我國(guó)沿海三疣梭子蟹9個(gè)野生群體的遺傳多樣性初步研究.pdf

1、通過(guò)形態(tài)學(xué)與分子生物學(xué)分析方法，對(duì)我國(guó)沿海三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)渤海的黃驊(HH)、濰坊(WF)，黃海的青島(QD)、連云港(LY)，東海的象山(XS)、莆田(PT)，南海的南澳(NA)、湛江(ZJ)、烏石(WS)合計(jì)9個(gè)群體進(jìn)行了比較研究，分析9個(gè)群體三疣梭子蟹的遺傳多樣性和親緣關(guān)系。 運(yùn)用聚類(lèi)分析，主成分分析和判別分析三種多元分析方法，采用9項(xiàng)形態(tài)比例參數(shù)，對(duì)我國(guó)沿海三疣梭子蟹9個(gè)野生

2、群體的形態(tài)差異進(jìn)行了比較。聚類(lèi)分析結(jié)果表明，渤海、黃海、東海6個(gè)群體先聚到一起，再與南海的南澳和烏石群體聚到一起，南海的湛江群體在系統(tǒng)樹(shù)的最外層，這說(shuō)明渤海、黃海、東海6個(gè)群體三疣梭子蟹的形態(tài)差異較小，而與距其地理位置較遠(yuǎn)的南海3個(gè)群體的形態(tài)差異較大。主成分分析結(jié)果表明，總方差的貢獻(xiàn)率分別是主成分1為37.00％，主成分2為26.70％，主成分3為10.53％，主成分4為7.72％，累積貢獻(xiàn)率為81.95％。判別分析結(jié)果表明，三疣梭子蟹

3、9個(gè)群體的形態(tài)存在一定的差異，判別準(zhǔn)確率P1為37.50％—100.00％，判別準(zhǔn)確率P2為57.14％—100.00％，判別效果依次為湛江群體>黃驊群體>南澳群體>莆田群體>濰坊群體>連云港群體>青島群體>象山群體>烏石群體，綜合判別率為74.83％。 通過(guò)對(duì)我國(guó)沿海三疣梭子蟹9個(gè)野生群體線粒體DNA控制區(qū)(putative control region，CR)基因片段和細(xì)胞色素氧化酶亞基Ⅰ(COⅠ)基因片段進(jìn)行擴(kuò)增和測(cè)序，分

4、別得到長(zhǎng)度為530 bp和584 bp的片段。分析結(jié)果表明：CR 83條序列A+T平均含量為73.2％，共檢測(cè)到91個(gè)變異位點(diǎn)，83個(gè)個(gè)體具有66種單倍型(haplotype)；COⅠ94條序列A+T平均含量為62.2％，共檢測(cè)到34個(gè)變異位點(diǎn)，94個(gè)個(gè)體具有34種單倍型(haplotype)。對(duì)9個(gè)群體用MEGA 3.1構(gòu)建NJ分子樹(shù)，聚類(lèi)結(jié)果顯示，黃海、東海、渤海6個(gè)群體之間的相對(duì)遺傳距離比較近，聚為一大支，南海3個(gè)群體相對(duì)遺傳距離

5、比較近，聚為一大支。AMOVA分析表明，群體間的遺傳分化指數(shù)(Fst為—O．0745～O．2709，其中部分群體間達(dá)到顯著差異(P<0.05)與極顯著差異(P<0.01)，說(shuō)明我國(guó)三疣梭子蟹不同野生群體間存在一定遺傳分化。 利用新型分子標(biāo)記SRAP(Sequence-related amplified pol ymorphism)對(duì)我國(guó)沿海三疣梭子蟹4個(gè)野生群體(青島群體、連云港群體，象山群體、莆田群體)進(jìn)行遺傳多樣性研究，從不

6、同引物組合中篩選出8組條帶清晰、多態(tài)性較豐富的引物組合，每對(duì)引物組檢測(cè)到的位點(diǎn)數(shù)為3-8個(gè)，青島、連云港，象山和莆田4個(gè)群體多態(tài)位點(diǎn)比例分別為52.38％、50.00％、42.86％、50.00％，平均雜合度分別為0.1827、0.1648、0.1515、0.1754。用Popgene 3.2軟件依據(jù)擴(kuò)增結(jié)果進(jìn)行了遺傳相似性度和遺傳距離分析，并構(gòu)建了分子系統(tǒng)樹(shù)，結(jié)果表明象山群體和莆田群體間的遺傳距離最小為0.0081，而象山群體和青島群