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文檔簡介
1、目的:
將骨質(zhì)疏松癥和骨關(guān)節(jié)炎兩者在線粒體特征上的進行臨床對照研究,通過基因差異分析來進一步探討骨質(zhì)疏松癥和骨關(guān)節(jié)炎兩者所存在的相關(guān)性。
方法:
收集2015年3月至2015年12月在廣東省中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院脊柱骨科住院患者共12人的松質(zhì)骨標本,均符合診斷標準、納入標準、排除標準的骨質(zhì)疏松癥、骨關(guān)節(jié)炎、骨關(guān)節(jié)炎合并骨質(zhì)疏松癥及正常組者,中醫(yī)辯證為腎虛型。按照進入研究順序分為骨質(zhì)疏松癥組(OA組)、骨關(guān)節(jié)炎組(O
2、P)、骨質(zhì)疏松癥合并骨關(guān)節(jié)炎(OA&OP)及正常對照組(N)。通過收集各組患者手術(shù)中所取的松質(zhì)骨標本進行檢測,采用MeDIP-chip的技術(shù)策略,藉此比較各組線粒體基因表達譜的差異,并對差異基因進行初步分析。研究過程中對所有資料作詳細記錄并對其進行統(tǒng)計分析。
結(jié)果:
1.各組間年齡差異無統(tǒng)計學(xué)意義。經(jīng)過相關(guān)系數(shù)矩陣分析和DNA片段瓊脂糖凝膠電泳分析,標本具有較強的一致性,且DNA片段大小符合后續(xù)試驗要求。
3、2.正常對照組與OA組、OP組及OA&OP組相比,P<0.05,組間DNA甲基化水平有顯著差異,正常對照組的DNA甲基化水平明顯高于其他組。與OA&OP組相比較,OA組、OP組的甲基化水平均較OA&OP組高,P<0.05,差異有統(tǒng)計學(xué)意義。OA組與OP組的DNA甲基化平均水平相比,P>0.05,差異無顯著意義,兩組間的DNA甲基化平均水平相當。
3.在芯片結(jié)果中,根據(jù)OA組和OP組發(fā)生甲基化的基因進行對比,共篩選1222個甲基
4、化發(fā)生了高甲基化。進行GO和KEGG信號通路分析,發(fā)現(xiàn)這些差異基因幾乎涉及所有的主要生物學(xué)過程和信號通路。
4.對比各組在HCP和ICP上發(fā)生甲基化的基因,與正常對照組相比,OA組差異基因有644個,OP組差異基因有669個,OA&OP組差異基因有492個。對于同時滿足與OA&OP組、正常對照組有差異基因進行比對分析,發(fā)現(xiàn)OA組和OP組中有4個共同的差異基因(其中NIF3L1共同存在在HCP和ICP中),具體為:PPIL3、N
5、IF3L1、SMTN、CALHM2。
結(jié)論:
患有骨質(zhì)疏松癥和/或骨關(guān)節(jié)炎患者基因組甲基化水平低下。骨關(guān)節(jié)炎與骨質(zhì)疏松癥的共同差異體現(xiàn)在某些特定的啟動子上,這些基因幾乎涉及到所有生物學(xué)過程,為進一步探索相關(guān)效應(yīng)的分子調(diào)控機制奠定理論基礎(chǔ)。與OA&OP組、正常對照組有差異基因進行比對分析而發(fā)現(xiàn)的OA組和OP組中有4個共同的差異基因(PPIL3、NIF3L1、SMTN、CALHM2),可能通過不同的途徑參與到疾病的發(fā)生過
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