四個湖泊刀鱭和三種沼蝦的系統(tǒng)學研究.pdf

1、本研究選擇了我國易危經(jīng)濟魚種--刀鱭(Coilia ectences)和我國經(jīng)濟蝦種--羅氏沼蝦((Macrobrachium rosenbergii)、日本沼蝦(M nipponense)和祁連沼蝦(M qilianensis)為研究對象展開系統(tǒng)學研究。針對洞庭湖、鄱陽湖、巢湖和太湖四個湖泊中的刀鱭群體采用分子生物學技術(shù)研究群體間變異及分化，為相關(guān)職能部門提供基礎分子生物學參數(shù)；研究該物種的系統(tǒng)地理學和群體歷史。刀鱭的微衛(wèi)星引物尚未被

2、開發(fā)，本研究針對這問題運用生物素標記結(jié)合磁珠富集法開發(fā)了16對微衛(wèi)星引物，為日后的刀鱭研究工作奠定基礎。同時，針對三種沼蝦的遺傳差異，確立三者在長臂蝦科分類學地位，以期為資源管理及可持續(xù)利用作出貢獻。論文主要分為兩個部分：
　　 1.刀鱭隸屬于鯡形目鳀科鱭屬，是我國長江流域重要的經(jīng)濟魚類。近年來由于過度捕撈和水利工程，該物種處于瀕危狀態(tài)。以同為鱭屬的七絲鱭為外類群，選擇線粒體d-loop基因和cytb基因為遺傳標記，運用分子系統(tǒng)

3、學方法對長江流域洞庭湖、鄱陽湖、巢湖和太湖四個淡水湖泊群體79尾樣本進行。主要研究結(jié)論如下：
　　 1)四個湖泊刀鱭樣本線粒體控制區(qū)中存在長度異質(zhì)性，主要差異在于以38bp為單位的4-7個拷貝重復序列。
　　 2)基于線粒體控制區(qū)序列分析，通過構(gòu)建NJ、MP和ME系統(tǒng)發(fā)育樹，得到四個湖泊刀鱭群體間系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系為：主要分為四枝，但不呈現(xiàn)地理結(jié)構(gòu)。88.89％的洞庭湖群體個體在最早分化的一枝中出現(xiàn)，且在最晚分化的枝中未發(fā)現(xiàn)。

4、可見洞庭湖群體相較其它三個群體進化早。
　　 3)四個湖泊刀鱭群體的d-loop和cytb兩個基因分析對79尾樣本分別定義了70和30個單倍型，單倍型多樣度高。
　　 4)鄱陽湖群體在四個湖泊群體中具有最高的遺傳多樣度和單倍型多樣度，相比較而言，太湖群體則最低。
　　 5)四個湖泊刀鱭形成星狀系統(tǒng)發(fā)育譜系，顯示該物種過去經(jīng)歷了種群擴張。
　　 6)刀鱭的起源可能是在長江水系的中游地區(qū)，其生活形態(tài)據(jù)推測由長

5、江中游下降至近海地區(qū)攝食，再沿長江上溯回到干流及其附屬湖泊產(chǎn)卵。
　　 2.羅氏沼蝦(Macrobrachium rosenbergii)和日本沼蝦(M nipponense)已經(jīng)在我國得到廣泛的養(yǎng)殖，產(chǎn)生巨大的經(jīng)濟效益。祁連沼蝦(M qilianensis)是自然分布在我國甘肅省的土著蝦種，因其外部形態(tài)符合沼蝦屬的特征，而被前人歸入沼蝦屬。
　　 我們對這3種沼蝦的線粒體COⅠ基因序列進行研究，從甘肅、浙江等地分別采集

6、這三種沼蝦的樣本各10尾，共30尾，其中祁連沼蝦是野生樣本，而羅氏沼蝦和日本沼蝦都是養(yǎng)殖樣本。主要研究結(jié)論如下：
　　 1)在30個樣本COⅠ基因序列中共檢測到169個變異位點，占總變異的26.04％;共檢測到7種單倍型。
　　 2)3種沼蝦的核苷酸多態(tài)性分別為：羅氏沼蝦0.411％、日本沼蝦0.092％、祁連沼蝦0.031％。野生的祁連沼蝦遺傳多樣性遠遠低于養(yǎng)殖的羅氏沼蝦和日本沼蝦。
　　 3)三種沼蝦單倍型之

7、間的Kimura雙參數(shù)遺傳距離在19.87％～23.84％，三者之間的遺傳距離較大，提示三者均為有效種。
　　 4)用NJ法構(gòu)建的長臂蝦科的分子系統(tǒng)樹顯示：日本沼蝦和羅氏沼蝦與沼蝦屬的其它種類聚成一枝，而祁連沼蝦與同亞科的脊尾白蝦(Exopalaenon carinicauda)和長角長臂蝦(Palaemon debilis)較沼蝦屬另10種蝦的遺傳距離近，即祁連沼蝦與白蝦屬及長臂蝦屬聚成另一枝。因此，COⅠ序列的結(jié)果不支持祁連