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文檔簡介
1、DICOM中的病理學(xué) – 第26工作組和 IHE的進(jìn)展,Bruce BECKWITH(1), Christel Daniel LE BOZEC(2), Marcial GARCIA-ROJO(3), John GILBERTSON(4), Harry SOLOMON (5) 1) 北岸醫(yī)療中心病理部,馬薩諸塞州塞勒姆市。2) 勒內(nèi)·笛卡爾大學(xué)INSERM UMRS 872,法國巴黎。3) Ciudad Real綜合醫(yī)
2、院病理部, 西班牙。4) 馬薩諸塞州總醫(yī)院( Massachusetts General Hospital)病理部,馬薩諸塞州波士頓市。 5) GE醫(yī)療集團(tuán)綜合IT解決方案(GE Healthcare Integrated IT Solutions), 美國伊利諾伊州Barrington,演示人: Marcial García Rojo,,醫(yī)學(xué)數(shù)字成像與通信標(biāo)準(zhǔn),病理學(xué),病理學(xué) (了解疾病的依據(jù))是一門視覺現(xiàn)象豐富的醫(yī)療專業(yè)。
3、在放射學(xué)的引導(dǎo)下,它非常迅速地朝廣泛應(yīng)用數(shù)字圖像的方向發(fā)展。兩個專業(yè)的成像過程中存在明顯區(qū)別。調(diào)整當(dāng)前的DICOM標(biāo)準(zhǔn)以適應(yīng)病理學(xué)中獨(dú)特的成像方式。,現(xiàn)在,以前,醫(yī)學(xué)數(shù)字成像與通信標(biāo)準(zhǔn),病理學(xué)圖像,大體圖像: 活組織檢查、外科標(biāo)本、尸體解剖。視頻。顯微鏡圖像: 組織切片 (活組織檢查、細(xì)胞塊、尸體解剖)。染色和特殊技術(shù)。細(xì)胞學(xué)、分散。分子病理學(xué): FISH、CISH、 SISH (顯微鏡檢查)瓊脂糖凝膠。測序。,
4、掛號,患者信息/安排訂單,計(jì)劃程序,存儲大體圖像,存儲顯微鏡圖像(多模態(tài)),存儲報(bào)告,診斷站,多模態(tài)工作表完成獲取處理標(biāo)本,光學(xué)顯微鏡,報(bào)告,填寫訂單,醫(yī)學(xué)數(shù)字成像與通信標(biāo)準(zhǔn),DICOM 服務(wù)的一致性表示,獲取,顯示,打印,醫(yī)學(xué)數(shù)字成像與通信標(biāo)準(zhǔn),Medical images web service,Tools in image viewer,圖像的一致表示,,,病理學(xué)看到了什么:,檢查醫(yī)師看到了什么:,Annotate,原始圖像
5、,窗口層,翻轉(zhuǎn),放大,處理過的圖像,原始圖像,批注,醫(yī)學(xué)數(shù)字成像與通信標(biāo)準(zhǔn),DICOM 和病理學(xué),為病理學(xué)規(guī)定特殊的 DICOM 對象(“信息對象定義”)需要修改和/或擴(kuò)展,有兩個主要原因: DICOM模型沒有為成像樣本的描述或特定標(biāo)本與特定圖像的結(jié)合提供強(qiáng)大的機(jī)制。一些病理學(xué)相關(guān)圖像格式(整張切片圖像、多譜段圖像、流式細(xì)胞測量等)沒有可應(yīng)用的DICOM信息對象定義。,醫(yī)學(xué)數(shù)字成像與通信標(biāo)準(zhǔn),第26工作組,建立于2005年9月,有
6、兩個直接的目標(biāo):升級和擴(kuò)展用于描述病理學(xué)標(biāo)本(成像過程的主題)的數(shù)據(jù)模型。 創(chuàng)建一個在DICOM框架內(nèi)存儲、檢索和查看整張切片顯微鏡圖像的機(jī)制。,醫(yī)學(xué)數(shù)字成像與通信標(biāo)準(zhǔn),WG26. 參與者,來自歐洲、日本和美國病理學(xué)學(xué)會的代表。聯(lián)系HL7 解剖病理學(xué)、IHE-病理學(xué)和實(shí)驗(yàn)室特別興趣小組(如:歐洲對話科技合作計(jì)劃(European COST) IC0604)。,醫(yī)學(xué)數(shù)字成像與通信標(biāo)準(zhǔn),DICOM 增補(bǔ)版122,定義了一個標(biāo)本數(shù)據(jù)模
