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文檔簡介
1、目的:腫瘤抑制基因BLU的表觀遺傳學(xué)沉默與多種惡性腫瘤的發(fā)生密切相關(guān),然而,BLU在胃癌中的表達(dá)及其生物學(xué)功能尚無相關(guān)報(bào)道。本研究旨在初步探討B(tài)LU基因在胃癌中的表達(dá)變化及其甲基化調(diào)控機(jī)制。
方法:(
1)用實(shí)時(shí)定量PCR(qRT-PCR)法檢測52例胃癌組織及對應(yīng)的癌旁組織、6株胃癌細(xì)胞(SGC7901, HGC27, BGC823, MKN45, MGC803,AGS)及胃黏膜正常上皮細(xì)胞GES-1中BLU mR
2、NA表達(dá)水平,Western blot法檢測7株細(xì)胞中BLU蛋白表達(dá)水平;
(2)采用Promoter Scan program軟件預(yù)測BLU核心啟動(dòng)子區(qū),并通過雙熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)進(jìn)行驗(yàn)證,采用TFSEARCH和Methyl Primer Express Software v1.0軟件預(yù)測BLU核心啟動(dòng)子區(qū)中可能有轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合的功能性CpG位點(diǎn);
?。?)重亞硫酸鹽測序PCR(BSP)法分析胃癌細(xì)胞和組織中BLU核
3、心啟動(dòng)子區(qū)CpG位點(diǎn)的甲基化程度,初步分析 DNA甲基化和 BLU基因表達(dá)的關(guān)系,找出潛在的功能性CpG位點(diǎn);
?。?)去甲基化藥物處理AGS和SGC7901細(xì)胞,qRT-PCR和Western blot法分析處理后BLU表達(dá)變化;
?。?)siRNA干擾Sp1表達(dá)及雙熒光報(bào)告基因?qū)嶒?yàn),分析BLU表達(dá)是否受轉(zhuǎn)錄因子Sp1調(diào)控;
?。?)在AGS和SGC7901細(xì)胞中,通過染色質(zhì)免疫共沉淀(ChIP)方法分析Sp1
4、能否與BLU啟動(dòng)子區(qū)結(jié)合,采用電泳遷移率實(shí)驗(yàn)(EMSA)及雙熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)分析SGC7901細(xì)胞中BLU-39CpG位點(diǎn)甲基化對Sp1結(jié)合能力的影響;
?。?)通過CCK-8實(shí)驗(yàn)及平板克隆形成實(shí)驗(yàn),研究BLU表達(dá)下調(diào)對胃癌細(xì)胞SGC7901增殖能力及克隆形成能力的影響。
結(jié)果:
(1)6株胃癌細(xì)胞中 BLU表達(dá)水平均顯著低于胃黏膜正常上皮細(xì)胞株GES-1,69.2%(36/52)的胃癌組織中BLU mR
5、NA表達(dá)明顯低于對應(yīng)癌旁組織,且胃癌組織臨床病理特征均與 BLU表達(dá)之間無顯著相關(guān)性;
?。?)BLU基因核心啟動(dòng)子區(qū)位于-181~+63bp,軟件預(yù)測出-85CpG和-39CpG是潛在的功能性CpG位點(diǎn);
(3)胃癌細(xì)胞和組織中BLU表達(dá)水平與其啟動(dòng)子區(qū)甲基化水平(尤其是-39CpG位點(diǎn)的甲基化)負(fù)相關(guān),提示-39CpG是潛在的功能性CpG位點(diǎn);
(4)去甲基化藥物處理AGS和SGC7901細(xì)胞后,BLU表
6、達(dá)出現(xiàn)不同程度的恢復(fù);
?。?)BLU轉(zhuǎn)錄受轉(zhuǎn)錄因子Sp1的激活;
?。?)Sp1結(jié)合于BLU近端啟動(dòng)子區(qū)(-43~35bp),且其結(jié)合位點(diǎn)“GC box”中-39CpG位點(diǎn)的甲基化可降低其結(jié)合能力,進(jìn)而阻礙BLU基因的轉(zhuǎn)錄及表達(dá);(7)通過siRNA干擾BLU的表達(dá)之后,SGC7901細(xì)胞的增殖能力和平板克隆形成能力顯著提高。
結(jié)論:
?。?)BLU基因在胃癌中的失活與其核心啟動(dòng)子(尤其是-39CpG
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