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文檔簡介
1、目的: (1)檢測NSCL/P患者和正常人體中MSX1基因表達情況變化和基因突變位點(2)分析MSX1基因編碼區(qū)外顯子后端和3’端部分非編碼區(qū)的基因突變與中國山西部分人群NSCL/P發(fā)病相關性方法: 1.從山西醫(yī)科大學第一醫(yī)院收集30例NSCL/P患者口腔裂隙處粘膜和30例正常人口腔粘膜做為對照組,用液氮迅速冷凍組織標本,采用TAKARA公司提供的RNA提取試劑盒提取組織基因組RNA。 2.設計引物,采用RT-P
2、CR技術,以從組織中提取出的RNA為模板,根據(jù)中心法則的補充理論,反轉錄PCR擴增產物,通過紫外成像系統(tǒng)記錄表達情況,進行統(tǒng)計分析。 3.對擴增出來的產物進行測序,測定MSX1基因編碼區(qū)外顯子后端和3’端部分非編碼區(qū)的基因序列,對每個測序結果與Genbank數(shù)據(jù)庫中所提供的序列進行比對,發(fā)現(xiàn)變異堿基位點并進行定位,計算每個變異位點的頻率,采用病例對照研究對每個變異位點基因的頻率進行統(tǒng)計學檢驗。 結果: 1.對MS
3、X1基因表達水平研究發(fā)現(xiàn),NSCL/P組中MSX1基因的表達水平(29.73±19.729)低于正常對照組(41.97±26.355),差異有統(tǒng)計學意義(P=0.007<0.05)。 2.MSX1基因編碼區(qū)外顯子后端和3’端部分非編碼區(qū)的基因序列進行擴增,比較測序結果后,顯示有5個位點的變異具有統(tǒng)計學意義,包括X17(TT/TC886)P=0.000<0.05,X25(AA/AT904)P=0.000<0.05,X26(GG/G
4、A912)P=0.002<0.05,X29(GG/GA1389)P=0.011<0.05,X30(GG/GAA1389)P=0.000<0.05。單因素分析后,對有統(tǒng)計學意義的結果采用年齡對照1:1配對分組的Logistic回歸分析,最后AA/AT904,GG/GAA1389的B值分別是-3.738,-22.181。 結論: MSX1基因編碼區(qū)外顯子后端和3’端部分非編碼區(qū)的基因突變與中國山西部分地區(qū)非綜合征性唇腭裂發(fā)生
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