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文檔簡(jiǎn)介
1、紅樹(shù)林是分布于熱帶、亞熱帶海岸的潮間帶的木本植物群落,是海灘上特有的森林類(lèi)型。紅樹(shù)林生態(tài)系統(tǒng)具有高生產(chǎn)率,高歸還率,高分解率的“三高”特點(diǎn)。微生物是紅樹(shù)林生態(tài)系統(tǒng)中重要的生物組成成份,它在紅樹(shù)林生態(tài)系統(tǒng)的能量物質(zhì)循環(huán)中起著關(guān)鍵的作用。由于紅樹(shù)林生態(tài)系統(tǒng)處于咸淡水交匯的特殊環(huán)境,兼具海洋與陸地的性質(zhì),因而其中的微生物形成了獨(dú)特的生長(zhǎng)代謝調(diào)控機(jī)制和化學(xué)防御機(jī)制,其獨(dú)特的代謝產(chǎn)物也將成為我們獲取新型天然產(chǎn)物的資源寶庫(kù)。 首先,用不同的
2、針對(duì)鹵代酶基因設(shè)計(jì)的引物對(duì)分離自紅樹(shù)林土壤的放線(xiàn)菌進(jìn)行篩選,發(fā)現(xiàn)其中含有豐富的鹵代酶基因,且類(lèi)型多樣。由此推測(cè)這些放線(xiàn)菌具有產(chǎn)生類(lèi)型多樣的鹵代化合物的潛力。并對(duì)其中的幾個(gè)FADH2依賴(lài)型鹵代酶進(jìn)行表達(dá),試圖闡明其催化機(jī)制,但一直無(wú)法實(shí)現(xiàn)可溶性表達(dá)。 在對(duì)分離自紅樹(shù)林土壤沉積物的放線(xiàn)菌進(jìn)行鹵代酶基因篩選時(shí),發(fā)現(xiàn)MGR072菌株中的鹵代酶基因與Actinosynnema pretiosum subsp.Auranticum中鹵代酶基
3、因asm12的相似性為64%,另外用針對(duì)安莎類(lèi)抗生素起始合成酶AHBA合酶基因設(shè)計(jì)的引物對(duì)其進(jìn)行擴(kuò)增,發(fā)現(xiàn)AHBA合酶基因擴(kuò)增結(jié)果為陽(yáng)性。綜合以上結(jié)果,推測(cè)其中含有合成安莎類(lèi)抗生素的生物合成基因簇,構(gòu)建了其基因組文庫(kù),發(fā)掘出其中與安莎類(lèi)抗生素生物合成相關(guān)的約70Kb的基因簇。并對(duì)其培養(yǎng)條件進(jìn)行了初步的研究。 我們還構(gòu)建了含有至少260Mb紅樹(shù)林沉積物環(huán)境樣品DNA的沉積物宏基因組文庫(kù),并利用序列同源性驅(qū)動(dòng)篩選方法對(duì)其中所含有的N
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