人工合成小麥SSR標記的遺傳多樣性及其與籽粒性狀的關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、人工合成六倍體小麥是一種新型六倍體小麥，是研究小麥進化過程中基因變異的重要材料，為利用小麥近緣種屬中的優(yōu)異資源，拓展并豐富小麥遺傳基因庫，進一步鑒定、挖掘和運用優(yōu)異基因創(chuàng)造了條件。本試驗以86份人工合成小麥品系和24份常規(guī)小麥品種組成一個自然群體，分別于2015年在楊陵（環(huán)境條件E1）和2016年在楊陵、三原、南陽（環(huán)境條件E2、環(huán)境條件E3、環(huán)境條件E4）調(diào)查了粒長、粒寬、粒厚、千粒重等籽粒性狀，并計算粒長/粒寬，利用分布于小麥全基因

2、組的365對SSR標記進行全基因組掃描，分析其遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)，把分子標記與表型性狀進行關(guān)聯(lián)分析。研究結(jié)果如下:
　　1.統(tǒng)計分析表明，人工合成小麥在2015年楊陵(E1)和2016年南陽(E4)的千粒重變異系數(shù)最大，粒厚的變異系數(shù)最小。人工合成小麥在四種環(huán)境條件下的5個籽粒性狀差異幾乎都達到極顯著水平(P＜0.001)。說明供試材料各性狀差異較大，具有豐富的多樣性。
　　2.全基因組掃描篩選了365對多態(tài)性SSR標記，

3、共檢測到了2187個等位變異，平均等位變異數(shù)為5.9918;基因多樣性變幅為0.1944～0.8612，平均值為0.7247;各引物的多態(tài)性信息含量（PIC值）變化范圍為0.1755～0.8452，平均水平為0.6848?；蚨鄻有院蚉IC值的最大和最小值均分別為引物gdm99、xgwm320。等位變異總數(shù)最高的是D基因組（1009個），最低的是A基因組（534個），體現(xiàn)為:D＞B＞A;基因多樣性和PIC值最高的均是D基因組，A基因組最

4、低。說明人工合成小麥的D基因組的遺傳多樣性比較高。
　　3.供試群體被劃分為7個亞群，其中，人工合成小麥被劃分為5個亞群，常規(guī)小麥被劃分為2個亞群，說明人工合成小麥和常規(guī)小麥的遺傳背景存在較大差異。
　　4.四種環(huán)境下均能檢測到與粒長、粒厚顯著關(guān)聯(lián)的標記各1個;只在三種環(huán)境下均能檢測到與粒厚顯著關(guān)聯(lián)的標記1個;只在兩種環(huán)境下均能檢測到與籽粒性狀顯著關(guān)聯(lián)的標記10個。這些顯著性標記為進一步挖掘優(yōu)異等位基因提供依據(jù)，為小麥分子標