甘薯莖線蟲誘導cDNA文庫的構建與ESTs分析.pdf

1、為了研究甘薯受莖線蟲侵染的分子和細胞機制并發(fā)掘與甘薯抗莖線蟲病相關的基因，本研究從北京市大興區(qū)收獲的病薯上分離得到甘薯莖線蟲，經(jīng)過純化并進行表面消毒，用打孔接種莖線蟲的方法，從高抗莖線蟲病品種魯薯3號、潮薯1號、濟114、濟寧10號以及皖薯 1 號等11 個甘薯品種中，篩選得到抗莖線蟲病擴展的品種魯薯3號、皖薯1號和潮薯1號。 以魯薯3號為材料，利用抑制差減雜交 (SSH) 的方法，構建了一個含有3024個克隆的正向差減文庫。對

2、3024個克隆進行菌液PCR擴增，從中篩選出1379個陽性克隆，然后進行測序，對測序成功的 ESTs 進行 Cluster 和 Blast 分析，共得到 185 個 unique ESTs，其中包括88個singletons和97個contigs。所有的unique ESTS在GenBank上進行Blast分析表明，149個ESTs推斷編碼的蛋白質與已知或推測的蛋白質氨基酸序列的相似性很高，其中72個ESTs與已知的甘薯ESTs有很高的

3、同源性；36個ESTs在GenBank中搜索不到同源基因，可能代表新基因。經(jīng)“Virluai”Northern blot分析表明，185個unique ESTs中94個是差異表達基因。根據(jù)G0功能分類方法，用Blast2go軟件對94個差異表達基因在細胞組分、生物學過程、分子功能三個方面進行分類，結果得到含有與植物抗線蟲基因蛋白酶抑制劑活性、抗線蟲基因保守區(qū)域絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶活性相關的EST，具有幾丁質酶、B-1，3-葡聚糖水解酶