基因MTNR1Brs1387153及基因KTL14rs972283的變異位點與中國北方人群T2DM的相關(guān)研究.pdf

1、2型糖尿病(type2diabetesmellitus，T2DM)是由多個基因與環(huán)境因子聯(lián)合作用而引起的疾病，具有較強的遺傳易感性。遺傳因素參與T2DM的發(fā)生，與環(huán)境因素相互疊加，共同導(dǎo)致T2DM的發(fā)生。其中T2DM的遺傳學(xué)研究，將為T2DM的早期識別、干預(yù)和個體化治療提供全新的思路。本研究通過選擇基因MTNR1B和基因KLT14上的2個SNP位點對2593例北方漢族人群進行病例-對照相關(guān)研究，尋找與T2DM相關(guān)的易感基因，探討T2DM

2、可能的遺傳病因。
　　 目的:探討基因MTNR1Brs1387153及基因KLT14rs972283突變位點頻率分布與中國北方地區(qū)人群的相關(guān)性。
　　 對象及方法:研究對象:均來自衛(wèi)生部北京醫(yī)院承擔的國家人類遺傳資源庫，從中選取得到2593例北方人群樣本。包括北京地區(qū)人群:病例組共926例，男性598人，女性328人，平均年齡55.31±12.34歲。對照組共1006例，男性450人，女性556人，平均年齡52.14±1

3、0.23歲。大連地區(qū)人群:病例組共327例，男性187人，女性140人，年齡54.28±11.21歲;對照組共334例，男性241人，女性93人，年齡58.38±14.2歲。選取的病例組排除其他內(nèi)分泌疾病，如肢端肥大癥、甲狀腺疾病、皮質(zhì)醇增多癥、結(jié)締組織病等。對照組均來自健康志愿者。本次研究將北方漢族人群進行總體的病例對照相關(guān)分析。然后分別以北京地區(qū)、大連地區(qū)人群為研究對象，進行年齡、性別、BMI分組研究。研究方法:提取有核細胞基因組D

4、NA，根據(jù)DNA序列設(shè)計引物，用多聚酶鏈反應(yīng)技術(shù)(PCR)擴增含有rs1387153及rs972283所需的片段，再分別用Dde1、XSP1內(nèi)切酶消化，以8％聚丙烯酰胺凝膠(PAGE)電泳分離酶切產(chǎn)物，檢測酶切結(jié)果。分別比較病例組和對照組中各位點的頻率分布，再分別以北京、大連兩地區(qū)為研究對象，將病例-對照組按年齡、性別、BMI分為三組，研究基因MTNR1Brs1387153及基因KLF14rs972283的頻率分布與北方人群以及北京、大

5、連兩地區(qū)人群的相關(guān)性。
　　 結(jié)果:
　　 1、MTNR1Brs1387153在北方人群中共檢測出純合型CC、雜合型CT、野生型TT三種基因型。在病例-對照組中頻率分布分別為:18.8％、35.2％、46.0％;53.7％、6.7％、39.6％。x2分別為:2.24、2.31、2.20;OR值分別為:0.41、0.25、0.32;95％CI分別為:0.32～0.84、0.61～0.93、0.43～0.90，各組P值均大于

6、0.05。MTNR1Brs1387153頻率分布與北方人群無相關(guān)性。
　　 2、KLF14rs972283在北方人群中共檢測出純合型AA、雜合型AG、野生型GG三種基因型。在病例-對照組中頻率分布分別為:58.5％、4.5％、40.0％;56.4％、5.0％、38.6％。x2分別為:1.83、2.25、2.31;OR值分別為:0.35、0.27、0.33;95％CI分別為:0.26～0.94、0.28～0.90、0.33～0.8

7、5，各組P值均大于0.05。故KLF14rs972283頻率分布與北方人群無相關(guān)性。
　　 3、基因MTNR1Brs1387153將北京、大連地區(qū)人群中的病例、對照組的年齡分為≤40、40-60、＞60三個亞組，檢測出的CC、CT、TT三種基因在年齡分組中各亞組的頻率分布分別為:北京地區(qū):≤40年齡分組中病例組為:3.1％、7.7％、8.9％;對照組為:9.9％、20.3％、29.8％;x2為:2.21、2.45、2.56;OR

8、值為:2.67、1.89、0.38;95％CI為:0.27～10.67、0.35～11.97、0.33～10.57;各組P值均大于0.05。40-60年齡分組中病例組為:8.0％、4.2％、27.6％;對照組為:6.1％、12.8％、13.6％;x2為:1.89、1.78、2.01;OR值分別為:0.78、1.65、0.44;95％CI分別為:0.29～09.97、0.30～11.87、0.28～09.85;各組P值均大于0.05。＞6

