遺傳性腫瘤科室會v1.1

1、二代測序助力 遺傳性腫瘤精準醫(yī)學,胡 元 華大基因腫瘤產(chǎn)品部,Cancer is a genetic disease — that is, cancer is caused by certain changes to genes that control the way our cells function, especially how they grow and divide. 《NCI-The G

2、enetics of Cancer》,,癌癥是一種基因病,· 除遺傳性腫瘤，所有惡性腫瘤（癌癥）的發(fā)生都是體細胞基因突變導致的。· 在人的一生中，腫瘤細胞是通過一系列進行性的改變而逐漸變成惡性的。,Genetics, Genomics and Cancer Risk Assessment: State of the art and future directions in the era of personaliz

3、ed medicine,人類基因研究史,,,腫瘤也會遺傳嗎？,各類腫瘤中遺傳性腫瘤的占比,AACR cancer progress report 2015,腫瘤的治療效果與發(fā)現(xiàn)時期有關(guān),癌癥防控：早發(fā)現(xiàn) 早診斷 早治療,Ref：WHO world cancer report,世界衛(wèi)生組織（WHO）- “ 抗擊癌癥 重在預防！”,1/3的癌癥可以預防1/3的癌癥可以根治1/3

4、的經(jīng)過治療可以長期生存,,,疫苗（宮頸癌疫苗，乙肝疫苗）生物制劑（胸腺肽、卡介菌多糖）,自檢血清學（CEA、CA199）影像學（X片、B超、CT）內(nèi)窺鏡（胃腸鏡）,病理診斷手術(shù)放療化療靶向治療,血清學（CEA、CA199）影像學（X片、B超、CT）內(nèi)窺鏡（胃腸鏡）,,傳統(tǒng)方法,,,,遺傳性腫瘤基因檢測,,基因科技,,,,根據(jù)腫瘤基因變異及免疫組庫情況，進行病情監(jiān)測并及時調(diào)整治療方案,無創(chuàng)腫瘤早早篩,基于基因

5、突變的精準檢測及個體化用藥方案,基因科技助力腫瘤精準預防,臨床基因檢測的方法,聚合酶鏈式反應(PCR：qPCR，dPCR，ARMS,……)熒光原位雜交技術(shù)(FISH)一代測序（Sanger sequencing）二代測序（Next-generation sequencing）,,如果將人生比作一本自傳，那么不同的基因檢測方法，就像不同的檢索方式，以此探索生命的密碼。,位點檢測是在目錄中檢索某個關(guān)鍵詞基因芯片是在全書中檢索某個

6、關(guān)鍵詞二代測序是在全書中檢索所有關(guān)鍵詞,臨床基因檢測方法的差別,腫瘤有遺傳性和散發(fā)性之分,美國癌癥學會（www.cancer.org） Brozek I et al. J Appl Genet 2009; 50(4): 379–384,‘第一次打擊’ 是胚系突變所有體細胞均成為雜合BRCA,‘第二次打擊’ 是腫瘤細胞的突變導致細胞失去雜合性,所有體細胞均為野生型,僅病灶處腫瘤細胞突變,,,與生俱來（胚系突變） VS 與時俱進（體細胞

7、突變）,由于遺傳性原因?qū)е碌娜旧w和基因異常，特別是常染色體及其上的基因，而使患某些腫瘤的機會大大增加，病理學上稱之為遺傳性腫瘤綜合征,,家族性/遺傳性腫瘤人群特征,· 僅用于初步判斷人群是否具有家族性/遺傳性腫瘤的特征。· 各種遺傳性腫瘤高危篩查人群的判斷需綜合臨床表現(xiàn)和權(quán)威指南的標準進行。,遺傳性乳腺癌卵巢癌綜合征,,遺傳性乳腺癌/卵巢癌相關(guān)基因在乳腺癌人群中的檢出情況,由于遺傳性原因?qū)е碌娜旧w和基因異常，特

8、別是常染色體及其上的基因，而使患某些腫瘤的機會大大增加，病理學上稱之為遺傳性腫瘤綜合征。,Nils et al. Dtsch Arztebl 2008; 105(41): 706–14 http://www.breastlink.com/blog/nimmi-s-kapoor-md-gene-tests-asbs/,,遺傳風險評估： 基因檢測,遺傳易感基因與乳腺癌/卵巢癌發(fā)病風險,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

9、,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,乳腺癌(31%-56%),卵巢癌(2%-19%),,,BRCA1 突變 BRCA2 突變,BRCA1,BRCA 2,BRCA1——定位于17q21，約10

10、0 kb，含有24個外顯子，其中第1、4號外顯子不編碼氨基酸，另外22個轉(zhuǎn)錄出7.6 kb mRNA，最終可編碼含1863個氨基酸的蛋白質(zhì)。而第11號外顯子較大，長3.4 kb。 已報道其突變位點多于1785個BRCA2——定位在13q12-13，有27個外顯子,僅編碼區(qū)就有11.4K。其中11號外顯子幾乎含編碼序列的一半，完整的BRCA2編碼3418個氨基酸的蛋白質(zhì) 。已報道其突變位點多于2011個,參考數(shù)據(jù)庫：http://res

