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文檔簡介
1、越來越多的夫婦會面臨不孕不育的困擾。解決這個問題的基礎(chǔ)是在分子水平闡釋配子發(fā)生的分子機制,其中精子發(fā)生是一個極其復(fù)雜的細胞分裂和分化過程,從精原細胞的自我更新到正常精子的形成,任何一個環(huán)節(jié)發(fā)生錯誤都可能出現(xiàn)精子發(fā)生異常而導(dǎo)致不育。同其它蛋白質(zhì)修飾一樣,泛素化修飾對這一過程的調(diào)控是必不可少的。越來越多的證據(jù)表明各種泛素系統(tǒng)相關(guān)組分參與了精子發(fā)生的過程。本課題旨在利用蛋白組學(xué)技術(shù)發(fā)現(xiàn)小鼠睪丸精子發(fā)生中一些重要的泛素化修飾蛋白和泛素化相關(guān)酶,
2、建立并優(yōu)化針對泛素化修飾特異的蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定和定量技術(shù),有助于闡明精子發(fā)生的分子機制,并為臨床相關(guān)疾病的診斷治療提供候選分子靶標。
本研究首先利用非富集策略,對睪丸泛素化修飾蛋白與泛素化調(diào)控酶進行鑒定。通過比較不同的二維分離鑒定蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),發(fā)現(xiàn)第一維使用HP-RP(高pH反相分離)技術(shù)分離效果優(yōu)于SCX(強陽離子交換分離),肽段在不同分離組分中的分布比較均勻;此外,質(zhì)譜產(chǎn)生的蛋白定性信息比較多,大大提高了蛋白質(zhì)的可信度。H
3、P-RP分離技術(shù)可以與第二維低pH反相分離正交,用于復(fù)雜樣品的大規(guī)模鑒定。利用這一技術(shù)平臺構(gòu)建了小鼠睪丸蛋白表達譜系,單次實驗得到8511種蛋白質(zhì)和88207種不同肽段。我們分析了小鼠睪丸蛋白譜系中泛素化蛋白鑒定情況,結(jié)果只鑒定到109個泛素化位點對應(yīng)于76個底物蛋白。但是鑒定了274種泛素化酶(E1、E2和E3)和59種去泛素化酶(DUBs)。大量泛素化修飾調(diào)控酶的表達說明精子發(fā)生可能受到復(fù)雜的泛素化修飾調(diào)控。構(gòu)建了基于泛素化特征肽(
4、K-GG)富集策略的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)平臺,并成功應(yīng)用于小鼠睪丸精子發(fā)生中泛素化修飾蛋白的鑒定。與未經(jīng)富集的蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)相比,該富集策略可以大大提高泛素化肽段在質(zhì)譜儀器中的檢測效率。通過2次生物學(xué)重復(fù),一共鑒定到13717個泛素化修飾位點,對應(yīng)于4200種底物蛋白。生物信息學(xué)分析提示這些泛素化修飾蛋白質(zhì)與RNA轉(zhuǎn)運、代謝通路、泛素介導(dǎo)的蛋白水解、DNA的損傷修復(fù)、免疫反應(yīng)、內(nèi)吞作用、細胞周期及凋亡等通路相關(guān),該研究結(jié)果提示蛋白質(zhì)泛素化修飾
5、在精子發(fā)生的過程中可能發(fā)揮著重要的調(diào)控作用。為了尋找泛素化修飾定量方法,對蛋白組學(xué)定量技術(shù)進行了研究,構(gòu)建了TMT(串聯(lián)質(zhì)量標簽)與18O定量技術(shù)平臺。利用TMT定量技術(shù)研究了精原干細胞(SSC)增殖、遷移與分化相關(guān)的蛋白表達差異,并用western驗證了定量的準確性。探討了18O定量技術(shù)的標記效率、定量準確性,并利用18O定量技術(shù)與泛素化富集相結(jié)合的策略進行了泛素化修飾位點定量分析,為在睪丸中進行泛素化修飾特異的定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究奠定
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