9、0年齡分組中病例組為::8.1％、10.3％、22.1％;對照組為:1.5％、2.9％、3.1％;x2分別為:3.02、2.34、3.23;OR值分別為:2.76、2.53、2.43;95％CI分別為:0.35～11.75、0.37～08.77、0.25～09.45;各組P值均大于0.05?；騇TNR1Brs1387153頻率分布與北京地區(qū)人群年齡分組無相關(guān)性。
　　 大連地區(qū):≤40年齡分組中病例組為:2.4％、6.7％、8

10、.9％;對照組基為:9.3％、5.7％、1.8％;x2為:2.13、1.79、2.31;OR值分別為:2.85、2.20、1.48;95％CI分別為:0.35～09.67、0.32～10.21、0.29～11.57;各組P值均大于0.05。40-60年齡分組中病例組為::3.4％、18.0％、15.9％;對照組為:18.3％、17.7％、3.3％;卡方值為:2.41、2.32、1.68;OR值為:2.17、2.61、0.48;95％CI

11、為:0.59～10.91、0.42～12.60、0.28～09.97;各組P值均大于0.05。＞60年齡分組中病例組為:1.6％、22.0％、21.1％;對照組為:22.6％、17.4％、3.9％;x2為:3.24、2.34、3.20;OR值為:2.76、2.10、2.42;95％CI為:0.55～08.97、0.34～09.05、0.45～07.45;各組P值均大于0.05。基因MTNR1Brs1387153頻率分布與大連地區(qū)人群年齡

12、分組無相關(guān)性。
　　 4、基因KLF14rs972283在北京、大連地區(qū)人群中的病例、對照組的年齡分為≤40、40-60、＞60三個亞組，檢測出的AA、AG、GG三種基因型在年齡分組中各亞組中頻率分布分別為:北京地區(qū):≤0年齡分組中病例組為:11.3％、1.1％、6.8％;對照組為:33.4％、2.9％、23.3％;x2為:1.89、2.68、2.56;OR值分別為:2.23、2.20、2.45;95％CI分別為:0.26～10

13、.41、0.30～08.22、0.25～09.55;各組P值均大于0.05。40-60年齡分組中病例組為:24.3％、2.12％、19.2％;對照組為:12.7％、2.0％、11.4％;x2為:2.09、3.34、2.65;OR值為:2.17、2.61、0.48;95％CI為:0.47～08.96、0.44～11.50、0.56～12.56;各組P值均大于0.05。＞60年齡分組中病例組為:21.6％、1.7％、11.9％;對照組為:3

14、.9％、1.4％、3.7％;x2為:3.04、2.51、3.17;OR值為:2.76、2.10、2.42;95％CI為:0.39～07.57、0.44～10.27、0.38～09.44;各組P值均大于0.05。
　　 大連地區(qū):≤40年齡分組中病例組為:5.2％、30.9％、29.1％;對照組為:2.1％、24.8％、16.3％;x2為:2.53、1.58、2.21;OR值為:2.44、2.33、2.76;95％CI分別為:0.

15、22～09.42、0.34～10.21、0.25～09.55;各組P值均大于0.05。40-60年齡分組中病例組為:0.6％、0.6％、2.4％;對照組為:2.1％、1.8％、1.2％;x2為:1.19、2.31、1.62;OR值分別為:2.09、1.78、2.46;95％CI分別為:0.41～08.91、0.32～10.12、0.28～07.52;各組P值均大于0.05。＞60年齡分組中病例組為:2.4％、13.2％、15.6％;對照

16、組為:22.8％、27.4％、1.5％;x2分別為:2.24、3.52、2.17;OR值分別為:2.06、2.09、2.27;95％CI分別為:0.30～08.47、0.38～10.09、0.40～11.45;各組P值均大于0.05?；騇TNR1Brs1387153頻率分布與北京、大連地區(qū)人群的年齡分組無相關(guān)性。
　　 5、基因MTNR1Brs1387153在北京、大連地區(qū)人群中的病例、對照組按性別分為男、女兩個亞組，檢測出的

17、CC、CT、TT三種基因型在性別分組中的頻率分布分別為:北京地區(qū):男性:病例組為:12.1％、23.0％、29.5％;對照組為:9.1％、15.1％、20.5％;x2為:1.98、2.04、3.21;OR值分別為:3.08、3.24、2.36;95％CI分別為:0.40～11.45、0.36～09.23、0.28～10.33;各組P值均大于0.05。女性:病例組為:7.1％、11.2％、17.1％;對照組為:9.3％、19.8％、26.

