中國荷斯坦奶牛6號(hào)染色體泌乳性狀QTL精細(xì)定位研究.pdf

1、泌乳性狀是奶牛最重要的經(jīng)濟(jì)性狀,也是奶牛遺傳改良計(jì)劃(DHI)關(guān)注的焦點(diǎn)。QTL定位的最終目標(biāo)就是確定影響性狀的相關(guān)的功能基因或挖掘出數(shù)量性狀核苷酸(QTN),以便更準(zhǔn)確的理解性狀形成的生理生化過程,提高遺傳改良效率。自從14年前國際上出現(xiàn)第一篇關(guān)于奶牛產(chǎn)量QTL的實(shí)驗(yàn)報(bào)道以來,國內(nèi)外很多科學(xué)家關(guān)注影響泌乳性狀的QTL。但是由于家系內(nèi)重組事件和標(biāo)記密度的影響,連鎖分析獲得的QTL區(qū)間比較大、定位精度較不夠高(一般QTL置信區(qū)間在20-3

2、0cM左右),難以為位置候選克隆服務(wù)。
　　 對(duì)中國荷斯坦奶牛群體進(jìn)行連鎖定位研究發(fā)現(xiàn)6號(hào)染色體上存在影響奶牛泌乳性狀的QTL,位于標(biāo)記BMS470附近,其置信區(qū)間達(dá)55-58cM,同時(shí)在定位群體中發(fā)現(xiàn)了8個(gè)Qq雜合型精英公牛家系。在此基礎(chǔ)上,本研究進(jìn)一步采用女兒設(shè)計(jì),收集8頭公牛后代女兒資料,群體規(guī)模從原來連鎖分析的746頭個(gè)體增加到918頭個(gè)體,從上述覆蓋QTL,的區(qū)域內(nèi)選擇14個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記(平均標(biāo)記密度約1cM),實(shí)施結(jié)合

3、連鎖不平衡信息與連鎖分析相結(jié)合的分析方法(LDLA)以充分利用當(dāng)前重組和歷史重組事件,考慮兩種情況下計(jì)算IBD概率,一種是基于14個(gè)標(biāo)記推斷單倍型概率(定義為法1),另一種是基于5個(gè)標(biāo)記作為滑動(dòng)窗口推斷單倍型(定義為法2)。驗(yàn)證了以前連鎖分析的結(jié)果,在BMS470附近確實(shí)存在影響泌乳性狀的QTL。對(duì)乳脂肪量性狀,揭示一個(gè)顯著的QTL位于6.5cM的區(qū)間(法1)和4.0cM的區(qū)間(法2)。而對(duì)乳蛋白量性狀,檢測(cè)到顯著性QTL位于3.0cM

4、區(qū)間(法1)和2.5cM區(qū)間(法2)。結(jié)果確定了以前連鎖研究的結(jié)果,且顯著縮小了QTL位置區(qū)間。在置信區(qū)間內(nèi)推薦KLF3,TMEM156,WDR19,RPL9,LIAS,UGDH,UEB2K,RBM47,NSUN7,RPL7A,APBB2,UCHL1,TMEM33,SLC30A9,CCDC4,YIPF7,GABRA2為位置候選基因。另外開發(fā)和利用WinQTLCart軟件分析遠(yuǎn)交動(dòng)物群體奶牛泌乳性狀分析,單家系分析驗(yàn)證了QTLexpres