BSR-Seq方法定位玉米黃化突變基因.pdf

1、光合作用機制和葉綠體發(fā)育相關(guān)研究是生命科學領(lǐng)域的熱點問題，而葉色突變體是研究葉綠體形成和發(fā)育相關(guān)基因功能的重要材料。本實驗利用玉米自然突變產(chǎn)生的攜帶黃化突變基因的YL1001為材料，對其葉色性狀、葉綠體結(jié)構(gòu)、葉綠素含量、光合特性和遺傳特性等進行分析，并對黃化突變基因進行了定位研究。主要研究結(jié)果如下:
　　1.YL1001材料野生型表型與黃化突變表型分離比符合3∶1(野生型∶突變型=229∶83，X2＜X20.05=3.84，P＞0

2、.05），雙親正反交試驗結(jié)果表明突變性狀不受細胞質(zhì)遺傳物質(zhì)的影響;該突變表型受單個核隱性基因的控制。突變體植株在整個生活周期呈黃色，生長勢明顯弱于野生型植株，不能產(chǎn)生雌雄穗。
　　2.透射電子顯微鏡觀察發(fā)現(xiàn)，與野生型植株相比，突變體的葉綠體數(shù)目變少，葉綠體在細胞中的分布疏松不規(guī)則，淀粉粒結(jié)構(gòu)明顯減少，類囊體結(jié)構(gòu)排列松散。黃化突變體葉綠素a和葉綠素b的含量顯著低于野生型(P＜0.01)，分別為野生型的25.3％和25.7％。葉綠素熒

3、光參數(shù)測定發(fā)現(xiàn)，突變型和野生型植株的光合作用效率顯著有差異。
　　3.利用BulkedsegregantRNA-Seq(BSR-Seq)方法對突變基因進行定位，突變型和野生型兩個樣本池中共發(fā)現(xiàn)了343913個SNP位點，利用經(jīng)典貝葉斯算法將突變基因定位于玉米第五染色體12-14Mb的2Mb區(qū)間內(nèi)。
　　4.在第五染色體12-14Mb區(qū)段內(nèi)開發(fā)可用SSR標記，利用分離群體將黃化突變基因錨定在M50020和M50029兩個標記間