基于SSR標(biāo)記的中國水稻地方品種與選育品種遺傳多樣性研究.pdf

1、水稻是我國主要的糧食作物，充分利用我國豐富的稻種資源遺傳多樣性，拓寬育種親本的遺傳背景，對我國水稻生產(chǎn)具有重要意義。目前，對我國栽培稻遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)的研究很多，然而，運(yùn)用SSR標(biāo)記對稻種資源遺傳背景分析時，有關(guān)其引物數(shù)目及在染色體上的分布對結(jié)果有何影響的研究尚不明確，另外，針對地方品種與現(xiàn)代選育品種進(jìn)行統(tǒng)籌比較的研究也較為欠缺。本研究運(yùn)用多樣性參數(shù)、相關(guān)系數(shù)、標(biāo)準(zhǔn)誤、以及聚類分析相結(jié)合的方法，旨在明確分析亞洲栽培稻遺傳關(guān)系時需要的

2、最少SSR引物數(shù)目及其在染色體上分布特點(diǎn);以202份具有代表性的水稻品種為研究對象，利用均勻分布于水稻12條染色體上的98個SSR標(biāo)記，分析地方品種和選育品種的遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)，探討兩群體之間的遺傳分化，可有助于提高水稻遺傳多樣性研究在育種領(lǐng)域中的有效利用。主要研究結(jié)果如下:
　　1、以12為梯度，共選取10個梯度，運(yùn)用多樣性參數(shù)、相關(guān)系數(shù)、標(biāo)準(zhǔn)誤、以及聚類分析相結(jié)合的方法，確定在分析亞洲栽培稻遺傳多樣性及遺傳關(guān)系時，所需的最

3、少SSR引物數(shù)目及其對染色體分布的要求。研究結(jié)果表明，120對引物在69份試驗(yàn)材料中共檢測到1256個等位變異，每個位點(diǎn)的等位基因數(shù)（Na）差異較大，變化范圍為2～27，平均為10.5;平均基因多樣性指數(shù)(He)為0.760，變化范圍為0.412～0.951。
　　2、研究群體遺傳多樣性及遺傳關(guān)系時，引物在染色體上的分布對其分析無顯著影響。只有引物數(shù)目在72對以上，才能客觀地反映亞洲栽培稻的遺傳多樣性;只有當(dāng)引物數(shù)目在64對以上，

4、才能客觀亞洲栽培稻遺傳變異關(guān)系。
　　3、利用98個SSR標(biāo)記對202份中國水稻地方品種和選育品種的遺傳多樣性進(jìn)行比較分析。結(jié)果顯示供試品種具有較豐富的遺傳多樣性，共檢測到等位基因1350個，每個位點(diǎn)的等位基因數(shù)（Na）變化范圍為3～39，平均14個;Nei基因多樣性指數(shù)變化范圍(He)為0.125～0.955，平均0.733;多態(tài)信息量(PIC)變化范圍為0.122～0.953，平均0.680;稀有等位基因數(shù)(Nr)913個;等

5、位基因豐度(Rs)8.33。
　　4、栽培稻地方品種和選育品種遺傳多樣性差異明顯，地方品種等位基因數(shù)、Nei基因多樣性指數(shù)、多態(tài)信息量、稀有等位基因數(shù)和等位基因豐度(Na=1219，He=0.747，PIC=0.710，Nr=756，Rs=8.50)均高于選育品種（Na=919，He=0.704，PIC=0.650，Nr=529，Rs=7.01）。
　　5、各染色體組水平的遺傳多樣性分析表明，選育品種僅在1號染色體上的遺傳多