18、2％;x2為:2.68、2.98、3.05;OR值分別為:2.76、2.58、3.14;95％CI分別為:0.58～09.63、0.29～10.34、0.38～12.34;各組P值均大于0.05?；騇TNR1Brs1387153頻率分布與北京地區(qū)人群的性別分組無相關(guān)性。
　　 大連地區(qū):男性:病例組為:8.9％、20.3％、28.3％;對照組為:14.7％、28.4％、29.0％;x2為:2.74、3.09、2.24;OR值分

19、別為:3.08、3.29、3.24;95％CI分別為:0.23～10.45、0.36～09.23、0.28～08.33;各組P值均大于0.05。女性:病例組為:8.6％、17.4％、16.5％;對照組為:2.1％、9.6％、16.2％;x2為:2.26、2.88、3.15;OR值分別為:2.56、3.08、3.35;95％CI分別為:0.55～11.03、0.34～09.44、0.46～11.34;各組P值均大于0.05?；騇TNR1

20、Brs1387153頻率分布與大連地區(qū)人群的性別分組無相關(guān)性。
　　 6、基因KLF14rs972283在北京、大連地區(qū)人群中的病例、對照組按性別分為男、女兩個亞組，檢測出的AA、AG、GG三種基因型在性別分組中頻率分布分別為:男性:病例組為:36.7％、3.1％、23.4％;對照組為:26.2％、2.0％、17.4％;x2為:2.74、3.09、2.24;OR值分別為:3.08、3.29、3.24;95％CI分別為:0.23～

21、10.45、0.36～09.23、0.24～08.33;各組P值均大于0.05。女性:病例組為:20.2％、2.1％、14.4％;對照組為:30.3％、4.0％、20.2％;x2為:2.26、2.88、3.15;OR值分別為:2.56、3.08、3.35;95％CI分別為:0.55～11.03、0.34～09.44、0.46～11.34;各組P值均大于0.05?；騅LF14rs972283頻率分布與北京人群中的性別分組無相關(guān)性。

22、>　　 大連地區(qū):男性:病例組為:35.2％、2.8％、20.8％;對照組為:40.7％、3.0％、27.2％;x2為:2.55、3.19、2.08;OR值分別為:3.12、2.29、3.09;95％CI分別為:0.32～09.45、0.42～11.23、0.34～09.31;各組P值均大于0.05。女性:病例組為:28.1％、0.9％、12.2％;對照組為:17.9％、0.9％、10.3％;x2為:2.76、2.19、3.24;OR

23、值分別為:2.31、3.17、3.21;95％CI分別為:0.31～12.05、0.24～09.56、0.57～12.34;各組P值均大于0.05?；騅LF14rs972283頻率分布與大連人群中的性別分組無相關(guān)性。
　　 7、基因MTNR1Brs1387153將北京、大連地區(qū)人群中的病例組按BMI分為超重組BMI≥24，非超重組BMI＜24兩個亞組，檢測出CC、CT、TT三種基因型在BMI分組中各亞組中的頻率分布分別為:北京

24、地區(qū):超重組:16.6％、29.8％、40.2％;非超重組:2.6％、4.3％、6.5％;x2為:2.15、3.06、3.12;OR值分別為:3.11、2.98、3.33;95％CI分別為:0.35～10.36、0.27～11.22、0.28～10.36;各組P值均大于0.05。
　　 大連地區(qū):超重組:7.3％、4.9％、4.3％;非超重組:28.1％、33.6％、20.9％;x2為:2.20、3.16、3.02;OR值分別為

25、:2.11、3.05、2.34;95％CI分別為:0.25～09.35、0.22～11.31、0.29～10.43;各組P值均大于0.05。故MTNR1Brs1387153頻率分布與北京、大連地區(qū)中BMI分組之間無統(tǒng)計學(xué)差異。
　　 8、基因KLF14rs972283將北京、大連地區(qū)人群中的病例組按BMI分為超重組BMI≥24，非超重組BMI＜24兩個亞組，檢測出AA、AG、GG三種基因型在北京地區(qū)頻率分布分別為:超重組:49.

26、5％、4.1％、33.0％;非超重組:7.0％、1.5％、4.9％;x2為:2.24、3.07、3.14;OR值為:3.12、2.58、3.36;95％CI為:0.30～09.37、0.25～11.54、0.43～10.68;各組P值均大于0.05。基因KLF14rs972283頻率分布與北京地區(qū)BMI各亞組之間無相關(guān)性。
　　 大連地區(qū):超重組:14.9％、13.5％、9.8％;非超重組:21.7％、24.5％、15.6％;x

27、2為:2.35、3.04、3.22;OR值為:3.12、2.98、3.33;95％CI為:0.35～10.36、0.27～11.22、0.28～10.36;各組P值均大于0.05?；騅LF14rs972283頻率分布與大連地區(qū)BMI各亞組之間無相關(guān)性。
　　 結(jié)論:
　　 1、MTNR1B基因內(nèi)SNP138715C/T位點多態(tài)性與中國北方地區(qū)人群無相關(guān)性。以北京地區(qū)、大連地區(qū)兩個研究對象分別進行年齡、性別、BMI分組研