我國(guó)部分地區(qū)傷寒和甲型副傷寒沙門菌分離株的分子流行病學(xué)分析_1729.pdf

1、中國(guó)疾病預(yù)防控制中心碩士學(xué)位論文我國(guó)部分地區(qū)傷寒和甲型副傷寒沙門菌分離株的分子流行病學(xué)分析姓名：李偉申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：碩士專業(yè)：病原生物學(xué)指導(dǎo)教師：祁國(guó)明20030701其中一種。PPX4帶型從1999年出現(xiàn)后，近三年該帶型菌株數(shù)量有增多的趨勢(shì)。PPX2，PPX3兩種帶型可能只是在局部地區(qū)短期存在。只有4種不同的帶型，說(shuō)明我國(guó)甲副的流行起源于少數(shù)幾個(gè)克隆系的菌株，并在各地廣泛傳播而引起。勛eI和BlnI兩種酶酶切電泳后各自產(chǎn)生3種不同的帶型

2、，反映染色體上不同的遺傳信息及其變化，可以在進(jìn)行暴發(fā)分析及追蹤傳染源的研究中，作為XbaI酶切的補(bǔ)充或與XbaI聯(lián)合應(yīng)用。本研究對(duì)不同年代和地區(qū)的7株傷寒菌株和17株甲副菌株，進(jìn)行了管家基因mdh和侵襲相關(guān)基因spaO的測(cè)序比較。共得到8種不同的spaO基因序列和3種mdh基因序列。7株傷寒沙門氏菌的m砌基因完全相同，為mdhl型。而18株甲副菌株中，除浙江的菌株具有不同的mdh3型基因外，其余17株菌，包括對(duì)照株均具有相同的mdh2型

3、基因，包含的菌株占菌株總數(shù)的941％。mdh基因共有13個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)，堿基變異率為12％。spaO基因共有12個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)，堿基變異率為13％。spa01是spaO基因的主要類型，包含的菌株占總數(shù)的765％，在江蘇發(fā)現(xiàn)的spa04和浙江的spa02、spa03等位基因說(shuō)明這兩個(gè)地區(qū)存在著不同克隆系的甲副菌株。對(duì)25株甲副菌株進(jìn)行了ERICPCR擴(kuò)增，產(chǎn)生4種不同的帶型，有18株菌屬于EP4a型，占總數(shù)的72O％。對(duì)35株傷寒沙門氏菌的E

4、RICPCR擴(kuò)增發(fā)現(xiàn)，傷寒和甲副的ERICPCR帶型有明顯的不同，可分為6種帶型，以ET3和ET6兩種帶型為主，占總數(shù)的714％。ERICPCR操作相對(duì)簡(jiǎn)便，但實(shí)驗(yàn)重復(fù)性差，限制了該方法用于分析大量菌株以及不同實(shí)驗(yàn)室之間數(shù)據(jù)的比較。選擇2l株進(jìn)行了PFGE、ERICPCR、mdh、spaO基因測(cè)序的傷寒和甲副菌株，綜和應(yīng)用幾種方法(EP—S—M)進(jìn)行聚類分析。兩種血清型的菌株很明顯地聚為兩大類。整個(gè)漿類的相似性系數(shù)在822ioo％Z閫。

5、對(duì)幾種方法分型一致性的比較發(fā)現(xiàn)PFGE和EP—S—M綜合分析的方法一致性最高，達(dá)到了894％。ERICPCR與其他幾種方法的一致性最差。我們用PFGE、重要基因測(cè)序以及ERICPCR的方法，對(duì)部分分離于我國(guó)傷寒副傷寒高發(fā)省區(qū)的分離菌株進(jìn)行分子流行病學(xué)分析，初步獲得了我國(guó)重點(diǎn)傷寒副傷寒流行省份菌株的一些病原分子流行病學(xué)特征。為選擇合適的分子流行病學(xué)監(jiān)鍘方法提供了參考依據(jù)，通過(guò)以上研究，我t1]iA為不同方法相結(jié)合可從多個(gè)方面代表性地反映菌