海南漢族、黎族HLA基因多態(tài)性的研究.pdf

1、研究背景與目的：人類白細(xì)胞抗原(human leukocyte antigen，HLA)具有高度多態(tài)性，多態(tài)性是一個(gè)群體概念，指不同群體中HLA等位基因出現(xiàn)的頻率差異較大，如HLA-A2是世界范圍內(nèi)絕大多數(shù)民族常見的抗原，但在巴比亞新幾內(nèi)亞則不存在；又如HLA-A3、HLA-B7、HLA-DR1是白人中較為常見的抗原，但在東方人中頻率很低；東方人中常見的HLA-B46、HLA-DR9在白人中卻十分罕見。因此，HLA系統(tǒng)在人類遺傳學(xué)上成了

2、一個(gè)極好的群體標(biāo)志，可作為不同種群特征性的基因標(biāo)記，對(duì)研究種族起源、遷移、混雜具有重要的作用，同時(shí)HLA還是調(diào)控人體特異性免疫應(yīng)答和決定疾病易感性個(gè)體差異的主要基因系統(tǒng)，研究HLA的多態(tài)性，積累不同民族的HLA基因頻率和單倍型頻率資料，有助于尋找疾病易感基因，還可根據(jù)HLA的基因頻率推算出在一定數(shù)量的供者中找到HLA相同者的機(jī)會(huì)，據(jù)此建立骨髓供者庫(kù)，多態(tài)性的復(fù)雜還可為法醫(yī)學(xué)鑒定提供依據(jù)。
　　 傳統(tǒng)的HLA多態(tài)性分析采用的是血清

3、學(xué)分型技術(shù)，但血清學(xué)分型方法因其分型血清來(lái)源困難、存在交叉反應(yīng)、以及易受B淋巴細(xì)胞的純度與活力、補(bǔ)體質(zhì)量等因素的影響，用血清學(xué)分型方法可能得出錯(cuò)誤的結(jié)果，隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展，尤其是聚合酶鏈反應(yīng)技術(shù)(PCR)的發(fā)明以來(lái)，HLA多態(tài)性的研究已進(jìn)入DNA水平。
　　 因此本課題應(yīng)用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)一序列特異性引物( polymerasechain reaction-sequence specific primers，PCR-SSP

4、)技術(shù)對(duì)海南漢族、黎族HLA等位基因進(jìn)行分型，從基因水平上研究這兩個(gè)民族群體的HLA多態(tài)性，闡明其HLA等位基因分布特征，為研究海南漢族、黎族的起源、遷移、混雜及與其他民族的親緣關(guān)系提供有價(jià)值的遺傳學(xué)依據(jù)，并為進(jìn)一步開展HLA等位基因與海南地區(qū)高發(fā)疾病(如鼻咽癌、地中海貧血、Citrin遺傳缺陷病等)相關(guān)性、器官移植配型、法醫(yī)學(xué)等研究提供一套比較完整準(zhǔn)確的HLA-A、B、DRB1基因頻率參數(shù)。
　　 方法：
　　 隨機(jī)分

5、別采集3140名和301名3代以上均為海南當(dāng)?shù)貪h族和黎族健康、無(wú)血緣關(guān)系，年齡18～45歲的捐獻(xiàn)造血干細(xì)胞血樣者ACD抗凝血5ml，提取DNA，按試劑盒操作說明書擴(kuò)增特異性基因片段，擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)2％瓊脂糖凝膠電泳，在紫外凝膠成像系統(tǒng)觀察并記錄陽(yáng)性條帶，將陽(yáng)性條帶輸入試劑盒提供的分型軟件判讀分型結(jié)果，用SPSS13.0軟件統(tǒng)計(jì)分析各等位基因頻率，計(jì)算公式為基因頻率=1-(1-表型頻率)1/2，其中表型頻率是等位基因的檢出數(shù)除以檢測(cè)樣本總數(shù)，