11、earch.nhgri.nih.gov/bic/,BRCA1/2基因沒有熱點突變,遺傳性乳腺癌/卵巢癌,CA Cancer J Clin 2014;64:52-62.,遺傳性乳腺癌發(fā)病年齡較散發(fā)性乳腺癌發(fā)病年齡低隨著時間的發(fā)展，乳腺癌的死亡率逐漸下降50歲以上的人群，因為乳腺癌篩查技術(shù)的完善有效降低浸潤性乳腺癌發(fā)病率50歲以下人群發(fā)病率無明顯變化，死亡率下降緩慢,乳腺癌篩查有效降低浸潤性乳腺癌發(fā)病率，基因檢測是否可以降低遺傳性乳

12、腺癌發(fā)病率？,測位點還是測基因外顯子？,BRCA1基因共5592bp，外顯子+內(nèi)含子共81189 bp，其中2600+位點的變異可導致乳腺癌/卵巢癌風險上升。,Research Themes of HKU Department of Surgery http://www.surgery.hku.hk/research_div_br.php,遺傳性乳腺癌/卵巢癌基因檢測,檢測優(yōu)勢科學 可檢測遺傳性結(jié)直腸癌的14個易感基因，結(jié)合亞洲人

13、群遺傳數(shù)據(jù)庫及華大本地12000例樣本數(shù)據(jù)庫，綜合評估腫瘤風險精準 標準化的實驗操作工序和數(shù)據(jù)分析流程，直擊突變基因，準確率達99.9%全面 目標基因外顯子區(qū)域捕獲測序，全面覆蓋，查找突變基因便捷 僅需提供5mL外周血或2mL唾液即可完成檢測,遺傳性乳腺癌/卵巢癌基因檢測,檢測優(yōu)勢科學 可檢測遺傳性結(jié)直腸癌的14個易感基因，結(jié)合亞洲人群遺傳數(shù)據(jù)庫及華大本地12000例樣本數(shù)據(jù)庫，綜合評估腫瘤風險精準 標準化的實驗操作工序和數(shù)據(jù)

14、分析流程，直擊突變基因，準確率達99.9%全面 目標基因外顯子區(qū)域捕獲測序，全面覆蓋，查找突變基因便捷 僅需提供5mL外周血或2mL唾液即可完成檢測,遺傳性結(jié)直腸癌,Kenneth W Kinzler1,et al, Cell, 1996.,遺傳性結(jié)直腸癌相關(guān)綜合征,遺傳性結(jié)直腸癌基因檢測,檢測優(yōu)勢科學 可檢測遺傳性結(jié)直腸癌的14個易感基因，結(jié)合亞洲人群遺傳數(shù)據(jù)庫及華大本地12000例樣本數(shù)據(jù)庫，綜合評估腫瘤風險精準 標準化的實

15、驗操作工序和數(shù)據(jù)分析流程，直擊突變基因，準確率達99.9%全面 目標基因外顯子區(qū)域捕獲測序，全面覆蓋，查找突變基因便捷 僅需提供5mL外周血或2mL唾液即可完成檢測,APC基因突變的致病風險,APC基因突變的風險管理,遺傳性腎癌,,,,,,遺傳性前列腺癌,,Johns LE et al. BJU Int 2003;91:789–94.,先證者為一級親屬患癌風險,先證者為兄弟患癌風險,先證者為父親患癌風險,家族性,遺傳性,,BRC

16、A1/BRCA2表達對不同腫瘤發(fā)病風險的影響,,為您的健康保駕護航-華大基因遺傳性腫瘤基因檢測產(chǎn)品,腫瘤風險早檢測，未病先防保健康！一次檢測，指導一生預防！,,華大基因遺傳性腫瘤檢測覆蓋范圍及送樣比例,,華大基因遺傳性腫瘤基因檢測陽性率,,,,為您的健康保駕護航-華大基因遺傳性腫瘤基因檢測產(chǎn)品,準確率：99.99%，引領(lǐng)行業(yè)標準！,服務內(nèi)容：女性常見16種遺傳性腫瘤/男性常見15種遺傳性腫瘤適宜人群：患者、近親中有多個人患癌、患

17、癌近親的發(fā)病年齡小于50歲、近親中有同一人罹患多種癌癥。檢測樣本類型：外周血、唾液。服務周期：30個自然日配套服務：遺傳性腫瘤風險管理和健康指導、專業(yè)遺傳咨詢服務,*高風險人群進行遺傳性腫瘤相關(guān)基因的檢測十分必要，早檢測早預防！,,專業(yè)遺傳咨詢團隊-國內(nèi)領(lǐng)先,,,檢測流程,,,疫苗（宮頸癌疫苗，乙肝疫苗）生物制劑（胸腺肽、卡介菌多糖）,自檢血清學（CEA、CA199）影像學（X片、B超、CT）內(nèi)窺鏡（胃腸鏡）,病理診

18、斷手術(shù)放療化療靶向治療,血清學（CEA、CA199）影像學（X片、B超、CT）內(nèi)窺鏡（胃腸鏡）,,傳統(tǒng)方法,,,,遺傳性腫瘤基因檢測,,基因科技,,,,根據(jù)腫瘤基因變異及免疫組庫情況，進行病情監(jiān)測并及時調(diào)整治療方案,無創(chuàng)腫瘤早早篩,基于基因突變的精準檢測及個體化用藥方案,基因科技助力腫瘤精準預防,,無創(chuàng)腫瘤早早篩-ctDNA檢測,,無創(chuàng)腫瘤早早篩-ctDNA檢測,,華大基因發(fā)展歷程,,華大基因科研實力,截止20