山羊Agouti基因遺傳多樣性研究.pdf

1、本試驗根據(jù)GenBank上已發(fā)表的牛(X99691)、豬(AJ251837)和馬(AF288358)的Agouti基因序列設(shè)計引物，擴增山羊Agouti基因內(nèi)含子Ⅰ至外顯子Ⅳ序列片斷，測序拼接結(jié)果表明該片斷長度為5275bp，部分內(nèi)含子Ⅲ和外顯子Ⅳ序列已提交到GenBank，序列號為DQ058664，相應(yīng)氨基酸序列號為AAY85690。 測序拼接結(jié)果發(fā)現(xiàn)山羊Agouti基因序列上存在13個點突變，其中內(nèi)含子Ⅲ有12個，外顯子Ⅳ有

2、1個。依據(jù)所測序列拼接結(jié)果(內(nèi)含子Ⅰ至外顯子Ⅳ5275bp)來命名這些突變位點，分別為A1796C，C1802G，C4283T，G4306T,A4312C，A4391T，A4417T，A4483C，C4578G，A4815T，C4888T，A4900G和G5256T，其中G5256T突變引起蛋白質(zhì)氨基酸序列的改變，第128位纈氨酸變成甘氨酸(V→G)。 對于山羊Agouti基因C4888T位點，大部分地方山羊品種C等位基因頻率和

3、T等位基因頻率分布大體一致，結(jié)果表明，藏山羊、川東白山羊、陜南白山羊這三個品種的遺傳多樣性在該位點上較為相近，隆林山羊和雷州山羊的遺傳多樣性在該位點上較為相近。太行山羊C等位基因的基因頻率為0.8030，是各品種中C等位基因頻率最高的?；蛐筒町愶@著性檢驗表明，太行山羊與大多數(shù)山羊品種在該位點基因型頻率存在顯著或極顯著差異，說明太行山羊在C4888T的遺傳多樣性和其他山羊品種存在顯著不同。 在山羊Agouti基因G5256T位點

4、，除川東白山羊外，T基因在其余品種中均為優(yōu)勢等位基因，結(jié)果表明，川東白山羊和馬頭山羊在該位點的遺傳多樣性與其他山羊品種之間存在較大差異，貴州白山羊、宜昌白山羊、隆林山羊、貴州黑山羊在該位點上遺傳多樣性相似。從多態(tài)信息含量上可以看出，南方山羊品種遺傳多態(tài)性顯著高于北方山羊品種。 聚類結(jié)果表明，16個地方山羊品種可以大致分為三類，第一類為，馬頭山羊、川東白山羊、隆林山羊、宜昌白山羊、貴州黑山羊、貴州白山羊、承德無角山羊、內(nèi)蒙絨山羊；

5、第二類為，太行山羊、陜南白山羊、遼寧絨山羊、藏山羊、雷州羊、濟寧青山羊、都安羊；南江黃羊為培育品種單獨聚為一類。 山羊Agouti基因序列與牛、豬和馬的序列相似性分別為92﹪、65﹪、59﹪，同時發(fā)現(xiàn)山羊Agouti基因序列第1842位到第1977位的序列為插入序列，其片斷長度為136bp，該片段是山羊所特有的。 通過對8個不同物種Agouti基因外顯子序列進行序列聚類分析，結(jié)果表明，山羊和牛Agouti基因相似程度最高