7、型,使其適合解釋病理圖學(xué)像所需的大量相關(guān)信息: 標(biāo)本類型,獲取標(biāo)本的程序,物理和化學(xué)處理,采樣和二次采樣的方法,等等。,醫(yī)學(xué)數(shù)字成像與通信標(biāo)準(zhǔn),統(tǒng)一概念,該《增補(bǔ)版》的一個重要部分是為主要概念確立統(tǒng)一的定義。標(biāo)本被定義為一個物理對象,實(shí)驗(yàn)室把它看作一個單離散的、可唯一識別的單元,是診斷工作流中一個或多個步驟的主體。處理過程各個層面上的對象(從新鮮的組織到由包埋組織制成的切片,或分散體)。 容器: 標(biāo)本(1個或多個)物理放置
8、的地方。桶、暗盒、玻璃小瓶和載玻片。,醫(yī)學(xué)數(shù)字成像與通信標(biāo)準(zhǔn),標(biāo)本的DICOM 模型,,標(biāo)本,物理對象,,容器,盒子、區(qū)、載玻片等,,子段從屬于,n,,準(zhǔn)備,步驟,收集、采樣、染色、處理,,圖像,,獲取于,1,,系列,,,1,,,n,,1,,,創(chuàng)建,,設(shè)備,模態(tài),1,n,,,,檢查,,包括,,患者,,1,,,接受,n,,1,,n,,來源,1,,包括,,包括,,1,n,,,n,,有,,,1,n,,1,,,有,,1,,,成分,鹽基、
9、,蓋玻片,n,醫(yī)學(xué)數(shù)字成像與通信標(biāo)準(zhǔn),兼容性,該《增補(bǔ)版》還論述了新標(biāo)本模塊和標(biāo)準(zhǔn)中當(dāng)前定義的標(biāo)本堅(jiān)定模塊之間的兼容性。決定:取消舊版的DICOM標(biāo)本鑒定模塊。,醫(yī)學(xué)數(shù)字成像與通信標(biāo)準(zhǔn),整張切片成像,獨(dú)特的挑戰(zhàn): 根據(jù)尺寸(它們可能包括數(shù)十億甚至數(shù)萬億像素)超過 1 GB 的壓縮文件/幻燈片。訪問功能模擬觀察物理顯微鏡載玻片的經(jīng)歷。,醫(yī)學(xué)數(shù)字成像與通信標(biāo)準(zhǔn),查看大型圖像,響應(yīng)用戶交互式命令,發(fā)送圖像數(shù)據(jù)的小型子集。推薦的解決
10、方案 :將這些整張切片圖像并入到DICOM標(biāo)準(zhǔn)中,以便實(shí)現(xiàn)互操作性和支持快速、動態(tài)的查看。,醫(yī)學(xué)數(shù)字成像與通信標(biāo)準(zhǔn),Universidades de Tampere y Helsinki,,Universidades de Tampere y Helsinki,,修訂的標(biāo)本模塊,增補(bǔ)版122 規(guī)定了“標(biāo)本模塊和修訂的病理學(xué)SOP類” 。DICOM增補(bǔ)版15添加了標(biāo)本的概念,但未明確指出標(biāo)本在DICOM信息模型中的位置,當(dāng)前的標(biāo)本鑒定處
11、于患者層。處于圖像層的新標(biāo)本模塊。鑒定構(gòu)成圖像直接主體的標(biāo)本(連同關(guān)鍵的標(biāo)本信息,如:說明、標(biāo)本血統(tǒng)及處理)是解釋圖像所必需的。,醫(yī)學(xué)數(shù)字成像與通信標(biāo)準(zhǔn),DICOM中的必要變化,標(biāo)本模塊已經(jīng)符合HL7 v2 SPM分段和HL7 v3草案的標(biāo)本域信息模型。檢查層的現(xiàn)有登陸號可以重新使用。不要求改變DICOM中的信息或真實(shí)世界模型。提供標(biāo)本相關(guān)信息的DICOM信息模型擴(kuò)展版。 從所有IOD中取消舊的標(biāo)本鑒定模塊。影響現(xiàn)有設(shè)備嗎?