6、并將海南漢族、黎族HLA-A、B、DRB1等位基因頻率與其他民族和地區(qū)的HLA等位基因頻率進(jìn)行比較。
　　 結(jié)果：
　　 1.在海南地區(qū)漢族人群中共檢出58種HLA-A、B、DRB1等位基因。其中HLA-A等位基因17個(gè)，HLA-B等位基因28個(gè)，HLA-DRB1等位基因13個(gè)。HLA-A基因座具有較高基因頻率的等位基因有(pi>0.1000) A*11、A*02、A*24、A*33，低頻率等位基因(pi<0.0010)

7、有A*23、A*66、A*34、A*69，未檢出的等位基因有A*25、A*36。HLA-B基因座高頻率等位基因(pi>0.050)為B*40、B*15、B*13、B*46、B*58，低頻率等位基因(pi<0.0010)有B*14、B*41、B*47、B*50、B*53、B*67，未檢出的基因有B*45、B*49、B*59、B*73。DRB1*15(0.1649)、DRB1*12(0.1414)、DRB1*04(0.1336)、DRB1*

8、09(0.1287)則是HLA-DRB1座位具有較高頻率的等位基因。與國(guó)內(nèi)其他漢族群體比較提示雖然有些等位基因的頻率存在顯著性差異，但海南漢族與福建漢族、廣東漢族、南方漢族、客家群體的常見HLA-A、B、DRB1等位基因頻率分布特征基本一致，A*11、B*46、B*58及DRB1*07分別呈現(xiàn)出由南向北和由北向南的遞減趨勢(shì)，提示海南漢族在HLA基因遺傳背景上歸屬于以廣東、福建漢族群體為代表的南方漢族，而與北方漢族則存在顯著差異。

9、　　 2.在301名海南黎族個(gè)體中檢出HLA-A等位基因11個(gè)，HLA-B等位基因20個(gè)，HLA-DRB1等位基因13個(gè)，其中HLA-A*11(0.3634)、A*02(0.2507)、A*33(0.1767)、A*24(0.1451)四個(gè)等位基因的頻率大于93％，是海南地區(qū)黎族群體中HLA-A基因座位的主要基因。HLA-B基因座最常見等位基因?yàn)锽*58(0.1972)、B*13(0.1788)、B*40(0.1278)、B*46(0

10、.1259)。HLA-DRB1座位檢出較高頻率的等位基因有DRB1*03(0.1808)、DRB1*15(0.1667)、DRB1*16(0.1627)、DRB1*09(0.1240)。未檢出的HLA-A座位等位基因有：A*25、A*34、A*36、A*66、A*68、A*69、A*74，未檢出的HLA-B座位等位基因有：B*18、B*41、B*45、B*47、B*49. B*50. B*57、B*59. B*67、B*73、B*81。

11、與南方漢族、廣西壯族等人群比較，海南黎族HLA-A*01、A*03、A*30、A*31、B*07、B*08、B*37、B*44、DRB1*01、DRB1*07呈現(xiàn)低頻分布，而HLA-A*11、B*46、B*58則具有較高頻率，分別呈現(xiàn)由北向南和由南向北遞減趨勢(shì)，與南方漢族及南方少數(shù)民族如壯族、布依族等人群呈現(xiàn)一致性。海南黎族與南、北漢族、壯族、布依族、傣族、維族、回族人群HLA-A、B、DRB1基因頻率比較差異皆有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義，但更接近于

12、南方漢族、壯族、布依族、傣族及回族。
　　 結(jié)論：
　　 1.海南漢族HLA等位基因分布特點(diǎn)提示海南漢族的群體遺傳背景總體上雖與南方漢族具有相似性，但可能在海南漢族形成的漫長(zhǎng)過程中同時(shí)還受到北方漢族的影響，以及由于環(huán)境變化、人群遷徙融合等因素致使其HLA基因分布形成自身特點(diǎn)。
　　 2.海南黎族在HLA分布上屬于南方民族類型，與西南少數(shù)民族壯族、布依族、傣族具有相似的遺傳基因背景，但可能黎族在進(jìn)入海南島之后，由于