū)ν葱蛄羞M(jìn)行排列，并經(jīng)人工仔細(xì)核查。實(shí)驗(yàn)分析結(jié)果表明：掛榜山小鯢線粒體全長(zhǎng)為16408bp，其中A為5484個(gè)，占33.4％；C為3478個(gè)，占21.2％；

3、G為2255個(gè)，占13.7％；T為5191個(gè)，占31.6％。A+T含量明顯大于G+C含量。
　　 小鯢科物種截止2009年10月共有19個(gè)物種測(cè)定了線粒體基因全序列。本文利用MEGA4.0對(duì)NCBI上19個(gè)小鯢科物種線粒體基因全序列進(jìn)行了比對(duì)，并選取了線粒體上幾個(gè)基因進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析，計(jì)算不同序列間的堿基組成、變異位點(diǎn)、簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)數(shù)、轉(zhuǎn)換/顛換比等等；用MEGA4.0軟件基于P-distance模型構(gòu)建19個(gè)小鯢科物種的遺傳距