豬NCOA1基因和ADAMTS1基因多態(tài)性及其與繁殖性狀相關性分析.pdf

1、核受體輔激活蛋白1(NCOA1)基因通過與結合到DNA上的核受體相互作用并增強轉錄活性，受到影響的雄激素受體、雌激素受體等受體在動物的生長發(fā)育和繁殖等生理過呈起到重要作用。含凝血酶敏感蛋白模體的去解聯(lián)金屬蛋白酶(ADAMTS1)是新發(fā)現(xiàn)的影響排卵數(shù)的基因。本試驗主要以豫南黑豬、杜洛克豬和大約克豬為試驗材料，對這兩種基因的多態(tài)性及其與繁殖性能的關系進行研究，以探討這兩種基因作為分子標記在豬育種工作中的應用。本實驗采用酚氯仿抽提法提取豬血和

2、豬毛囊基因組DNA。構建DNA池，進行NCOA1全基因測序，對豬NCOA1基因的遺傳變異位點進行篩選。應用PCR-RFLP技術，對3個品種346頭豬NCOA1外顯子和ADAMTS1基因的SNP位點G223A、T196C、T427C和ADAMTS1基因的SNP位點G72A進行群體遺傳學分析；并用SPSS17.0分析這4個多態(tài)位點對豬繁殖性狀的影響。主要研究結果如下：
　　 1.NCOA1基因遺傳變異分析根據(jù)提取的豬基因組DNA構建

3、DNA池，進行混合DNA池測序，發(fā)現(xiàn)住外顯子3、8和12中存在可能的多態(tài)位點，分別設計引物，應用PCR-RFLP技術檢測外顯子3、8和12中的3個SNP何點分別為G223A、T196C和T427C。測序結果表明，這3個SNP位點分別為G/A、T/C和T/C突變，3個位點都有2個等位基和3種基因型。遺傳變異分析發(fā)現(xiàn)，G223A位點A是優(yōu)勢等位基因(0.509)，優(yōu)勢基因型為AB型(0.624)，該位點處于Hardy-Weinberg非平衡

4、狀態(tài)，多態(tài)信息含量(PIC)、雜合度(He)、有效等何基因數(shù)(Ne)分別為0.375、0.500、2.000，屬于中度多態(tài)。T196C位點C是優(yōu)勢等(0.626)，優(yōu)勢基位基因型為CD型(0.460)，該位點處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)，PIC、He、Ne分別為0.359、0.468、1.881，屬于中度多態(tài)。T427C位點E是優(yōu)勢等位基因(0.652)，優(yōu)勢基因型為EF型(0.517)，該位點處于Hardy-Weinber

5、g非平衡狀態(tài)，PIC、He、Ne分別為0.351、0.454、1.831，屬于中度多態(tài)。將檢測到3個SNP位點與繁殖性能進行關聯(lián)分析。結果顯示：G223A位點各基因型間在總產(chǎn)仔數(shù)、產(chǎn)活仔數(shù)、出生窩重都表現(xiàn)差異極顯著(p<0.01)。T196C位點CC型與CD型基因型間在總產(chǎn)仔數(shù)、產(chǎn)活仔數(shù)差異不顯著(p>0.05)，CC型和CD型與DD型差異極顯著(p<0.01)，出生窩重CC型與CD型差異顯著(p<0.05)，CC型和CD型與DD型差異

6、極顯著(p<0.01)，21日齡窩重都表現(xiàn)差異極顯著(p<0.01)；T427C位點各基因型間在總產(chǎn)仔數(shù)、產(chǎn)活仔數(shù)差異極顯著(p<0.01)，出生窩重和21日齡窩重方面表現(xiàn)相同，均呈現(xiàn)EE型與EF型差異顯著(p<0.05)，與FF型差異極顯著(p<0.01)，EF型與FF型差異極顯著(p<0.01)。
　　 2.ADAMTS1基因遺傳變異分析在ADAMTS1基因的第7外顯子多態(tài)位點的區(qū)域內設計引物用來擴增含有插入片度的一段序列，

7、應用PCR-RFLP技術檢測多態(tài)性位點G72A。測序結果表明該SNP位點是G/A突變，存在2個等位基因，3種基因型。遺傳變異分析發(fā)現(xiàn)，G72A位點A是優(yōu)勢等位基因(0.633)，優(yōu)勢基因型為AB型(0.457)，該位點處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)，多態(tài)信息含量(PIC)、雜合度(He)、有效等位基因數(shù)(Ne)分別為0.357、0.465、1.868，屬于中度多態(tài)。將該多態(tài)性位點與繁殖性狀相關的生產(chǎn)數(shù)據(jù)進行關聯(lián)分析。結果顯示：

8、G72A位點各基因型間在總產(chǎn)仔數(shù)和產(chǎn)活仔數(shù)均表現(xiàn)為AA型與AB型和BB型差異極顯著(p<0.01)，AB型和BB型差異不顯著(p>0.05)，出生窩重和21日齡窩重都表現(xiàn)為差異極顯著(p<0.01)。
　　 3.根據(jù)單因素LSD法分析不同位點相同基因型以及對豫南黑豬、杜洛克豬和大約克夏豬繁殖相關性狀分析得到：大約克夏豬在總產(chǎn)仔數(shù)、產(chǎn)活仔數(shù)、出生窩重和21日齡窩重與豫南黑豬和杜洛克豬兩品種間整體呈現(xiàn)極顯著(p<0.01)，豫南黑豬