IHOSDB：人類骨肉瘤基因與miRNA數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建.pdf

1、中圖分類號＆Z 三壁：!U D C 6 1 0博士學(xué)位論文學(xué)校代碼! Q 塾三密級 公開I H o S D B ：人類骨肉瘤基因與m i R N A 數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建I H o S D B ：D a t a b a s e f o r H u m a n o s t e o s a r c o m ar e l a t e d G e n e s a n d m i R N A s作者姓名：學(xué)科專業(yè)：研究方向：學(xué)院( 系、所) ：指導(dǎo)教師：

2、姜效韋臨床醫(yī)學(xué)外科學(xué)湘雅二醫(yī)院肖濤 教授論文答辯日期j 喇9 力緲答辯委員會主席蘊蘭多中南大學(xué)二。一三年五月摘要I H O S D B ：人類骨肉瘤基因與m i I 訊A 數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建目的：建立骨肉瘤相關(guān)領(lǐng)域的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫，為骨肉瘤分子機制研究提供一個重要的學(xué)術(shù)資源。材料與方法：對P u b m e d 數(shù)據(jù)庫中與人類骨肉瘤相關(guān)的文獻內(nèi)容進行基因和m i 烈A 的數(shù)據(jù)的挖掘，并從染色體分布、信號通路的富集等多個方面進行分析，并采用L

3、 i n u ) ( + A p a c h e + M y s Q L + D j a l l g o 框架構(gòu)建人類骨肉瘤基因與m i R N A 數(shù)據(jù)庫，進行W ．e b 發(fā)布。結(jié)果：通過文獻檢索及篩選獲取到與骨肉瘤基因相關(guān)文章有2 6 8篇，骨肉瘤m i 對蛆相關(guān)的文章1 4 篇，通過人工閱讀的方式我們從文獻中獲取到1 0 3 3 個骨肉瘤相關(guān)的基因以及5 3 個骨肉瘤相關(guān)的m i R N A 。經(jīng)過分析我們發(fā)現(xiàn)與人類骨肉瘤相關(guān)的

4、基因分布在幾乎所有的染色體上，其中有2 3 9 個基因分布在l 號染色體上。在人類骨肉瘤基因與m i I 蝌A 數(shù)據(jù)庫中3 1 ．6 ％的m i R N A 分布在1 4 號染色體上。1 4 號染色體中m i R N A 和基因占骨肉瘤相關(guān)基因和m i I 礬A 的百分比是最大的。其中4 1 ％的基岡富集在4 8 個K E G G 通路中。參與信號傳導(dǎo)相關(guān)通路、抗原遞成和細胞粘附等多種信號通路。人類骨肉瘤基因與m i R N A 數(shù)據(jù)庫