基于復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)和社區(qū)探測方法的熱區(qū)預(yù)測方法研究.pdf

1、已有的研究表明,熱點是分布在蛋白質(zhì)界面上,但分布并不是均勻的,而是聚集在局部的緊密填充的區(qū)域,稱為熱區(qū)。熱區(qū)才是穩(wěn)定并協(xié)調(diào)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的關(guān)鍵因素,熱區(qū)的發(fā)現(xiàn)與界定對于揭示諸如細胞的代謝和信號傳導(dǎo)途徑、免疫確認、DNA復(fù)制、基因翻譯和蛋白質(zhì)合成等蛋白質(zhì)功能活動具有重要意義,因而如何有效地發(fā)現(xiàn)和預(yù)測熱區(qū)是一個值得研究的課題。
　　本文的研究重點是基于蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(PPIs)的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)特性和社區(qū)結(jié)構(gòu),結(jié)合社區(qū)探測方法

2、和熱點回收策略來預(yù)測PPIs的熱區(qū),提出了一種預(yù)測PPIs的熱區(qū)方法:HRPH(基于熱點的熱區(qū)預(yù)測,Hot Region Prediction Based on Hotspots)是基于熱點預(yù)測的結(jié)果集,根據(jù)熱區(qū)形成規(guī)則構(gòu)成初步的熱區(qū)預(yù)測集;在形成初步的熱區(qū)預(yù)測集后,利用社區(qū)探測方法探測熱區(qū)所在的社區(qū),然后通過熱點回收策略對初步結(jié)果集中的假陽性和假陰性殘基進行更正和回收,通過對初步得到的熱區(qū)結(jié)果集進行優(yōu)化獲得最終的熱區(qū)預(yù)測集。