基于ITS及ndhF-rpl32序列的蕎麥多樣性研究.pdf

1、蕎麥（Buckwheat）是蓼科（Polygonaceae）蕎麥屬（Fagopyrum Mill）的雙子葉植物，由于其全面的營(yíng)養(yǎng)成分和藥用價(jià)值，使得蕎麥的產(chǎn)品、制品已經(jīng)深入到人們的日常生活。蕎麥作為一種小宗作物，目前在我國(guó)已命名的蕎麥共有23個(gè)種，其中，僅甜蕎和苦蕎兩個(gè)為栽培種，其余均為野生種，這些野生種大多分布在我國(guó)的西南地區(qū)。本研究基于核基因組中的ITS序列及葉綠體中的ndhF-rpl32序列對(duì)從我國(guó)西南地區(qū)收集到的10個(gè)（亞、變）

2、種及1個(gè)栽培苦蕎的變型共71份材料的遺傳多樣性進(jìn)行研究，主要結(jié)果如下：
　　1.蕎麥 ITS和 ndhF-rpl32序列的特征：在 ITS序列中，變異主要發(fā)生在 ITS1區(qū)和 ITS2區(qū)，其信息位點(diǎn)所占比率分別為38.5％和43%，而5.8S的信息位點(diǎn)僅占10.3%；在ndhF-rpl32序列中，信息位點(diǎn)占19.6%。由此可見，5.8S rDNA比較保守，其次為ndhF-rpl32序列，ITS1和ITS2的變異程度較高。
　

3、　2.依據(jù)ITS和ndhF-rpl32序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹：本研究通過2種不同的算法來構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹，分別為鄰接法和最大簡(jiǎn)約法，采用鄰接法構(gòu)建的2個(gè)系統(tǒng)發(fā)育樹都能將71份蕎麥材料分為大粒組和小粒組兩個(gè)類群，其中，大粒組類群包括栽培苦蕎、米苦蕎、野生甜蕎、栽培甜蕎、金蕎復(fù)合物。小粒種類群包括齒翅野蕎、疏穗小野蕎、小野蕎、密毛野蕎、細(xì)柄野蕎和硬枝萬年蕎。在大粒組類群中，金蕎復(fù)合物、栽培苦蕎(包括米苦蕎)、栽培甜蕎(包括野生甜蕎)又聚為三支；

4、在小粒組類群中，疏穗小野蕎可獨(dú)自形成一個(gè)分支，齒翅野蕎、小野蕎、密毛野蕎和細(xì)柄野蕎聚為一支。最大簡(jiǎn)約法構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹中，金蕎復(fù)合物、栽培甜蕎（包括野生甜蕎）、栽培苦蕎（包括米苦蕎）、疏穗小野蕎均可以單獨(dú)聚為一支，但并不像鄰接法能將71份材料分為兩大類群。兩個(gè)方法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹各有優(yōu)勢(shì)，鄰接法適用于遺傳距離較小，信息位點(diǎn)比例小的短序列；最大簡(jiǎn)約法適用于進(jìn)化速率相近，同時(shí)信息位點(diǎn)比例高的長(zhǎng)序列。
　　3.蕎麥屬植物的種間親緣關(guān)系：在

5、ITS和ndhF-rpl32序列中，無論是采用鄰接法還是最大簡(jiǎn)約法，結(jié)果都顯示，栽培苦蕎和金蕎復(fù)合物之間的親緣關(guān)系較栽培甜蕎與金蕎復(fù)合物之間的親緣關(guān)系更近。小粒組中的齒翅野蕎、小野蕎、密毛野蕎和細(xì)柄野蕎這四個(gè)種的親緣關(guān)系較近，這與它們?cè)谛螒B(tài)學(xué)上的表現(xiàn)一致。在大粒組中，栽培苦蕎的變異完全覆蓋了米苦蕎，這與米苦蕎僅是栽培苦蕎的一個(gè)變異類型相符合；同時(shí)野生甜蕎與栽培甜蕎的親緣關(guān)系較近。
　　4.大粒組蕎麥ITS2序列的SNP位點(diǎn)分析：從