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1、目的:應(yīng)用SELDI-TOF-MS(Surface Enhanced Laser DesorptionIonization Time of-flight Mass Spectrometry)技術(shù)分析喉癌患者與對照人群的血清蛋白質(zhì)譜,篩選喉癌患者血清的差異表達(dá)蛋白。利用人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(artificial neural network)建立SELDI蛋白分子診斷模型,以期構(gòu)建可用于喉癌早期診斷的敏感和特異的新方法。 方法:將采集的1
2、10份血清樣本,包括喉癌31例,對照組79例:聲帶息肉患者23例;喉癌癌前病變(包括喉白斑、有嚴(yán)重吸煙史的慢性肥厚性喉炎、喉乳頭狀瘤)11例及健康人45例,利用SELDI-TOF-MS技術(shù)及金芯片檢測血清蛋白質(zhì)譜數(shù)據(jù)。將獲得的蛋白質(zhì)譜圖用Ciphergen ProteinChip3.0軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)的校正和分析,采用Ciphergen Biomarker Wizard3.1軟件篩選喉癌患者與對照組差異蛋白。利用篩選的差異蛋白作為標(biāo)志物,結(jié)
3、合人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(ANN)技術(shù)建立預(yù)測模型。通過驗證和統(tǒng)計學(xué)分析,評價該模型用于喉癌診斷的價值。 結(jié)果:喉癌組與對照組有79個差異蛋白質(zhì)(P<0.05),其中差異有顯著意義的蛋白質(zhì)峰(t檢驗,分子量2000~20000 Da,P<0.01)共24個。其中在喉癌患者組中高表達(dá)的蛋白質(zhì)峰有15個,低表達(dá)的蛋白質(zhì)峰有9個。經(jīng)過反復(fù)訓(xùn)練,篩選其中9個明顯差異表達(dá)蛋白(質(zhì)荷比為9258、3153、2776、2114、2424、5927、26
4、50、2872、2537Da)建立的人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)診斷模型可將喉癌患者與對照組準(zhǔn)確地分組.當(dāng)cut—off值為0.25時靈敏度(SEN)為87.1%,特異度(SPE)84.8%,診斷指數(shù)為171.9%,其中區(qū)分喉癌與癌前病變準(zhǔn)確率為100%。 結(jié)論:SELDI-TOF-MS技術(shù)是一種操作簡單、方便快捷、樣本需要量少、敏感性高、特異性強(qiáng)的高通量的研究蛋白質(zhì)組學(xué)的方法。本研究篩選出的人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)蛋白質(zhì)分子診斷模型(質(zhì)荷比為9258、3
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