12、多半沒影響,即便有影響的話,使用舊標(biāo)本鑒定模塊的實(shí)際設(shè)備也非常少。預(yù)期出現(xiàn)的問題極少。,醫(yī)學(xué)數(shù)字成像與通信標(biāo)準(zhǔn),模態(tài),模態(tài)工作表模態(tài)必須獲得標(biāo)本鑒定并將納入獲取的圖像中。病理信息系統(tǒng)為每個成像標(biāo)本提供標(biāo)本模塊的屬性(IHE概要) 。在放射學(xué)中,圖像主體是患者;在病理學(xué)中,圖像主體是來自患者的標(biāo)本。模態(tài)執(zhí)行過程步驟實(shí)驗(yàn)室信息系統(tǒng)可以得到每個標(biāo)本產(chǎn)生的圖像列表(IHE概要)。,醫(yī)學(xué)數(shù)字成像與通信標(biāo)準(zhǔn),DICOM中的虛擬切片,“作為
13、PACS賣方,我們將WSI看作是下一年的主要冒險(xiǎn)活動?!薄皬膾呙杵靼l(fā)送出的圖像已經(jīng)格式化,以便在PACS外有效分配,這對于病理學(xué)來說是非常重要的?!薄安±韺W(xué)PACS將對連接到查看用戶處的掃描裝置的 ‘直通流(through-streaming)’進(jìn)行管理。”(摘自Ralf Zwönitzer 2006年8月與WG26郵件發(fā)送清單成員的郵件通信),醫(yī)學(xué)數(shù)字成像與通信標(biāo)準(zhǔn),DICOM在病理學(xué)中的優(yōu)勢,組織:所有醫(yī)療專業(yè)醫(yī)療圖
14、像的中央儲存庫:PACS。集成電子健康記錄。適用于所有醫(yī)療圖像的查看程序。以下項(xiàng)目的獨(dú)立性 裝置制造商。專有的文件格式。,醫(yī)學(xué)數(shù)字成像與通信標(biāo)準(zhǔn),標(biāo)準(zhǔn): IHE參與者(Actors)及事項(xiàng)處理(Transaction),訂單放置物,訂單裝填物,訂單結(jié)果追蹤者,證據(jù)創(chuàng)建者,圖像顯示,獲取模態(tài),圖像檔案,圖像管理者,存儲模態(tài)圖像(RAD-8),存儲約定(RAD-10),訂單結(jié)果管理(RAD-3),提供模態(tài)工作,表(PAT-5),查
15、詢圖像(RAD-14),找回圖像(RAD-16),證據(jù)文件存儲(RAD-43),存儲約定,放置物訂單管理(RAT-1)裝填物訂單管理(RAT-2),過程預(yù)定,和更新(PAT-4),IHE-病理學(xué)工作流,醫(yī)學(xué)數(shù)字成像與通信標(biāo)準(zhǔn),病理學(xué)中DICOM執(zhí)行示例,醫(yī)學(xué)數(shù)字成像與通信標(biāo)準(zhǔn),結(jié)論,數(shù)字圖像和虛擬切片已經(jīng)普遍應(yīng)用于病理學(xué),主要適用于第二意見( second opinion)和繼續(xù)教育。對于現(xiàn)有標(biāo)準(zhǔn)來說,虛擬切片技術(shù)是一項(xiàng)重大挑戰(zhàn)。
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