紅豆杉科的系統(tǒng)發(fā)育分析：來自三個(gè)基因組的證據(jù).pdf

1、紅豆杉科有5屬約21種，除單型屬澳洲紅豆杉屬僅分布于新喀里多尼亞島外，其它4屬均分布于北半球。單型屬白豆杉屬特產(chǎn)于中國。盡管該科植物的形態(tài)學(xué)、比較解剖、胚胎發(fā)育、孢粉學(xué)、植物化學(xué)等方面已進(jìn)行了大量的研究，但根據(jù)不同的性狀來研究其系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系所得出的結(jié)果差異較大。目前關(guān)于紅豆杉科的分子系統(tǒng)學(xué)研究已有報(bào)道，但還有許多問題亟待解決。本文試圖通過測定和分析該科及其近緣類群的DNA序列，進(jìn)一步探討紅豆杉科的屬間關(guān)系及其與其他類群的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。為

2、解決長期爭議的紅豆杉科及其近緣類群的系統(tǒng)發(fā)育問題提供可靠的分子證據(jù)。 本文選擇紅豆杉科、羅漢松科、三尖杉科、松科、杉科、柏科、金松科、枝葉杉科和南洋杉科共9科17屬32種植物，以核基因18SrRNA、葉綠體基因rbcL、matK、fps4和核糖體16S以及線粒體基因coxI作為分子指標(biāo)，采用鄰接法和最大簡約法，以松科冷杉屬和松屬作為外類群，分別測定了6套序列數(shù)據(jù)，并對(duì)這6套序列的合并數(shù)據(jù)進(jìn)行了分支分析并構(gòu)建分子系統(tǒng)樹，構(gòu)建了紅豆

3、杉科及相關(guān)類群的分子系統(tǒng)樹。不同分析方法構(gòu)建的系統(tǒng)樹略有差異，但大部分分支的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)是一致的，分子數(shù)據(jù)的合并能夠使系統(tǒng)分析的精確性得到提高。來自三個(gè)基因組基因序列合并數(shù)據(jù)的分析結(jié)果支持紅豆杉屬和白豆杉屬的姐妹群關(guān)系，穗花杉屬和榧屬的姐妹群關(guān)系，以及紅豆杉科形成一個(gè)單系，白豆杉屬和穗花杉屬是紅豆杉科的兩個(gè)自然屬，18S和matK系統(tǒng)樹支持澳洲紅豆杉屬與紅豆杉屬及白豆杉屬的關(guān)系更近；6個(gè)基因數(shù)據(jù)的獨(dú)立分析以及聯(lián)合分析都顯示出了三尖杉科與紅豆