健康和腹瀉成年川金絲猴糞樣菌群比較分析.pdf

1、四川農(nóng)業(yè)大學(xué)專業(yè)碩士學(xué)位論文SichuanAgriculturalUniversityMasterDegreeDissertationComparativethefecalfloraofhealthanddiarrheaadultRhinopithecusroxellanaeDirectedbyNiXueqin(CollegeofVeterinaryMedicine，SichuanAgriculturalUniversityChengd

2、uSichuanChina，611130)June，2015四川農(nóng)業(yè)大學(xué)專業(yè)碩士學(xué)位論文摘要為探究腹瀉川金絲猴與健康川金絲猴腸道菌群差異，進(jìn)而更好保護(hù)川金絲猴，于2014年35月在成都動(dòng)物園采集健康成年川金絲猴糞樣15份、腹瀉糞樣15份(其中3月采集健康糞樣7份、腹瀉糞樣7份，進(jìn)行PCRDGGE初步比較分析)。對(duì)30份樣本應(yīng)用Ilkanina平臺(tái)進(jìn)行16srRNA高通量測(cè)序，以及ReaMhaaePCR技術(shù)對(duì)細(xì)菌總數(shù)，梭菌clusterI

3、V、梭菌clusterXIVa、普雷沃氏菌、乳桿菌、腸桿菌科進(jìn)行定量測(cè)定。結(jié)果如下：1PCRDGGE指紋圖譜顯示，腹瀉組與健康組相比，微生物多樣性指數(shù)(健康組387士002、腹瀉組387士001)、豐富度(健康組48士216、腹瀉組48士245)無(wú)顯著性差異；健康組與腹瀉組在聚類圖譜上明顯分為兩簇，相似性為078，健康樣本間相似性在O8l至086之間，腹瀉樣本間相似性在083至O92之間。216srRNA高通量測(cè)序結(jié)果：所有樣品平均每份

4、樣品檢測(cè)到189126527mgs數(shù)，其中健康組191726806和腹瀉組186526463差異不顯著。利用M劬啊計(jì)算在97％的相似水平上樣品的OTU數(shù)量，健康組OTU數(shù)量為2598971個(gè)，與腹瀉組(2367825個(gè))差異不顯著。健康成年川金絲猴糞樣菌群在門分類水平以FkniztItes、BaC鈀midetes為主。腹瀉組與健康組相比共有5種菌門、7種菌綱、8種菌目、19種菌科、28種菌屬有顯著性變化。F1exispka在屬分類水平平

5、均占343X10’04，總檢出率90％(健康組13115、腹瀉組14／15)。3ReagtimePCR結(jié)果：健康川金絲猴糞便菌群中細(xì)菌總數(shù)達(dá)514x1011eflffg，梭菌clusterⅪVa、梭菌clusterIV合計(jì)數(shù)量達(dá)21l1011cfu／g，占細(xì)菌總數(shù)41％。腹瀉組與健康組相比，細(xì)菌總數(shù)、梭菌clusterIV、梭菌clusterXIVa無(wú)差異；普氏菌屬有所降低，但差異不顯著；腸桿菌科顯著性升高，而乳桿菌屬顯著性降低。結(jié)論：