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文檔簡(jiǎn)介
1、本研究首先建立了湖北海棠SRAP標(biāo)記反應(yīng)體系,結(jié)果表明湖北海棠SRAP-PCR最佳反應(yīng)體系為:Mg<'2+>2.5mmol/L,Taq酶1.5u,dNTP0.3mmol/L,引物0.3umol/L,Bufferl×,DNA模板30ng,反應(yīng)總體積25uL。用優(yōu)化的體系對(duì)33份湖北海棠樣本進(jìn)行了擴(kuò)增分析,所用引物都能擴(kuò)增出清晰的譜帶,且多態(tài)性很強(qiáng)。因此,SRAP的引物組合在湖北海棠上適應(yīng)性很強(qiáng),SRAP適用于北海棠的遺傳多樣性研究,也適用
2、于其起源與分類(lèi)的研究。 從36對(duì)引物組合中選擇條帶清晰、多態(tài)性好的引物12對(duì)對(duì)供試33個(gè)基因型進(jìn)行擴(kuò)增,片段大小在300-2000bp,每對(duì)引物組合產(chǎn)生4-13條譜帶,多態(tài)性條帶占總帶數(shù)的91.225%。用1個(gè)引物不能將所有供試材料區(qū)分出來(lái)。33個(gè)基因型的相似系數(shù)在0.5104~0.9271,表明湖北海棠具有遺傳多樣性。 應(yīng)用UPGMA法進(jìn)行聚類(lèi)分析表明,在L=0.69時(shí),33份供試材料分為5個(gè)組,在L=0.63時(shí),分為
3、3個(gè)組;主坐標(biāo)分析顯示,33種供試材料分為5個(gè)組,除一個(gè)材料外,其余材料分組與聚類(lèi)分析L=0.69時(shí)分組情況相同。在聚類(lèi)的同一組里,有不同來(lái)源的湖北海棠樣品,而在同一來(lái)源地的湖北海棠又有的不能聚在同一組,用主坐標(biāo)分析有基本相同的結(jié)果,表明湖北海棠遺傳多樣性與地域性沒(méi)有對(duì)應(yīng)關(guān)系,類(lèi)似于居群內(nèi)遺傳變異規(guī)律。平邑甜茶源自山東,卻與源自神農(nóng)架的其它類(lèi)型聚在一起,可能是人為傳播的結(jié)果。 此外,供試材料雖有遺傳多樣性,但部分相似系數(shù)還是比較
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