遠(yuǎn)緣雜交中不育基因復(fù)雜上位性的分析方法研究.pdf

1、不育基因的位置及其效應(yīng)的估計,是遠(yuǎn)緣雜交不育性機(jī)理研究中應(yīng)解決的重要問題之一。遠(yuǎn)緣雜交中很大部分雜種的不育性是由染色體上一系列基因控制的,不育基因間常常存在相互作用。本文建立了三種遺傳模型,對遠(yuǎn)緣雜交中不育基因的位置、效應(yīng)以及上位性效應(yīng)進(jìn)行估計。提出了模型參數(shù)估計的最大似然法和EM算法,用MonteCarlo模擬對模型的適用性、參數(shù)估計效果進(jìn)行了研究,并對水稻的一個種間雜交的回交群體和一個亞種間雜交的回交群體的分子標(biāo)記數(shù)據(jù)進(jìn)行了分析。結(jié)

2、果如下:1、構(gòu)建了針對不同群體不育基因上位性效應(yīng)的三種遺傳模型,分別為F2位點-位點模型、BC位點-區(qū)間模型和BC區(qū)間-區(qū)間模型。推導(dǎo)出完全標(biāo)記信息下重組率和不育基因效應(yīng)估計的公式,建立了參數(shù)的假設(shè)檢驗和多重檢驗方法。
　　 2、MonteCarlo模擬研究結(jié)果表明,三種模型對不育基因的位置、效應(yīng)及上位性效應(yīng)均具有很好的估計作用。似然比值(LR)的三維立體圖顯示不育基因所處位置具有最大似然值,對不育基因的位置和效應(yīng)檢測效果好。<

3、br>　　 3、用Bootstrap估計參數(shù)偏差、標(biāo)準(zhǔn)差和均方差,并用其判斷群體樣本容量、連鎖程度和不育基因效應(yīng)對參數(shù)估計效果的影響。結(jié)果顯示,三種分析方法中的各參數(shù)在樣本容量大、連鎖緊密和不育基因存活效應(yīng)低的條件下估計效果最好。
　　 4、利用BC雙區(qū)間分析方法對水稻種間(Oryzasativa/Oryzalongistaminata//Oryzasativa)和亞種間(Balilla/NTH//Balilla)回交群體的標(biāo)

4、記基因型數(shù)據(jù)進(jìn)行了研究。在亞種間檢測到第1、3、4、6、8、9、10、12號染色體上存在8個不育基因,分別為其命名為:Sa1、Sa3、Sa4、Sa6、Sa8、Sa9、Sa10、Sa12,具有上位性效應(yīng)的有11對。在種間檢測到第1、3、6、8、10、11染色體上存在7個不育基因,分別為其命名為:Sb1、Sb3、Sb6、Sb8、Sb10-1、Sb10-2、Sb11,具有上位性效應(yīng)的有5對。從種間和亞種間的5、11對基因的上位性效應(yīng)中發(fā)現(xiàn)上位