雞卵細(xì)胞卵黃生成受體(VLDLR-OVR)基因多態(tài)性檢測及其與雞蛋膽固醇含量的關(guān)聯(lián)性分析.pdf

1、本研究以絲羽烏骨雞為試驗(yàn)素材，研究與雞蛋膽固醇含量調(diào)控相關(guān)候選基因VLDLR/OVR基因的單鏈核苷酸多態(tài)性(singlenucleotidepolymorphisms，SNPs)及其與蛋品質(zhì)性狀之間的關(guān)聯(lián)性。
　　 首先，進(jìn)行蛋品質(zhì)性狀測定并采用高效液相色譜法測定雞蛋膽固醇含量，然后，提取雞翅靜脈基因組DNA，構(gòu)建DNA池，依據(jù)NCBI和Ensembl數(shù)據(jù)庫確定VLDLR/OVR基因5’-側(cè)翼區(qū)的堿基序列，進(jìn)行測序，對雞VLDL

2、R/OVR基因的遺傳變異位點(diǎn)進(jìn)行篩選。在此基礎(chǔ)上，應(yīng)用PCR-RFLP技術(shù)，對5’-側(cè)翼區(qū)的4個SNP位點(diǎn)g.8355T>C、g.9511G>A、g.9815C>G、g.10428T>C進(jìn)行群體遺傳學(xué)分析，并用SPSS19.0分析這4個多態(tài)位點(diǎn)與蛋黃膽固醇含量之間的相關(guān)性，從而為低膽固醇蛋雞品系的育種工作提供分子標(biāo)記。經(jīng)研究發(fā)現(xiàn)：
　　 1.構(gòu)建了雞翅靜脈提取的基因組DNA池，進(jìn)行極端性狀混合DNA池測序，在5’-側(cè)翼區(qū)中發(fā)現(xiàn)2

3、1個可能的多態(tài)位點(diǎn)。
　　 2.以極端性狀混合DNA池測序結(jié)果為基礎(chǔ)，應(yīng)用PCR-RFLP技術(shù)檢測5’-側(cè)翼區(qū)的4個SNP位點(diǎn)g.8355T>C、g.9511G>A、g.9815C>G、g.10428T>C。測序結(jié)果表明4個SNP位點(diǎn)分別是T/C、G/A、C/G、T/C突變，都有2個等位基因，3種基因型。
　　 3.經(jīng)卡方檢驗(yàn)表明，g.8355T>C、g.9815C>G位點(diǎn)處Hardy-Weinberg非平衡狀態(tài)，g.9

4、511G>A、g.10428T>C位點(diǎn)處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。遺傳多態(tài)性分析表明：g.8355T>C、g.9511G>A、g.9815C>G和g.10428T>C四個位點(diǎn)多態(tài)信息含量分別為：0.324、0.349、0.367和0.311，均為中度多態(tài)性位點(diǎn)，其中g(shù).9815C>G位點(diǎn)的多態(tài)性最高，變異程度最大?？傮w反映了該群體具有較為豐富的遺傳多樣性。
　　 4.統(tǒng)計(jì)分析表明，絲羽烏骨雞VLDLR/OVR基因5

5、’-側(cè)翼區(qū)中g(shù).9815C>G位點(diǎn)與蛋重(EW)、蛋黃重(YW)顯著關(guān)聯(lián)(P<0.05)，與蛋殼比例(ESR)極顯著關(guān)聯(lián)(P<0.01)；g.8355T>C位點(diǎn)與蛋殼重(ESW)顯著關(guān)聯(lián)(P<0.05)；但兩位點(diǎn)對蛋黃膽固醇含量和全蛋膽固醇含量均無顯著影響。g.9511G>A位點(diǎn)與蛋黃膽固醇含量和全蛋膽固醇含量表現(xiàn)為極顯著關(guān)聯(lián)(P<0.01)，與蛋黃顏色(YC)、蛋黃重(YW)表現(xiàn)為顯著關(guān)聯(lián)(P<0.05)。對選育低膽固醇蛋雞品系來說，