RNA干涉效應(yīng)分子siRNA分子特性的研究.pdf

1、　　RNA干涉是近年來(lái)發(fā)現(xiàn)的小片段雙鏈RNA分子能夠特異地沉默基因表達(dá)的現(xiàn)象,它被廣泛應(yīng)用于功能基因組的研究、疾病治療的研究、干細(xì)胞的研究及植物抗病毒等領(lǐng)域,各類型的實(shí)驗(yàn)室及研究機(jī)構(gòu)廣泛開展RNA干涉實(shí)驗(yàn)。RNA干涉實(shí)驗(yàn)首要的步驟是對(duì)候選的siRNA序列進(jìn)行篩選,但這一過(guò)程耗時(shí)、繁瑣。
　　為了使候選siRNA分子的篩選過(guò)程更加快捷及有效,利用統(tǒng)計(jì)學(xué)x~2檢驗(yàn)方法,分析已發(fā)表的高效沉默目的基因的siRNA分子,得到關(guān)于siRNA分

2、子的一些分子特性的信息：①siRNA21位點(diǎn)中第1、2、20和21位點(diǎn)A/T堿基頻率顯著高于G/C堿基頻率；②第3、4和6位點(diǎn)G/C堿基頻率顯著高于A/T堿基頻率：③5’端第2—7位G/C堿基含量大于3’端第15—19位點(diǎn)G/C堿基含量；④siRmA片段平均Tm值為31.2°C其可信區(qū)間為[25.1°C,37.3°C]。結(jié)合前人的研究成果,我們推測(cè)這些分子特性與RNA干涉發(fā)生過(guò)程中涉及的各種酶如Dicer酶、RISC復(fù)合體、RNA依賴的