用于豬肉產(chǎn)品溯源的相關(guān)SNP的挖掘與引物篩選.pdf

1、我國是生產(chǎn)和消費(fèi)豬肉量最大的國家，豬肉是我國居民消費(fèi)的最主要肉類產(chǎn)品，對其建立有效的溯源系統(tǒng)，更是迫在眉睫。隨著當(dāng)代高通量測序技術(shù)的發(fā)展，DNA標(biāo)記已經(jīng)逐漸被用于肉類產(chǎn)品的溯源系統(tǒng)建立。在DNA標(biāo)記中，SNP(Single Nucleotide Polymorphisms)標(biāo)記，以其相對簡單且檢測成本較低，是一種可有效對豬肉產(chǎn)品進(jìn)行溯源的遺傳學(xué)方法。為種豬檔案庫建設(shè)所需，本研究選用我國最常用的商品豬種洛克、長白和大約克豬，對杜洛克、長白

2、和大約克豬個體身份的DNA識別進(jìn)行了研究。并提供了一種新的遺傳標(biāo)記——“多位點(diǎn)合并基因型DNA片段”，用于豬個體身份識別及其產(chǎn)品的溯源。
　　一、為了更多地挖掘可用于豬個體識別的SNP，共篩選了8對引物，PCR擴(kuò)增后將產(chǎn)物直接測序，得到了63個SNP。取雜合度≥0.10的SNP，這些SNP在不同品種中所組成的基因型數(shù)目不同，最終可用于實(shí)驗(yàn)中三個品種溯源的SNP，在杜洛克中有16個，在長白中13有個，在大約克中有17個，可組成131

3、220（杜洛克）、2160（長白）、6480（大約克）種基因型。以這些SNP為基礎(chǔ)的基因分型策略，足以應(yīng)用到飼養(yǎng)杜洛克豬的豬場進(jìn)行豬肉產(chǎn)品的個體識別或溯源。對于其他豬種，則需要獲得更多的SNP才能夠?qū)崿F(xiàn)。
　　二、為了檢測出足夠可用的SNP，提出了“多位點(diǎn)合并基因型DNA片段篩選”的方法，尋找可用于豬個體身份識別及其產(chǎn)品溯源的SNP?！岸辔稽c(diǎn)合并基因型DNA片段”較其他DNA標(biāo)記包含更多的SNP，產(chǎn)生更多不同的基因型，更有利于溯源