黃東海細(xì)菌多樣性分析及其抗菌活性的初步評價.pdf

1、海底沉積物是最復(fù)雜的微生物棲息地,蘊(yùn)藏著豐富的細(xì)菌資源也是新型活性物質(zhì)的資源庫。本論文以我國黃東海近海海域37個站位沉積物樣品為研究對象,采用培養(yǎng)和非培養(yǎng)相結(jié)合的方法對我國黃東海沉積物的細(xì)菌物種資源及多樣性分布進(jìn)行調(diào)查,并對其抗菌活性進(jìn)行初步評價。
　　一方面利用純培養(yǎng)法從37份沉積物樣品中共分離得到561株細(xì)菌,選取421株進(jìn)行16S rDNA測序分析,分離菌株歸為4個門,48個屬,121個種。厚壁菌門17個屬,68個種,282

2、株,為主要優(yōu)勢類群。變形菌門:α-變形菌綱8個屬,13個種,39株;γ-變形菌綱6個屬,14個種,48株;β-變形菌綱1個屬,1個種,1株。擬桿菌門12個屬,16個種,29株。放線菌門4個屬,7個種,22株。優(yōu)勢菌屬包括芽孢桿菌屬(Bacillus)、嗜冷桿菌屬(Psychrobacter)、赤桿菌屬(Erythrobacter)等7個屬。另外有14株細(xì)菌與系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系最近的標(biāo)準(zhǔn)菌株16S rDNA序列相似度低于98％,可能為海洋細(xì)菌的

3、潛在新屬或新種。研究表明我國黃東海海域有著很高的細(xì)菌多樣性,可培養(yǎng)細(xì)菌數(shù)目黃海海域要高于東海海域,東海近岸海域要高于遠(yuǎn)岸海域。本論文獲得7株對大腸桿菌、枯草芽孢桿菌和金黃色葡萄球菌抗性較強(qiáng)的海洋細(xì)菌,其中芽孢桿菌屬( Bacillus)4株,短芽孢桿菌屬( Brevibacterium)、葡萄球菌屬(Staphylococcus)和類芽孢桿菌屬(Paenibacillus)各一株,為新型抗生素的開發(fā)提供了潛在微生物資源。
　　另一

4、方面使用illumina Miseq高通量測序技術(shù)對我國黃東海近海海域原核微生物群落結(jié)構(gòu)及多樣性進(jìn)行研究。37份沉積物樣品共獲得3771648條序列,序列的平均長度為252bp,按照相似度為97%劃分OUT,共得到22746個不同的OUT,經(jīng)過RDP數(shù)據(jù)庫比對分別歸屬于74個門,243個綱,469個目,736個科及983個屬。細(xì)菌中變形菌門、浮霉菌門所占比例相對較高,分別占樣品總數(shù)的44%、11.2%,其中γ-變形菌綱和δ-變形菌綱所占