檸條錦雞兒CBF-DREB1轉(zhuǎn)錄因子cDNA全長的克隆及生物信息學(xué)分析.pdf

1、溫度是制約植物生長及分布的重要生態(tài)因子之一，過低的溫度會(huì)使植物受到傷害。低溫是導(dǎo)致我國北方許多地方農(nóng)作物減產(chǎn)的重要因素。當(dāng)?shù)蜏貍Πl(fā)生的時(shí)候，CBF/DREB1(C-repeat/dehydration responsive binding factor/dehydration resistanceelement binding protein 1)基因被迅速誘導(dǎo)表達(dá)，激活各種抗寒機(jī)制及抗凍蛋白的轉(zhuǎn)錄翻譯，有效阻止了低溫對(duì)植物的傷害。

2、 本文利用簡并RT-PCR和RACE方法首次克隆了檸條錦雞兒(CaraganaKorshinkii Kom)CBF/DREB1基因cDNA全長序列。該序列全長996bp，包括615bp完整的開放閱讀框(ORF)，124bp的5'UTR，246bp的3UTR，加尾信號(hào)AATAAA及poly(A)11，起始密碼子ATG，終止密碼子TAA。對(duì)檸條錦雞兒CBF/DREB1氨基酸序列的生物信息學(xué)分析表明，該蛋白屬于CBF家族，具有AP2結(jié)合

3、域，且AP2域的兩端擁有CBF家族特有的PKK/RPAGRxKFxETRHP和DSAWR短多肽序列；有酸性氨基酸組成的潛在轉(zhuǎn)錄激活區(qū)域，存在核定位信號(hào)序列:無信號(hào)肽，無跨膜結(jié)構(gòu)，具有CBF家族保守的α螺旋區(qū)域和β折疊區(qū)域，主要存在于細(xì)胞核中。通過對(duì)檸條錦雞兒CBF/DREB1與其它植物來源的蛋白全序列及其AP2區(qū)域的比較發(fā)現(xiàn):AP2區(qū)域在雙子葉植物中高度保守，與檸條錦雞兒CBF/DREB1親緣關(guān)系最近的是大豆的GmCBF和勞豆的GsCB