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1、項目名稱:生殖細胞基因組結(jié)構(gòu)變異的分子基礎(chǔ)生殖細胞基因組結(jié)構(gòu)變異的分子基礎(chǔ)首席科學家:金力金力復(fù)旦大學復(fù)旦大學起止年限:2012.12012.1至2016.82016.8依托部門:上海市科委上海市科委教育部教育部的各類生殖與發(fā)育疾病的研究,可以突破上述研究瓶頸。在神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育缺陷(例如,智障)和器官組織的發(fā)育缺陷(例如,DMD),新發(fā)生的SV是重要的致病因素之一,已知的由致病性SV導(dǎo)致的病例可以占到總病例的20%;并且,隨著研究技術(shù)分辨
2、率的提高,這一檢出率還在不斷上升。本項目基于前期工作對致病性SV的研究基礎(chǔ),擬通過全基因組SV分析和定點的定量分析等技術(shù)手段相結(jié)合,鑒定生殖與發(fā)育疾病中的由生殖細胞基因組變異產(chǎn)生的致病性SV,并進行深入的SV特征研究。主要研究:(1)選擇與生殖細胞基因組SV相關(guān)的出生缺陷為切入點,包括:智障、DMD等,并同時采集核心家系,用于進行病例與其父母的基因組比較分析;(2)應(yīng)用高分辨率的比較基因組雜交芯片、特定SV位點的拷貝數(shù)定量分析等技術(shù)手段
3、,發(fā)現(xiàn)SV變異并通過家系內(nèi)的比較分析鑒定生殖細胞形成過程中新發(fā)生(denovo)的基因組SV;(3)研究和總結(jié)由生殖細胞基因組變異導(dǎo)致的各種致病性SV的結(jié)構(gòu)、基因組上的分布規(guī)律、突變熱點等特征;(4)通過對SNP和STR等人類基因組遺傳標記在家系內(nèi)的傳遞信息,確定SV的親代來源,探索在精子和卵子的發(fā)生過程在基因組SV中的相對貢獻。2)生殖)生殖細胞基因胞基因組結(jié)組結(jié)構(gòu)變異的突異的突變機理機理生殖細胞基因組的重排過程可以由不同的分子機理介
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