藥物發(fā)現(xiàn)及靶向虛擬篩選的算法與程序設(shè)計(jì).pdf

1、作者首先對(duì)目前藥物發(fā)現(xiàn)虛擬篩選中現(xiàn)存的方法進(jìn)行了簡單的介紹及評(píng)述，指出了目前現(xiàn)有方法的不足及缺陷。作者在深入研究分子對(duì)接理論的基礎(chǔ)上，完成了三個(gè)藥物發(fā)現(xiàn)虛擬篩選的程序的開發(fā)與設(shè)計(jì)，并做了大量算例進(jìn)行了測(cè)試驗(yàn)證，其中的兩個(gè)程序已在國內(nèi)一些科研單位及高校得到了初步應(yīng)用。　　 作者建立基于信息熵的分子對(duì)接優(yōu)化模型，發(fā)展了多種群遺傳算法分子對(duì)接程序GAsDock，并對(duì)GAsDock的對(duì)接精度、篩選效率及對(duì)接速度進(jìn)行了測(cè)試及驗(yàn)證；與其它分子對(duì)接

2、軟件相比，GAsDock在對(duì)接精度上優(yōu)于現(xiàn)存的一些分子對(duì)接程序；另外，GAsDock在篩選效率方面較其他軟件有了明顯提高；GAsDock的計(jì)算時(shí)間與配體可旋轉(zhuǎn)鍵數(shù)目近似呈線性比例關(guān)系，能在保證精度的同時(shí)，更快地進(jìn)行大規(guī)模數(shù)據(jù)庫的搜索?！　∽髡邚姆聪蚪嵌人伎寄壳暗姆肿訉?duì)接及虛擬篩選，提出了一種新的藥物及靶標(biāo)的發(fā)現(xiàn)的方法。建立了含有309個(gè)藥物靶標(biāo)的藥物分子靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫MDTD及182個(gè)HIV相關(guān)數(shù)據(jù)庫HTD，并對(duì)MDTD及HTD進(jìn)行了系統(tǒng)