計(jì)算機(jī)輔助抗丙型肝炎病毒的新型化合物結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)研究.pdf_第1頁(yè)
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1、目的:丙型肝炎是由丙型肝炎病毒感染引起的病毒性傳染病,危害較大,治療困難,目前尚無(wú)有效疫苗進(jìn)行預(yù)防,是世界主要衛(wèi)生問(wèn)題之一。本論文對(duì)一系列具有抗丙型肝炎病毒活性的化合物進(jìn)行了研究,旨在構(gòu)建高效的計(jì)算模型,為設(shè)計(jì)和篩選具有抗丙型肝炎病毒活性的新型化合物結(jié)構(gòu)提供指導(dǎo)。
  方法:本論文運(yùn)用計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)方法對(duì)兩類(lèi)具有抗丙型肝炎病毒活性的化合物結(jié)構(gòu)進(jìn)行了相關(guān)研究。首先采用三維定量構(gòu)效關(guān)系方法構(gòu)建計(jì)算模型,分析影響化合物活性的重要結(jié)構(gòu)

2、特征,再運(yùn)用分子對(duì)接方法對(duì)化合物在活性位點(diǎn)部位的優(yōu)勢(shì)構(gòu)象進(jìn)行分析,初步探討作用機(jī)理。在此基礎(chǔ)上,設(shè)計(jì)和篩選具有抗丙型肝炎病毒活性的新型化合物結(jié)構(gòu)。最后,利用計(jì)算軟件OSIRIS Property Explorer對(duì)具有較高活性的化合物進(jìn)行毒性及類(lèi)藥性等評(píng)價(jià)。
  結(jié)果:1、用三維定量構(gòu)效關(guān)系方法對(duì)42個(gè)4-羥氨基α-吡喃酮甲酰胺類(lèi)似物進(jìn)行了研究,建立了可靠性和預(yù)測(cè)能力較高的QSAR模型(q2=0.569,r2=0.904,F(xiàn)值為2

3、0.756,SEE=0.135,=0.653,=0.955,SEEboot=0.091,=0.609,=0.680)。通過(guò)等勢(shì)圖分析了影響抑制劑活性的結(jié)構(gòu)特征,在此基礎(chǔ)上設(shè)計(jì)并篩選了103個(gè)具有抗丙型肝炎病毒活性的新型化合物結(jié)構(gòu),同時(shí)對(duì)化合物的活性進(jìn)行了預(yù)測(cè)。此外,利用計(jì)算軟件OSIRIS Property Explorer對(duì)40個(gè)活性較高的化合物結(jié)構(gòu)進(jìn)行了毒性及類(lèi)藥性等評(píng)價(jià)。通過(guò)綜合分析,2578號(hào)化合物為最優(yōu)結(jié)構(gòu)。
  2、基

4、于三維定量構(gòu)效關(guān)系和分子對(duì)接方法對(duì)48個(gè)HCV NS5B聚合酶抑制劑進(jìn)行了研究?;诨衔锝Y(jié)構(gòu)和活性構(gòu)建了QSAR模型,并對(duì)最優(yōu)模型進(jìn)行了驗(yàn)證(q2=0.627,r2=0.943,F(xiàn)值為86.182,SEE=0.221,=0.629,=0.975,SEEboot=0.141,=0.697,=0.835),結(jié)果說(shuō)明該模型具有可靠性和較高的預(yù)測(cè)能力。通過(guò)等勢(shì)圖和分子對(duì)接結(jié)果對(duì)影響抑制劑活性的結(jié)構(gòu)特征進(jìn)行分析,設(shè)計(jì)并篩選了136個(gè)具有抗丙型肝

5、炎病毒活性的新型化合物結(jié)構(gòu),同時(shí)對(duì)這些化合物的活性進(jìn)行預(yù)測(cè)。通過(guò)計(jì)算軟件OSIRIS Property Explorer對(duì)具有較高抑制活性的43個(gè)化合物結(jié)構(gòu)進(jìn)行了毒理性質(zhì)及類(lèi)藥性等評(píng)價(jià)。通過(guò)綜合分析,130號(hào)化合物為最優(yōu)結(jié)構(gòu)。
  結(jié)論:本論文中,三維定量構(gòu)效關(guān)系和分子對(duì)接等計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)方法的結(jié)合應(yīng)用,可對(duì)兩類(lèi)具有抗丙型肝炎病毒活性的化合物進(jìn)行較為系統(tǒng)的研究。通過(guò)分析影響化合物抑制活性的結(jié)構(gòu)特征,為設(shè)計(jì)具有抗丙型肝炎病毒活性

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