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文檔簡(jiǎn)介
1、土壤微生物多樣性是指土壤微生物群落的結(jié)構(gòu)與組成的差異,一般可包括物種多樣性、遺傳多樣性、生態(tài)多樣性和功能多樣性.研究土壤微生物的多樣性,不僅有助于對(duì)微生物資源及生物多樣性的深入認(rèn)識(shí),豐富微生物資源庫(kù)和基因庫(kù),揭示微生物多樣性與土壤理化因子之間的關(guān)系,還可以篩選高效分解鉀礦物的細(xì)菌,為研究細(xì)菌對(duì)礦物的風(fēng)化及在土壤形成過(guò)程中的作用提供理論依據(jù)和實(shí)驗(yàn)材料.
采用16S rDNA克隆文庫(kù)構(gòu)建法及變性梯度凝膠電泳法(DGGE)對(duì)小龍
2、山(A)和后漢路(B)兩個(gè)土壤剖面不同深度樣品的細(xì)菌生物多樣性進(jìn)行了研究。結(jié)果表明,小龍山土壤剖面中細(xì)菌菌群歸屬于13大類(lèi)群,分別為α-,β-,γ-和δ-Proteobacteria(變形菌門(mén))、Acidobacteria(酸桿菌門(mén))、Actinobacteria(放線(xiàn)菌門(mén))、Chloroflexi(綠彎菌門(mén))、Firmicutes(厚壁菌門(mén))、Verrucomicrobia(疣微菌門(mén))、Bacteroidetes(擬桿菌門(mén))、Gemm
3、atimonadetes,Ktedonobacteria和OP10。其中優(yōu)勢(shì)菌群為γ-Proteobacteria、Acidobacteria、Actinobacteria、Firmicutes和Chloroflexi;在后漢路土壤剖面中細(xì)菌菌群歸屬于9大類(lèi)群,分別為甜,α-,β-,γ-和δ-Proteobactefia、Acidobacteria,Actinobacteria、Verrucomicrobia、Bacteroidetes
4、和Ktedonobacteria,其中菌群Proteobacteria、Actinobactcda、Acidobactcria為優(yōu)勢(shì)菌群.菌群Actinobactefia、Acidobacteria和γ-Peoteobacteda是兩個(gè)土壤剖面中共有的優(yōu)勢(shì)菌群。某些優(yōu)勢(shì)菌群隨著土壤剖面深度的變化而變化.小龍山土壤剖面中,菌群γ-Proteobacteria中的克隆子主要分布于剖面L2中;菌群Acidobacteria中的克隆子數(shù)量隨著深
5、度的增加而逐漸降低;菌群Actinobacteria中的克隆子主要分布于剖面L1和L2中,而在L3中克隆子數(shù)量則有顯著降低;而菌群Chloroflexi和Firmicutes中的克隆子則主要分布于剖面L3中。后漢路土壤剖面中,菌群Acidobaeteria和Verrucomicrobia中的克隆子數(shù)量隨著土壤剖面深度的增加有降低的趨勢(shì);菌群Actinobacteria中克隆子則在H2層數(shù)量最多;γ-Proteobacteria中的克隆子
6、主要分布剖面H3及H4中。DGGE分析結(jié)果表明,小龍山土壤剖面中的優(yōu)勢(shì)種群為Proteobacteria、Actinobacteria、Bacteroidetes、Acidobacteria、Firmicutes和Chloroflexi,其中Rhodoplanes、Pseudomonas、Serratia和Arthrobacter為優(yōu)勢(shì)菌屬.后漢路土壤剖面中的優(yōu)勢(shì)種群為r-Proteobaeteria、Bacteroidetes、Act
7、inobacteria和Acidobacteria,其中Pseudomonas、Serratia、Arthrobacter為優(yōu)勢(shì)菌屬。
主成分分析(PCA)表明,土壤pH、有機(jī)質(zhì)、有效性Fe和Al、土壤有效磷以及速效鉀能夠影響土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)。典型相關(guān)分析(CCA)分析表明,小龍山土壤剖面中菌群γ-Proteobactefia易受到土壤中活性鋁的影響(r=-0.8,P<0.05);Acidobacteria與土壤中有效磷含
