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文檔簡介
1、聚酮類抗生素是由鏈霉菌生產的自然界中很重要的一類抗生素。在它的合成和釋放的過程中，硫酯酶發(fā)揮著重要的作用。它不僅能夠有效的催化抗生素產物的水解，同時還能夠校正抗生素碳鏈延伸中發(fā)生的錯誤，確保抗生素的產量。本文針對從NCBI數(shù)據庫中搜索到的鏈霉菌中的硫酯酶氨基酸序列，利用鄰接法和最大似然法對TE進行了系統(tǒng)發(fā)育分析，建立了鏈霉菌硫酯酶的進化發(fā)育樹，結果表明，鏈霉菌硫酯酶從氨基酸序列上可以分為三大類。另外，從構建的系統(tǒng)發(fā)育樹中發(fā)現(xiàn)，鏈霉菌中存
2、在一種acyl-CoATEⅡ，該類酶僅存在于五種鏈霉菌中。經過多種序列分析手段和結構分析發(fā)現(xiàn)，這些acyl-CoATE Ⅱ同真核生物TesB家族的acyl-CoA TE Ⅱ在序列和拓撲結構上都具有很高的保守性，并且在催化活性位點上完全保守。因此推測它們屬于TesB家族，并根據它們在PKS基因簇中的位置推測其功能為校正酶。 通過：PDB結構數(shù)據庫中不同pH值條件下苦霉素合成基因簇(PICS)TE和紅霉素合成基因簇(DEBS)TE的
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