基于E-bayes的胚乳性狀QTL上位性的研究.pdf

1、禾谷類作物對(duì)于人類，尤其是亞洲大陸的居民來(lái)說(shuō)是不可缺的重要食材。而胚乳作為谷類作物種子的重要組成部分，其中含有豐富的蛋白質(zhì)，氨基酸，淀粉等等一系列人體必須的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)。因此進(jìn)行胚乳性狀的分析研究，對(duì)禾谷類作物產(chǎn)量提高和品質(zhì)改良是至關(guān)重要的。胚乳性狀的遺傳構(gòu)成與普通二倍體植物不同，是由兩個(gè)極核和一個(gè)精核結(jié)合發(fā)育形成的三倍體，因此胚乳的遺傳成分更為復(fù)雜。胚乳性狀QTL可分解出三種遺傳效應(yīng)：加性效應(yīng)，第一顯性效應(yīng)和第二顯性效應(yīng)。目前，雖然很多學(xué)

2、者提出了各種QTL定位研究方法，然胚乳性狀QTL上位性研究還較少。
　　本研究根據(jù)胚乳性狀三倍體倍性特點(diǎn)，提出了兩種胚乳性狀QTL定位的研究方法，即：在谷類作物 BC1.1（以 F1為父本，P1為母本的回交一代），BC1.2（以 F1為父本，P2為母本的回交一代）和F2群體中，基于多元方差分量模型對(duì)胚乳性狀QTL主效應(yīng)進(jìn)行研究；基于不同先驗(yàn)分布（逆卡方先驗(yàn)和指數(shù)先驗(yàn)）的經(jīng)驗(yàn)貝葉斯（E-bayes）統(tǒng)計(jì)方法，對(duì)胚乳性狀 QTL的上位

3、性研究，并通過(guò)計(jì)算機(jī)模擬加以驗(yàn)證。主要內(nèi)容如下：
　　1.對(duì)于胚乳性狀QTL主效應(yīng)分析，假設(shè)在同一環(huán)境下，隨機(jī)效應(yīng)（加性效應(yīng)，第一顯性和第二顯性）具有相同的方差，且與環(huán)境方差成比例，由此提出基于多元方差分量模型。仿真模擬研究表明，基于多元方差分量模型能夠準(zhǔn)確地定位各個(gè)QTL位置，并且有效地對(duì)胚乳性狀QTL加性效應(yīng)，兩類顯性效應(yīng)（第一顯性效應(yīng)和第二顯性效應(yīng)）進(jìn)行無(wú)偏估計(jì)。
　　2.對(duì)于胚乳性狀 QTL的上位性分析，基于兩種不同