版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請進行舉報或認領(lǐng)
文檔簡介
1、一、GSE26851、數(shù)據(jù)下載從NCBIGEO公共數(shù)據(jù)庫下載GSE2685的SeriesMatrixFile數(shù)據(jù)文件,包含22個胃癌樣本,8個健康樣本。2、差異表達使用limmaR包計算正常組織和胃癌組織的差異表達情況(|logFC|1&P0.05),共找到628個滿足條件的差異基因(保存在26851diffdiff.xls)。其中350個基因上調(diào)(保存在26851diffdiffUp.xlsx),278個基因下調(diào)(保存在26851di
2、ffdiffDown.xlsx)。表1差異基因表格前十個基因genelogFCAveExprtP.ValueATP4A4.4802162287.63550850518.343756272.73E18ATP4B7.0887280785.27553694515.289913114.65E16GIF8.7665525454.68609093613.700988839.31E15RNASE12.4806678057.94140873911.04
3、3916672.55E12CAMK2G1.6026405225.4592837878.7991055125.77E10GNAT12.3751025935.7169397728.5713213861.04E09STIP12.2400758128.0231875688.5418442861.12E09MYLPF1.3462774046.2171756738.412107491.57E09TIGR1.3790940666.1425685218
4、.2857931062.18E09SLC9A11.3837490928.8619088268.1597687313.04E09注:Gene基因symbollogFClog(差異倍數(shù))AveExpr平均表達值t檢驗值P.Value統(tǒng)計P值4、差異基因GO分析使用DAVID對差異基因進行GO功能富集分析,PValue0.05被作為篩選條件。我們共找到22個相關(guān)的GO,富集的表格如表2(26852GOGO.xlsx),圖形如圖3(26853G
5、OGO.tiff)。表2差異基因GO富集結(jié)果TermCountPValueGO:0005615~extracellularspace1091.05E20GO:0070062~extracellularexosome1724.92E20GO:0030574~collagencatabolicprocess181.62E11GO:0005576~extracellularregion964.75E10GO:0042493~responset
6、odrug341.89E09GO:0005515~proteinbinding3471.56E08GO:0022617~extracellularmatrixdisassembly151.57E07GO:0030198~extracellularmatrixganization235.44E07GO:0031012~extracellularmatrix285.58E07GO:0016324~apicalplasmamembrane27
溫馨提示
- 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
- 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
- 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預(yù)覽,若沒有圖紙預(yù)覽就沒有圖紙。
- 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
- 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負責(zé)。
- 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
- 7. 本站不保證下載資源的準確性、安全性和完整性, 同時也不承擔用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。
最新文檔
- GEO公司戰(zhàn)略分析.pdf
- ai芯片市場分析報告
- 行業(yè)研究報告 中國芯片產(chǎn)業(yè)深度分析報告
- 行業(yè)研究報告 中國芯片產(chǎn)業(yè)深度分析報告
- 胃癌組織芯片中Argonaute家族蛋白表達研究.pdf
- geo_map_node.txt
- geo_map_node.txt
- 胃癌基因芯片的差異表達基因研究.pdf
- 地理統(tǒng)計(geo-statistics)簡介
- geo-scientist named nas associate
- GEO衛(wèi)星區(qū)域覆蓋多波束天線設(shè)計與性能分析.pdf
- GEO SAR成像技術(shù)研究.pdf
- 基因芯片分析
- 胃癌基因芯片差異表達基因的驗證和篩選.pdf
- 基于Geo-Studio的土石壩滲流與穩(wěn)定分析研究.pdf
- 微小胃癌、小胃癌31例臨床病理分析.pdf
- GEO SAR電離層效應(yīng)研究.pdf
- 清華-人工智能芯片報告
- 應(yīng)用蛋白芯片篩選早期胃癌血清腫瘤標志物的研究及生物學(xué)分析.pdf
- 聯(lián)合抑制消減文庫與基因芯片技術(shù)篩選胃癌相關(guān)基因.pdf
評論
0/150
提交評論