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1、蘭州大學(xué)碩士學(xué)位論文DNA序列的圖形表示方法研究姓名:李偉申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:碩士專業(yè):物理化學(xué)指導(dǎo)教師:邱文元20100501蘭州大學(xué)碩士學(xué)位論文AbstractWiththedevelopmentofautomatedDNAsequencingtechniquesandthecompletionofaseriesofgenomesequencingprojects,alargenumberofDNAsequencedatahasbeena
2、ccumulatedintheDNAdatabasesHowtodealwiththeexplosivegrowthofimmensevolumegenomicDNAsequencedatebecomeanewchallengeandallimportanttaskforbio—scientistsButitisdifficulttoobtaininformationflomtheDNAsequencesdirectlyTherefor
3、e,manymethodshavebeenproposedtocharacterizeandanalyzeDNAsequencesInrecentyears,themethodofgraphicalrepresentationofDNAsequencehasdrawnwideattentionintheoryandapplicationThisthesisismainlyfocusongraphicalrepresentationofD
4、NAsequencesanditsapplicationThemaincontentsofthisthesiscanbesummerizeAasfollow:Inchapterone,basedontheintruductionofthebackgroundaboutthegraphicalrepresentationofDNAsequences,weintruducethebasicknowledgeofbionformaticsan
5、dthemolecularbiologyInchaptertwo,wegiveareviewofallkindsofgraphicalrepresentaionofDNAsequencesAlsointruducethesimilarityanddissimilarityanalysismethodbasedOilthegraphicalrepresentaionofDNAsequencesInchapterthree,weintrod
6、uceanovel3DgraphicalrepresentationofDNAsequencesbasedonthe2DgraphicalrepresentationofDNAsequencesproposedbyRandiceta1Basedonthegraphicalrepresentation,thetheanalysisofthesimilarities/dissimilaritiesamongthecodingsequence
7、softhefirstexonof3globingenesof11differentspeciesshowsthatthisapproachcanprovidesatisfactoryresultsIntheconstructionofthe3Dgraphicalrepresentation,weconsidermoreinformationincludingnotonlysequences’structurebutalsothecon
8、nectionofbasesinthetransferofdatafromaDNAsequencetoitsgraphicalrepresentation,andhencethesimilarities/dissimilaritiesanalysisofDNAsequencesbecomesmorereasonableItispossiblethatthisstudywillshednewlightonthedevelopmentofD
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