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文檔簡介
1、DNA條形碼(DNA barcoding)是利用基因組中一段公認的標準的、相對較短的DN A片段來對物種進行鑒定,根據(jù)該片段具有足夠的種間變異、而種內變異相對穩(wěn)定而創(chuàng)建的一種新的生物身份識別系統(tǒng)。數(shù)量分類學是在20世紀50年代末期創(chuàng)立的一門學科,是一種客觀的、量化的、直觀的探討植物類群間親緣關系的現(xiàn)代方法。為了明確我國北方耐寒杜鵑資源的系統(tǒng)分類,同時探討杜鵑屬( Rhododend ron)內各亞屬的系統(tǒng)發(fā)育關系,本研究對北方耐寒杜鵑資
2、源4亞屬6種11個樣本的杜鵑屬種進行了ITS2片段和7條cpDNA片段序列測定,并使用基于形態(tài)學特征的數(shù)量分類學方法,對22種北方耐寒杜鵑資源及其近緣種進行了聚類分析。主要研究結果如下:
?。?)借助于NCBI數(shù)據(jù)庫中現(xiàn)有杜鵑屬的ITS2序列,以掃帚巖須和吊鐘花為外類群,對杜鵑屬9亞屬92種杜鵑的ITS2序列進行了分子系統(tǒng)學分析。結果表明:杜鵑屬是一個多系類群,各亞屬進化程度基本平衡;所分析的6種植物中照山白、迎紅杜鵑、杜鵑、羊
3、躑躅均聚在以各自亞屬種為主的大支中;毛枝杜鵑亞屬、糙葉杜鵑亞屬、迎紅杜鵑亞屬和杜鵑亞屬系統(tǒng)位置交錯,遺傳進化關系比較復雜;羊躑躅亞屬、葉狀苞亞屬均位于系統(tǒng)發(fā)育樹基部,符合形態(tài)學分類結果;馬銀花亞屬的長蕊組、馬銀花組與常綠杜鵑亞屬的常綠杜鵑組分別得到較高的支持,但常綠杜鵑組的亞組區(qū)分不明顯。
?。?)通過PCR反應在13條備選條碼中有7條可以擴增出序列,即:accD、matK、ndhJ、rbcL、rpoC、ycf5、rpoC1,這
4、7條序列的測序成功率均為100%。7條備選條碼中,rbcL、matK、rpoC1具有較好的區(qū)分效果,accD和rpoC需要與其他條碼組合才能有較好的應用效果。
?。?)應用SPSS18.0軟件,使用基于形態(tài)學性狀的數(shù)量分類法,將22種杜鵑屬植物聚類為3個大支和1個單支。在距離系數(shù)=17的水平線以下可作為亞屬的劃分界限,且對北方耐寒杜鵑資源及其近緣種具有較好的區(qū)分效果,但未能找到合適的距離系數(shù)對亞屬下等級進行劃分。
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