8、量呈顯著正相關(guān)(r=0.99,P<0.05).后漢路土壤剖面中γ-Proteobacteria與土壤有效磷和速效鉀存在明顯的正相關(guān)(r=0.94,P<0.05;r=0.99,P<0.05).優(yōu)勢(shì)菌屬Arthrobacter在土壤礦物風(fēng)化的進(jìn)程中可能起了重要的作用。
采用缺鉀培養(yǎng)基通過(guò)稀釋平板法從上述土壤剖面中分離篩選到36株鉀礦物分解細(xì)菌,16S rDNA序列分析結(jié)果表明,36株細(xì)菌隸屬于菌群Firmicutes、Prot
9、eobacteria和Actinobacteria中的的9個(gè)菌屬,分別為Bacillus(芽孢桿菌屬)、Paenibacillus(類(lèi)芽孢桿菌屬),Dyella、Pantoea(泛菌屬)、Burkholderia(伯克霍爾德菌屬),Nocardioides(類(lèi)諾卡氏菌屬)、Isoptericola(白蟻菌屬)、Microbacterium(微桿菌屬)、Arthrobacter(節(jié)桿菌屬)。其中Bacillus、Paenibacillus
10、,Arthrobacter和Burkholderia為兩個(gè)土壤剖面的共有菌屬,表現(xiàn)出較豐富的物種多樣性。
菌株H17與Isoptericola屬的親緣關(guān)系最近,與同屬的6株模式菌株的16S rRNA基因序列的同源性為97.8%-99.6%。菌株H17細(xì)胞壁肽聚糖為L(zhǎng)-Lys-D-Asp,細(xì)胞壁糖為半乳糖、木糖和甘露糖,脂肪酸主要為anteiso-C15,0和iso-C15;0,主要極性脂為diphosphatidylgly
11、cerol、phosphatidylglycerol、phospholipids、phosphatidylinositol、phosphoglycolipid、glycolipid和lipid,主要萘醌為MK9(H4),未檢測(cè)到分枝菌酸,其G+C mol%為72.4%,與6株模式菌株的DNA-DNA雜交同源性為15.2%-45.6%。綜合這些結(jié)果,我們建議菌株H17為Isoptericola屬的一個(gè)新種,命名為Isoptericolan
12、anjingensis sp.nov..
搖瓶條件下,對(duì)來(lái)源于供試菌株L11(Bacillus),H5( Burkholderia),H15(Arthrobacter)的礦物分解能力進(jìn)行了研究,結(jié)果表明,培養(yǎng)30 d后接菌處理的發(fā)酵液中Fe、Si、A1含量分別比接滅活菌對(duì)照增加27.5-115、1.5-2.2和13-35倍。掃描電鏡(SEM)結(jié)果表明,接菌處理的鉀長(zhǎng)石礦物表面形成腐蝕坑,同時(shí)在鉀長(zhǎng)石表面形成了球形物和較小的
13、顆粒狀物質(zhì),對(duì)照處理的鉀長(zhǎng)石礦物表面比較平整;能譜(EDX)分析發(fā)現(xiàn),上述球形物和較小的顆粒狀物質(zhì)是Fe和Ca的氧化物,推測(cè)是在鉀長(zhǎng)石礦物表面形成的次生礦物.另外,還研究了菌株Q12對(duì)云母(黑云母、白云母和金云母)的風(fēng)化效應(yīng).ICP測(cè)定表明,接菌處理的溶液中Fe、Si、Al和K含量分別比對(duì)照增加9-173%、9-18%、10-310%和9-29%;SEM分析發(fā)現(xiàn),菌株Q12在云母表面形成生物膜,云母表面形成了絮狀、顆粒狀和針狀的物質(zhì),E
14、DX分析表明,這些物質(zhì)可能是形成的方解石、赤鐵礦等次生礦物;X衍射(XRD)結(jié)果表明,接菌處理可以使黑云母形成赤鐵礦和富鎂蒙脫石等次生礦物。另外,透射電鏡(TEM)觀(guān)察發(fā)現(xiàn),在菌株Q12細(xì)胞表面可以吸附一些礦物顆粒。
砂培試驗(yàn)表明,菌株Lll和H5能夠促進(jìn)鉀礦物的溶解,促進(jìn)水稻植株的生長(zhǎng)并提高水稻植株對(duì)鉀素的利用。SEM分析表明,菌株能夠在礦物表面和水稻植株根際定殖.在礦物表面或根表面形成圓球形、蔟狀、多面體、針狀等物質(zhì)。
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