上海市醫(yī)院供水系統(tǒng)軍團(tuán)菌污染情況及嗜肺軍團(tuán)菌血清1型基因分型.pdf

1、第一部分上海市醫(yī)院供水系統(tǒng)軍團(tuán)菌污染調(diào)查
　　目的:了解上海市醫(yī)院供水系統(tǒng)管道中軍團(tuán)菌和阿米巴的污染情況,并分析供水系統(tǒng)軍團(tuán)菌污染的危險(xiǎn)因素。
　　方法:2009年5-9月采集上海市8家醫(yī)院供水系統(tǒng)管道末端水樣共193份,分別進(jìn)行軍團(tuán)菌和阿米巴的培養(yǎng),并使用軍團(tuán)菌乳膠凝集試驗(yàn)將所分離的軍團(tuán)菌進(jìn)行血清分型。在采集水樣的同時(shí),檢測(cè)水樣的水溫、pH值等指標(biāo)并收集醫(yī)院供水系統(tǒng)相關(guān)資料。
　　結(jié)果:在采樣的8家醫(yī)院中,7家醫(yī)院有

2、軍團(tuán)菌的定植,占87.5％。5家醫(yī)院的軍團(tuán)菌定植率超過(guò)30％(占總數(shù)的62.5％),2家醫(yī)院嗜肺軍團(tuán)菌的定植率超過(guò)30％(占總數(shù)25.0％)。共檢測(cè)水樣193份,軍團(tuán)菌屬培養(yǎng)陽(yáng)性的水樣共83份,陽(yáng)性率為43.0％,其中嗜肺軍團(tuán)菌陽(yáng)性的水樣33份,占全部陽(yáng)性水樣的39.8％。阿米巴培養(yǎng)陽(yáng)性的水樣共166份,陽(yáng)性率為86.O％。在軍團(tuán)菌陽(yáng)性的83份水樣中,濃度≥103cfu/l的水樣為63份,占陽(yáng)性總數(shù)的75.9％,濃度≥104cfu/l的

3、水樣為22份,占陽(yáng)性總數(shù)的26.5％,其中一份檢測(cè)到非1型嗜肺軍團(tuán)菌的水樣中濃度≥105cfu/1。從重癥監(jiān)護(hù)病房(ICU)采集的26份水樣中,11份(42.3％)檢測(cè)出軍團(tuán)菌,6份(23.1％)檢出嗜肺軍團(tuán)菌,2l份(80.8％)檢出阿米巴。ICU中檢測(cè)出軍團(tuán)菌的所有水樣其濃度均≥103cfu/l,7份水樣軍團(tuán)菌濃度≥104cfu/1。在軍團(tuán)菌污染危險(xiǎn)因素分析中,阿米巴的定植、無(wú)水管消毒、水管類型為鍍鋅鋼管及水箱間接供水都是獨(dú)立的危險(xiǎn)

4、因素。
　　結(jié)論:上海市醫(yī)院供水系統(tǒng)中軍團(tuán)菌污染常見(jiàn),且污染濃度高,存在發(fā)生醫(yī)院內(nèi)軍團(tuán)菌肺炎甚至暴發(fā)流行的嚴(yán)重隱患,建議對(duì)醫(yī)院供水系統(tǒng)軍團(tuán)菌污染情況和醫(yī)院獲得性軍團(tuán)菌病進(jìn)行監(jiān)測(cè),并研究具有可行性的供水系統(tǒng)去除軍團(tuán)菌污染的有效方法。
　　第二部分嗜肺軍團(tuán)菌血清1型基因基因分型
　　目的:將上海市5家醫(yī)院供水系統(tǒng)中分離的25株嗜肺軍團(tuán)菌血清1型(LP1)進(jìn)行基因分型,了解上海市醫(yī)院環(huán)境內(nèi)LP1的基因多態(tài)性,分析各家醫(yī)院之間

5、LP1基因分型的聯(lián)系和差別,并將3種基因分型方法的結(jié)果進(jìn)行比較。
　　方法:應(yīng)用脈沖場(chǎng)凝膠電泳(PFGE),基因測(cè)序分型(SBT)及重復(fù)序列聚合酶聯(lián)反應(yīng)(Rep-PCR)技術(shù)將5家醫(yī)院分離的共25株LP1進(jìn)行基因分型。PFGE和Rep-PCR結(jié)果用樹(shù)狀聚類圖表示相互聯(lián)系,SBT結(jié)果上傳至網(wǎng)站獲得相應(yīng)的菌株分型號(hào),通過(guò)菌株分型號(hào)比較相互聯(lián)系。
　　結(jié)果:PFGE分型將24株LP1(1株未分型)分為6型共10個(gè)亞型,其中流行株為

6、A、B、E共3型。SBT分型將25株菌株分為7型,其中最多的為ST-1和ST-780。ST-780和ST-784均為中國(guó)大陸的特有菌株型。2株LP1的asd序列未能與網(wǎng)站上所有序列匹配而未能獲得ST號(hào)。Rep-PCR分型將23株LP1分為A、B、C、D共4個(gè)區(qū)域,每個(gè)區(qū)中相似度大于98.6％的菌株屬于同一型軍團(tuán)菌,2株未分型。A區(qū)有11株LP1,分別來(lái)自于醫(yī)院1、2、6,以相似度98.6％分為7個(gè)不同的類型,而B區(qū)菌株主要來(lái)源于醫(yī)院5,

7、結(jié)合相似度和條帶分析共分為4型。3種基因分型均表明在上海市醫(yī)院供水系統(tǒng)內(nèi)存在LP1的主要流行株和散發(fā)株,不同醫(yī)院之間存在相同的基因型,而同一家醫(yī)院內(nèi)存在不同的基因型。3種基因分形方法中SBT和Rep-PCR的耗時(shí)最短,操作相對(duì)簡(jiǎn)單,且SBT分型獲得的結(jié)果穩(wěn)定可靠,不依賴于對(duì)圖形的判斷,分型準(zhǔn)確率高,并易于不同實(shí)驗(yàn)室之間的比對(duì),但價(jià)格昂貴。PFGE菌株的分辨率較高,SBT中分型一致的菌株在PFGE中還可以分為不同的亞型,但其耗時(shí)較長(zhǎng),操作