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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:
初步探討EVI基因在兒童急性淋巴細(xì)胞白血病(acute lymphoblastic leukemia,ALL)中的致病機(jī)制。
方法:
l、收集2015年5月01日至2016年9月30日就診于青島大學(xué)附屬醫(yī)院血液兒科的30例新發(fā)ALL患兒的骨髓,就診時(shí)患兒年齡均小于16歲,同時(shí)收集6例正常兒童捐獻(xiàn)的骨髓作為正常對(duì)照。提取骨髓樣本的總RNA,熒光定量qRT-PCR檢測(cè)EVI1 mRNA的相對(duì)表達(dá)水平,比
2、較ALL患兒與正常對(duì)照之間EVI1 mRNA的表達(dá)差異。
2、選取年齡及病情相匹配的患兒2例,進(jìn)行EVI1基因(+)及EVI1基因(-)ALL患兒骨髓RNA行轉(zhuǎn)錄組基因測(cè)序,通過(guò)部分基因的差異性表達(dá)初步探索EVI1基因在兒童ALL中的致病機(jī)制。
結(jié)果:
1、對(duì)ALL患兒及正常兒童骨髓細(xì)胞的EVIl基因表達(dá)進(jìn)行了檢測(cè),患兒正常對(duì)照EVI1 mRNA表達(dá)水平從17.7到20.1,中位表達(dá)水平18.9;ALL患兒
3、EVI1 mRNA表達(dá)水平從0.75到4096,中位表達(dá)水平934.65;ALL和正常對(duì)照的EVI1 mRNA整體相比也有顯著差異(p=0.01)。并從中篩選出年齡性別病情相匹配且RNA標(biāo)本濃度適合轉(zhuǎn)錄組基因測(cè)序的標(biāo)本;
2、EVI1(+)ALL患兒EVI1基因有一長(zhǎng)度為638bp的轉(zhuǎn)錄版本,該轉(zhuǎn)錄版本在EVI1(-)的患兒中未見(jiàn)表達(dá);
3、將兩樣本差異表達(dá)基因數(shù)目進(jìn)行統(tǒng)計(jì),EVI1陽(yáng)性ALL患兒較EVI1陰性ALL
4、患兒共有1387個(gè)基因表達(dá)上調(diào),1097個(gè)基因表達(dá)下調(diào)。將上調(diào)基因進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)a.造血干細(xì)胞相關(guān)且被EVI1基因調(diào)控轉(zhuǎn)錄的基因包括GATA2、BCL-xL、C/EBPα;b.伴有EVI1陽(yáng)性的ALL中粒系相關(guān)基因表達(dá)明顯上調(diào),如MPO及CD34、CD13、CD33、CD116、CD114、CD124、CD125、CD126及 CD11b;c.EVI1陽(yáng)性ALL標(biāo)本中ECM受體表達(dá)明顯升高。
結(jié)論:
1、ALL患兒中
5、EVI1基因表達(dá)量比正常骨髓表達(dá)量明顯升高。
2、EVI1(+)ALL患兒EVI1基因有一長(zhǎng)度為638bp的轉(zhuǎn)錄版本,該轉(zhuǎn)錄版本在EVI1(-)的患兒中未見(jiàn)表達(dá);
3、EVI1陽(yáng)性ALL患兒與EVI1陰性ALL患兒相比共有1387個(gè)基因表達(dá)上調(diào),1097個(gè)基因表達(dá)下調(diào)。上調(diào)基因包括造血干細(xì)胞相關(guān)且被EVI1基因調(diào)控轉(zhuǎn)錄的基因(GATA2、BCL-xL、C/EBPα)、粒系相關(guān)基因(MPO、CD34、CD13、CD33
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