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1、肌內(nèi)脂肪含量(IMF)是影響豬肉品質(zhì)最關(guān)鍵的因之一。一般認(rèn)為,IMF越低,肌肉的多汁性、嫩度、風(fēng)味及總體可接受度越低。IMF的提高能夠很好的改善豬肉的感觀品質(zhì)和食用品質(zhì),因此,提高IMF已成為當(dāng)今畜牧業(yè)、尤其是遺傳育種領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。
本研究在前期SNP芯片分析的基礎(chǔ)上,選擇BMPER和FABP2基因作為候選基因,研究其啟動(dòng)子區(qū)變異與豬肌內(nèi)脂肪含量的相關(guān)性,并對(duì)突變位點(diǎn)的功能進(jìn)行驗(yàn)證和分析。
實(shí)驗(yàn)一驗(yàn)證了BMPER基
2、因啟動(dòng)子區(qū)兩個(gè)SNP位點(diǎn)與IMF的相關(guān)性。首先通過(guò)構(gòu)建DNA池及BMPER啟動(dòng)子區(qū)序列的PCR擴(kuò)增結(jié)合測(cè)序分析發(fā)現(xiàn)c.-1344 A>C與c.-1423 A>G兩個(gè)SNP位點(diǎn);采用PCR-SSCP技術(shù)對(duì)這兩個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行基因分型,結(jié)果顯示這兩個(gè)位點(diǎn)為連鎖的單倍型,且在三元雜交外種豬群體中只有AA/AA和GC/GC兩種基因型。其次通過(guò)對(duì)不同基因型個(gè)體的BMPER表達(dá)水平的分析、與IMF含量的關(guān)聯(lián)分析以及兩種單倍型的熒光活性分析結(jié)果顯示,AA/
3、AA基因型表達(dá)水平和IMF含量都顯著高于GC/GC基因型(p<0.05),且AA單倍型啟動(dòng)子活性也顯著高于GC單倍型(p<0.01)。
實(shí)驗(yàn)二采用同樣的方法驗(yàn)證了FABP2基因啟動(dòng)子區(qū)的SNP位點(diǎn)對(duì)IMF以及FABP2表達(dá)水平的影響。首先通過(guò)構(gòu)建DNA池作為擴(kuò)增FABP2調(diào)控區(qū)序列的模板并結(jié)合測(cè)序分析發(fā)現(xiàn)在FABP2啟動(dòng)子區(qū)存在c.-1488C>T, c.-1485G>A,c.-1471T>C,c.-1407T>C,c.-14
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