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文檔簡介
1、由水稻條紋病毒(rice stripe virus,RSV)引起的水稻條紋葉枯病以及由革蘭氏陰性細菌黃單胞桿菌水稻變種(Xanthomonasoryzaepv.oryzae, Xoo)引起的水稻白葉枯病(bacterial leaf blight,BLB)是水稻生產(chǎn)過程中兩種重要的病害。盡管目前已經(jīng)就這兩種病害的防治和抗性品種的培育做了大量的工作,但病害依舊會悄悄卷土重來。從長期的實踐來看,培育新的抗病品種和挖掘新的抗病相關基因仍是控制
2、這些病害的最直接和最有效手段。水稻類病變突變體由于其類似于過敏性反應(hypersensitive response,HR)而出現(xiàn)的局部細胞死亡現(xiàn)象以及對于一些水稻病害的顯著抗性,使其成為水稻抗病分子研究過程中一個重要的工具。我們通過乙基甲磺酸(ethyl methane sulfonate,EMS)誘變的方式獲得了水稻突變體庫,并從中篩選獲得了兩株具有類病變表型的水稻類病變突變體,暫時分別命名為Z1834和Z1828。本實驗主要是分別
3、對這兩個水稻類病變突變體的目標基因進行了分子克隆,并初步分析了它們的功能。研究的主要內(nèi)容如下:
1.依據(jù)RAP-DB數(shù)據(jù)中心(http://rapdb.dna.affrc.go.jp/)的水稻基因序列信息分別克隆Z1834和Z1828這兩個突變體的候選基因,并通過構建超表達載體分別轉(zhuǎn)化Z1834和Z1828突變體材料,以期完成功能互補實驗。實驗結(jié)果表明,這兩個候選基因分別被確證為這兩個突變體的目標基因。其中,Z1834目標基因
4、位于9號染色體,無內(nèi)含子,片段長度為2772 bp,編碼一個抗性相關蛋白,基因序列中包含有一個NB-ARC結(jié)構域;而Z1828目標基因位于3號染色體,由11個外顯子組成,長2022 bp,編碼一個蛋白合成因子,序列中擁有RanBP2型鋅指結(jié)構域和延伸因子EF1A結(jié)構域。此外,Z1828目標基因于11號染色體含有一個同源度高達98%的同源基因。
2.通過構建含有GFP的融合表達載體,分別對兩個目標基因進行原生質(zhì)體細胞和煙草葉片細
5、胞的亞細胞定位。實驗結(jié)果表明,Z1834目標基因被定位于原生質(zhì)體細胞和煙草葉片細胞的細胞質(zhì)內(nèi)某一囊狀結(jié)構內(nèi),且呈晶體狀;而Z1828目標基因產(chǎn)物則廣泛分布于細胞膜、細胞質(zhì)以及細胞核內(nèi)。
3.分別提取兩個突變體材料的根、莖、葉和穗等組織中的RNA,并進行半定量PCR以便了解兩個目標基因的組織特異性表達情況。結(jié)果顯示,兩個目標基因在水稻各組織中均有一定量的表達,其中,Z1834目標基因在水稻根中的表達量相對較低,而Z1828目標基
6、因則在各組織中未見明顯差異。
4.利用實時熒光定量PCR實驗分別了解兩個目標基因在類病變表型出現(xiàn)前后的表達差異。實驗結(jié)果表明,在類病變表型出現(xiàn)之前,Z1834目標基因在突變體中的表達量與野生型材料未見明顯差異,但類病變表型出現(xiàn)之后,突變體材料中目標基因的表達則出現(xiàn)了明顯的升高;而Z828目標基因的表達量則恰恰相反,類病變表型出現(xiàn)前,其在突變體中的表達量稍高于野生型材料,但類病變表型出現(xiàn)后,突變體材料中目標基因的表達則出現(xiàn)了顯著
7、的下降,并低于野生型材料。
5.分別于幼苗期類病變表型未出現(xiàn)之前(T1)、幼苗期類病變表型出現(xiàn)之后(T2)以及成株期類病變表型完全出現(xiàn)(T3)等三個時期,對于野生型和突變體材料分別接種水稻白葉病菌P6小種,以了解兩個目標基因的誘導表達情況。結(jié)果顯示,Z1834目標基因同時受到物理損傷和Xoo侵染二者的影響。其中,T1期,Xoo的侵染能夠誘導目標基因表達量的上升,而T2和T3期,目標基因表達量未見明顯變化;Z1828目標基因則是
8、在整個T1~T3時期均未見明顯變化。
6.兩個突變體中PR基因的表達量分析顯示,Z1834突變體中,部分通路中的PR基因表達量顯著升高,但PR2、PR5以及PR9等卻出現(xiàn)了明顯的下降;Z1828突變體中,絕大部分PR基因均出現(xiàn)了明顯的上升。
7.TB(trypan blue,臺盼藍)和DAB(diaminobenzidine,二氨基聯(lián)苯胺)染色結(jié)果顯示,Z1834和Z1828突變體均在其葉片上的類病斑處出現(xiàn)了明顯細胞
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